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原发性骨质疏松症相关核心基因的生物信息学分析
被引量:
5
1
作者
杨洋
薛建华
+3 位作者
虞俊波
顾琪琪
张亚峰
刘佳佳
《中国骨质疏松杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期397-402,共6页
目的分析与原发性骨质疏松症(osteoporosis,OP)发病相关的差异表达基因,筛选OP治疗潜在药物靶点。方法从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)下载OP相关芯片数据,利用R软件对数据进行标准化处理后,筛选差异基因,对差异基...
目的分析与原发性骨质疏松症(osteoporosis,OP)发病相关的差异表达基因,筛选OP治疗潜在药物靶点。方法从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)下载OP相关芯片数据,利用R软件对数据进行标准化处理后,筛选差异基因,对差异基因进行GO功能和KEGG通路富集分析、蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)分析和核心基因的筛选。结果共筛选出差异基因569个,其中下调基因562个,上调基因7个。同时差异基因GO分析,主要富集为前体mRNA内含子结合、核体、组蛋白修饰、mRNA 3’端加工和调控结合等,而KEGG分析主要涉及的是泛素介导蛋白水解信号通路(hsa04120)。PPI网络分析共有517个节点和363条连线。Cytoscape软件根据PPI分析数据筛选出了TCEB1、CUL2、KBTBD6、KBTBD7、ASB8、KLHL42、ASB5、FBXO11、ANAPC10、CDC23这10个核心基因,这些核心基因在OP患者股骨头组织的间充质干细胞中全部表达下调。结论筛选出的差异基因和相关信号通路有助于理解OP发病的分子机制,同时为临床药物治疗OP的研究提供新思路。
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关键词
原发性骨质疏松症
生物信息学
蛋白互作网络
核心基因
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职称材料
经皮椎间孔镜椎间盘切除术治疗2种特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症
被引量:
4
2
作者
姚羽
季佳伟
+4 位作者
朱为浩
陈文韬
陈瑞霖
张烽
杨洋
《中国微创外科杂志》
CSCD
北大核心
2023年第8期624-629,共6页
目的探讨经皮椎间孔镜椎间盘切除术治疗2种特殊类型脱垂型椎间盘突出症的短期疗效。方法2020年1月~2021年12月我科采用经皮椎间孔镜手术治疗7例单节段特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症(A型4例,为同侧“双根症状”,B型3例,为双侧“双根症状...
目的探讨经皮椎间孔镜椎间盘切除术治疗2种特殊类型脱垂型椎间盘突出症的短期疗效。方法2020年1月~2021年12月我科采用经皮椎间孔镜手术治疗7例单节段特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症(A型4例,为同侧“双根症状”,B型3例,为双侧“双根症状”),术中按照髓核脱垂分型,调整穿刺及椎间孔扩大成形的方向,并利用镜下环锯或动力系统来增大工作套筒头向或尾向角度,处理不同靶点目标。结果手术时间(75±16)min,术后住院时间(3.5±1.5)d。术后7例随访6~12个月,平均9个月。术前、术后、术后6个月及末次随访疼痛VAS评分分别为9(5,10)、2(1,4)、2(0,3)、2(0,3)分,与术前比较,术后各时间点VAS评分有明显改善(P<0.05);术后各时间点之间VAS评分差异均无统计学意义(P>0.05)。术前、术后、术后6个月及末次随访ODI分别为(62.1±7.6)%,(19.1±6.2)%,(12.9±8.1)%,(10.3±4.2)%,除术后6个月与末次随访差异无显著性外(P=1.000),其余时间点两两比较差异均有显著性(P<0.05)。末次随访MacNab标准优6例,良1例。结论经皮椎间孔镜技术治疗特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症可行,短期疗效满意。
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关键词
经皮椎间孔镜椎间盘切除术
腰椎间盘突出症
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职称材料
题名
原发性骨质疏松症相关核心基因的生物信息学分析
被引量:
5
1
作者
杨洋
薛建华
虞俊波
顾琪琪
张亚峰
刘佳佳
机构
南通大学附属医院创伤中心
南通
大学
附属
医院
骨科
出处
《中国骨质疏松杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期397-402,共6页
基金
国家自然科学基金(81501913)
南通市卫生健康委员会科研计划面上项目(MA2020023)。
文摘
目的分析与原发性骨质疏松症(osteoporosis,OP)发病相关的差异表达基因,筛选OP治疗潜在药物靶点。方法从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)下载OP相关芯片数据,利用R软件对数据进行标准化处理后,筛选差异基因,对差异基因进行GO功能和KEGG通路富集分析、蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)分析和核心基因的筛选。结果共筛选出差异基因569个,其中下调基因562个,上调基因7个。同时差异基因GO分析,主要富集为前体mRNA内含子结合、核体、组蛋白修饰、mRNA 3’端加工和调控结合等,而KEGG分析主要涉及的是泛素介导蛋白水解信号通路(hsa04120)。PPI网络分析共有517个节点和363条连线。Cytoscape软件根据PPI分析数据筛选出了TCEB1、CUL2、KBTBD6、KBTBD7、ASB8、KLHL42、ASB5、FBXO11、ANAPC10、CDC23这10个核心基因,这些核心基因在OP患者股骨头组织的间充质干细胞中全部表达下调。结论筛选出的差异基因和相关信号通路有助于理解OP发病的分子机制,同时为临床药物治疗OP的研究提供新思路。
关键词
原发性骨质疏松症
生物信息学
蛋白互作网络
核心基因
Keywords
osteoporosis
bioinformatics
protein-protein interaction network
Hub genes
分类号
R681.1 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
经皮椎间孔镜椎间盘切除术治疗2种特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症
被引量:
4
2
作者
姚羽
季佳伟
朱为浩
陈文韬
陈瑞霖
张烽
杨洋
机构
南通
大学
附属
医院
脊柱外科
南通
大学
医学院
南通大学附属医院创伤中心
出处
《中国微创外科杂志》
CSCD
北大核心
2023年第8期624-629,共6页
基金
江苏省重点研发计划社会发展项目(BE2017681)
南通市社会民生科技计划-面上项目(MS12021090)
南通市卫生健康委员会面上项目(MA2020023)。
文摘
目的探讨经皮椎间孔镜椎间盘切除术治疗2种特殊类型脱垂型椎间盘突出症的短期疗效。方法2020年1月~2021年12月我科采用经皮椎间孔镜手术治疗7例单节段特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症(A型4例,为同侧“双根症状”,B型3例,为双侧“双根症状”),术中按照髓核脱垂分型,调整穿刺及椎间孔扩大成形的方向,并利用镜下环锯或动力系统来增大工作套筒头向或尾向角度,处理不同靶点目标。结果手术时间(75±16)min,术后住院时间(3.5±1.5)d。术后7例随访6~12个月,平均9个月。术前、术后、术后6个月及末次随访疼痛VAS评分分别为9(5,10)、2(1,4)、2(0,3)、2(0,3)分,与术前比较,术后各时间点VAS评分有明显改善(P<0.05);术后各时间点之间VAS评分差异均无统计学意义(P>0.05)。术前、术后、术后6个月及末次随访ODI分别为(62.1±7.6)%,(19.1±6.2)%,(12.9±8.1)%,(10.3±4.2)%,除术后6个月与末次随访差异无显著性外(P=1.000),其余时间点两两比较差异均有显著性(P<0.05)。末次随访MacNab标准优6例,良1例。结论经皮椎间孔镜技术治疗特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症可行,短期疗效满意。
关键词
经皮椎间孔镜椎间盘切除术
腰椎间盘突出症
分类号
R687.3 [医药卫生—骨科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
原发性骨质疏松症相关核心基因的生物信息学分析
杨洋
薛建华
虞俊波
顾琪琪
张亚峰
刘佳佳
《中国骨质疏松杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
5
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
经皮椎间孔镜椎间盘切除术治疗2种特殊类型脱垂型腰椎间盘突出症
姚羽
季佳伟
朱为浩
陈文韬
陈瑞霖
张烽
杨洋
《中国微创外科杂志》
CSCD
北大核心
2023
4
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