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基于生物信息学分析SLC16A基因家族在低级别胶质瘤发生发展中的作用及预后价值
1
作者
任冰焱
叶涵斌
+2 位作者
杨娇娇
李亦凡
朱保锋
《中国医药科学》
2024年第8期152-155,共4页
目的利用生物信息学分析溶质运载体16A(SLC16A)基因家族在低级别胶质瘤(LGG)发生发展中的作用及预后价值。方法使用ONCOMINE、GEPIA、HPA、TCGA、LinkedOmics、GSEA、TIMER等公共数据库研究SLC16A基因家族在LGG中的mRNA表达谱,筛选出差...
目的利用生物信息学分析溶质运载体16A(SLC16A)基因家族在低级别胶质瘤(LGG)发生发展中的作用及预后价值。方法使用ONCOMINE、GEPIA、HPA、TCGA、LinkedOmics、GSEA、TIMER等公共数据库研究SLC16A基因家族在LGG中的mRNA表达谱,筛选出差异性表达并影响LGG预后的基因,全面分析其在LGG发生发展中的作用机制、诊断和预后价值。结果LGG中SLC16A1、SLC16A3、SLC16A4表达水平高于正常脑组织,且随着肿瘤分期的增长而上升,高表达组总生存期(OS)和无病生存期(DFS)较短。LGG细胞质和细胞膜中可见大量SLC16A1、SLC16A3和SLC16A4蛋白表达。这三种基因与炎症反应、免疫细胞浸润显著相关。结论SLC16A1、SLC16A3和SLC16A4可作为LGG的潜在诊断和预后生物标志物,并通过免疫调控和炎性微环境参与LGG的发生发展。
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关键词
溶质运载体16A
生物标志物
低级别胶质瘤
生物信息学
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题名
基于生物信息学分析SLC16A基因家族在低级别胶质瘤发生发展中的作用及预后价值
1
作者
任冰焱
叶涵斌
杨娇娇
李亦凡
朱保锋
机构
南通
大学
第二
附属
医院
南通市
第一
人民医院
急诊科
南通大学第二附属医院南通市第一人民医院神经外科
出处
《中国医药科学》
2024年第8期152-155,共4页
基金
江苏省南通市卫生健康委科研课题(QN2023009)。
文摘
目的利用生物信息学分析溶质运载体16A(SLC16A)基因家族在低级别胶质瘤(LGG)发生发展中的作用及预后价值。方法使用ONCOMINE、GEPIA、HPA、TCGA、LinkedOmics、GSEA、TIMER等公共数据库研究SLC16A基因家族在LGG中的mRNA表达谱,筛选出差异性表达并影响LGG预后的基因,全面分析其在LGG发生发展中的作用机制、诊断和预后价值。结果LGG中SLC16A1、SLC16A3、SLC16A4表达水平高于正常脑组织,且随着肿瘤分期的增长而上升,高表达组总生存期(OS)和无病生存期(DFS)较短。LGG细胞质和细胞膜中可见大量SLC16A1、SLC16A3和SLC16A4蛋白表达。这三种基因与炎症反应、免疫细胞浸润显著相关。结论SLC16A1、SLC16A3和SLC16A4可作为LGG的潜在诊断和预后生物标志物,并通过免疫调控和炎性微环境参与LGG的发生发展。
关键词
溶质运载体16A
生物标志物
低级别胶质瘤
生物信息学
Keywords
SLC16A
Biomarkers
Low-grade gliomas
Bioinformatics
分类号
R739.4 [医药卫生—肿瘤]
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被引量
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1
基于生物信息学分析SLC16A基因家族在低级别胶质瘤发生发展中的作用及预后价值
任冰焱
叶涵斌
杨娇娇
李亦凡
朱保锋
《中国医药科学》
2024
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