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前列腺癌基因外显子区突变位点筛查及与前列腺癌易感性的关系
被引量:
2
1
作者
糜远源
吴升
祝黎洁
《山东医药》
CAS
北大核心
2017年第19期77-80,共4页
目的筛查前列腺癌(PCA)基因外显子区的突变位点,并分析其与PCA易感性的关系。方法 6例PCA患者,留取PCA组织和癌旁正常组织标本。采用液相杂交捕获技术分析PCA、癌旁正常组织全基因外显子区的单核苷酸多态性(SNPs),采用Illumina Hi Seq 2...
目的筛查前列腺癌(PCA)基因外显子区的突变位点,并分析其与PCA易感性的关系。方法 6例PCA患者,留取PCA组织和癌旁正常组织标本。采用液相杂交捕获技术分析PCA、癌旁正常组织全基因外显子区的单核苷酸多态性(SNPs),采用Illumina Hi Seq 2000平台高通量测序将捕获富集并验证的PCA、癌旁正常组织基因外显子区SNPs的DNA文库进行突变位点比对,筛选PCA基因外显子区突变位点。采用bwa软件与参考基因组hg19作比对,分析PCA外显子区功能性突变位点的生物信息学信息,分析功能性突变位点与PCA易感性的关系。结果共发现4个未报道的功能性SNPs突变位点,分别为BRCA1 rs16941、MET rs45483396、P53 rs121912655、COPB2 rs7374710。进一步通过临床样本检测结果显示,BRCA1 rs16941与COPB2 rs7374710两个SNP不仅均与PCA易感性相关(OR分别为1.47,1.27;95%CI分别为1.14~1.72;1.20~1.41),而且与PCA患者PSA值及Gleason评分均呈正相关(OR分别为1.25,1.37;95%CI=1.10~1.84,1.20~2.34;P均<0.01)。结论 PCA外显子区存在BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710功能性突变位点,携带有BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710突变位点的个体罹患PCA的可能性较高。
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关键词
前列腺肿瘤
前列腺癌
液相杂交捕获技术
基因突变
外显子
单核苷酸多态性
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职称材料
题名
前列腺癌基因外显子区突变位点筛查及与前列腺癌易感性的关系
被引量:
2
1
作者
糜远源
吴升
祝黎洁
机构
南通大学第三附属医院暨无锡市第三人民医院
出处
《山东医药》
CAS
北大核心
2017年第19期77-80,共4页
基金
无锡市医院管理中心医学科研联合攻关项目(YGZXL1203
YGZXL 1318)
无锡市科技发展资金(CSE31N1605)
文摘
目的筛查前列腺癌(PCA)基因外显子区的突变位点,并分析其与PCA易感性的关系。方法 6例PCA患者,留取PCA组织和癌旁正常组织标本。采用液相杂交捕获技术分析PCA、癌旁正常组织全基因外显子区的单核苷酸多态性(SNPs),采用Illumina Hi Seq 2000平台高通量测序将捕获富集并验证的PCA、癌旁正常组织基因外显子区SNPs的DNA文库进行突变位点比对,筛选PCA基因外显子区突变位点。采用bwa软件与参考基因组hg19作比对,分析PCA外显子区功能性突变位点的生物信息学信息,分析功能性突变位点与PCA易感性的关系。结果共发现4个未报道的功能性SNPs突变位点,分别为BRCA1 rs16941、MET rs45483396、P53 rs121912655、COPB2 rs7374710。进一步通过临床样本检测结果显示,BRCA1 rs16941与COPB2 rs7374710两个SNP不仅均与PCA易感性相关(OR分别为1.47,1.27;95%CI分别为1.14~1.72;1.20~1.41),而且与PCA患者PSA值及Gleason评分均呈正相关(OR分别为1.25,1.37;95%CI=1.10~1.84,1.20~2.34;P均<0.01)。结论 PCA外显子区存在BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710功能性突变位点,携带有BRCA1 rs16941、COPB2 rs7374710突变位点的个体罹患PCA的可能性较高。
关键词
前列腺肿瘤
前列腺癌
液相杂交捕获技术
基因突变
外显子
单核苷酸多态性
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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1
前列腺癌基因外显子区突变位点筛查及与前列腺癌易感性的关系
糜远源
吴升
祝黎洁
《山东医药》
CAS
北大核心
2017
2
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