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旱柳NAC基因家族的全基因组鉴定及其在淹水和盐胁迫下的表达分析
被引量：
1
1
作者
钱超楠
徐孙然
+6 位作者
李梦茹
邓明超
孙硕
刘国元
连博琳
张健
陈艳红
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期3056-3070,共15页
【目的】对旱柳(Salix matsudana)NAC基因家族成员进行鉴定,并分析其在淹水胁迫和盐胁迫下的表达差异,为研究SmNAC家族成员参与逆境胁迫调控机制及培育高耐非生物胁迫旱柳品种提供理论基础。【方法】以敏淹旱柳品种Yanliu No.1、耐淹旱...
【目的】对旱柳(Salix matsudana)NAC基因家族成员进行鉴定,并分析其在淹水胁迫和盐胁迫下的表达差异,为研究SmNAC家族成员参与逆境胁迫调控机制及培育高耐非生物胁迫旱柳品种提供理论基础。【方法】以敏淹旱柳品种Yanliu No.1、耐淹旱柳品种Suliu 795和敏盐旱柳种质Yanjiang和耐盐旱柳品种9901等4份旱柳种质为试验材料,通过基因组数据挖掘鉴定出旱柳全基因组范围内的NAC基因家族成员,并对其蛋白理化性质、保守基序、系统发育关系、基因结构及其染色体位置、共线性关系进行预测分析。对SmNAC基因家族成员进行淹水胁迫和盐胁迫下的表达谱分析;选取对淹水胁迫和盐胁迫均具有明显响应的基因构建拟南芥过表达载体并获取转基因拟南芥,通过实时荧光定量PCR检测该基因在野生型和转基因拟南芥中的相对表达量,并分析转基因拟南芥和野生型拟南芥在淹水胁迫下的表型差异,测定其生理指标。【结果】鉴定出290个SmNAC基因家族成员,命名为SmNAC001~SmNAC290;SmNAC家族基因编码的氨基酸数量范围为105~710个,分子量为12.7~77.8 kD,理论等电点(pI)为4.33~9.65,大多数蛋白成员定位于细胞核。根据SmNAC家族蛋白与拟南芥NAC蛋白的系统发育进化关系及其保守基序分析结果,将SmNAC家族蛋白分为16个亚家族。大部分SmNAC家族基因中含有3个外显子,同一亚家族内的SmNAC成员基序组成和排列模式相似,如NAP和OsNAC7亚家族。大部分SmNAC家族基因成员启动子含有茉莉酸甲酯以及缺氧胁迫等响应元件。SmNAC基因家族中有244个基因随机分布在38条染色体上,其中存在13对串联复制事件。转录组数据结果显示,淹水胁迫和盐胁迫后,ATAF亚家族(SmNAC007、SmNAC008、SmNAC009、SmNAC010、SmNAC011和SmNAC012基因)表达量在不同抗性旱柳种质中均明显上调。实时荧光定量PCR结果显示,转基因拟南芥中SmNAC007基因的相对表达量明显高于野生型,为10~15倍;与野生型拟南芥相比,转基因拟南芥中总蛋白含量显著降低(P<0.05)。【结论】鉴定出290个SmNAC基因家族成员,其中分别有102个和151个家族成员在淹水胁迫和盐胁迫中差异表达;初步证实SmNAC007基因在淹水胁迫响应中发挥正向调控功能。
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关键词
旱柳
NAC基因家族
盐胁迫
淹水胁迫
SmNAC007基因
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职称材料
雀舌罗汉松与大叶罗汉松光合能力的比较
被引量：
1
2
作者
张琦
唐志璇
+9 位作者
储歆彤
罗春影
姚彬
张健
陈艳红
余春梅
钟非
魏辉
连博琳
刘国元
《现代农业科技》
2023年第12期117-119,128,共4页
雀舌罗汉松是南通地区最具代表性的盆景素材,然而其生长缓慢、繁殖数量少,极大地限制了雀舌罗汉松产业的规模化发展。本研究采用光合-荧光测量仪对雀舌罗汉松和大叶罗汉松在不同CO_(2)浓度和光强下的光合能力进行了测量和分析。结果表明...
雀舌罗汉松是南通地区最具代表性的盆景素材,然而其生长缓慢、繁殖数量少,极大地限制了雀舌罗汉松产业的规模化发展。本研究采用光合-荧光测量仪对雀舌罗汉松和大叶罗汉松在不同CO_(2)浓度和光强下的光合能力进行了测量和分析。结果表明,雀舌罗汉松虽然具有更低的CO_(2)补偿点和更高的CO_(2)饱和点,但是电子传递效率低于大叶罗汉松。光合-光强试验结果表明,雀舌罗汉松的光补偿点和光饱和点都高于大叶罗汉松,强光下两者的最大净光合速率基本一致。气孔导度分析结果表明,相同光照强度下,雀舌罗汉松的气孔导度小于大叶罗汉松,不利于气体交换。本研究从CO_(2)浓度、光强的角度分析了雀舌罗汉松和大叶罗汉松光合能力的差异,并提出了适宜雀舌罗汉松快速生长的条件,以期为进一步规范雀舌罗汉松的种植,推进雀舌罗汉松产业规模化发展提供参考。
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关键词
雀舌罗汉松
大叶罗汉松
CO_(2)浓度
光强
光合速率
气孔导度
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职称材料
题名
旱柳NAC基因家族的全基因组鉴定及其在淹水和盐胁迫下的表达分析
被引量：
1
1
作者
钱超楠
徐孙然
李梦茹
邓明超
孙硕
刘国元
连博琳
张健
陈艳红
机构
南通大学生命科学学院/南通市观赏植物遗传育种重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期3056-3070,共15页
基金
国家自然科学基金项目(31971681)
江苏省重点研发计划项目(BE2022420)
+1 种基金
南通市社会民生项目(MS12022028)
江苏省大学生创新创业训练计划项目(202410304108Y)。
文摘
【目的】对旱柳(Salix matsudana)NAC基因家族成员进行鉴定,并分析其在淹水胁迫和盐胁迫下的表达差异,为研究SmNAC家族成员参与逆境胁迫调控机制及培育高耐非生物胁迫旱柳品种提供理论基础。【方法】以敏淹旱柳品种Yanliu No.1、耐淹旱柳品种Suliu 795和敏盐旱柳种质Yanjiang和耐盐旱柳品种9901等4份旱柳种质为试验材料,通过基因组数据挖掘鉴定出旱柳全基因组范围内的NAC基因家族成员,并对其蛋白理化性质、保守基序、系统发育关系、基因结构及其染色体位置、共线性关系进行预测分析。对SmNAC基因家族成员进行淹水胁迫和盐胁迫下的表达谱分析;选取对淹水胁迫和盐胁迫均具有明显响应的基因构建拟南芥过表达载体并获取转基因拟南芥,通过实时荧光定量PCR检测该基因在野生型和转基因拟南芥中的相对表达量,并分析转基因拟南芥和野生型拟南芥在淹水胁迫下的表型差异,测定其生理指标。【结果】鉴定出290个SmNAC基因家族成员,命名为SmNAC001~SmNAC290;SmNAC家族基因编码的氨基酸数量范围为105~710个,分子量为12.7~77.8 kD,理论等电点(pI)为4.33~9.65,大多数蛋白成员定位于细胞核。根据SmNAC家族蛋白与拟南芥NAC蛋白的系统发育进化关系及其保守基序分析结果,将SmNAC家族蛋白分为16个亚家族。大部分SmNAC家族基因中含有3个外显子,同一亚家族内的SmNAC成员基序组成和排列模式相似,如NAP和OsNAC7亚家族。大部分SmNAC家族基因成员启动子含有茉莉酸甲酯以及缺氧胁迫等响应元件。SmNAC基因家族中有244个基因随机分布在38条染色体上,其中存在13对串联复制事件。转录组数据结果显示,淹水胁迫和盐胁迫后,ATAF亚家族(SmNAC007、SmNAC008、SmNAC009、SmNAC010、SmNAC011和SmNAC012基因)表达量在不同抗性旱柳种质中均明显上调。实时荧光定量PCR结果显示,转基因拟南芥中SmNAC007基因的相对表达量明显高于野生型,为10~15倍;与野生型拟南芥相比,转基因拟南芥中总蛋白含量显著降低(P<0.05)。【结论】鉴定出290个SmNAC基因家族成员,其中分别有102个和151个家族成员在淹水胁迫和盐胁迫中差异表达;初步证实SmNAC007基因在淹水胁迫响应中发挥正向调控功能。
关键词
旱柳
NAC基因家族
盐胁迫
淹水胁迫
SmNAC007基因
Keywords
Salix matsudana
NAC gene family
salt stress
flooding stress
SmNAC007 gene
分类号
S687.101 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
雀舌罗汉松与大叶罗汉松光合能力的比较
被引量：
1
2
作者
张琦
唐志璇
储歆彤
罗春影
姚彬
张健
陈艳红
余春梅
钟非
魏辉
连博琳
刘国元
机构
南通大学生命科学学院/南通市观赏植物遗传育种重点实验室
如皋市万禾花木生态园
出处
《现代农业科技》
2023年第12期117-119,128,共4页
基金
江苏省林业科技创新与推广项目(LYKJ[2021]11)。
文摘
雀舌罗汉松是南通地区最具代表性的盆景素材,然而其生长缓慢、繁殖数量少,极大地限制了雀舌罗汉松产业的规模化发展。本研究采用光合-荧光测量仪对雀舌罗汉松和大叶罗汉松在不同CO_(2)浓度和光强下的光合能力进行了测量和分析。结果表明,雀舌罗汉松虽然具有更低的CO_(2)补偿点和更高的CO_(2)饱和点,但是电子传递效率低于大叶罗汉松。光合-光强试验结果表明,雀舌罗汉松的光补偿点和光饱和点都高于大叶罗汉松,强光下两者的最大净光合速率基本一致。气孔导度分析结果表明,相同光照强度下,雀舌罗汉松的气孔导度小于大叶罗汉松,不利于气体交换。本研究从CO_(2)浓度、光强的角度分析了雀舌罗汉松和大叶罗汉松光合能力的差异,并提出了适宜雀舌罗汉松快速生长的条件,以期为进一步规范雀舌罗汉松的种植,推进雀舌罗汉松产业规模化发展提供参考。
关键词
雀舌罗汉松
大叶罗汉松
CO_(2)浓度
光强
光合速率
气孔导度
分类号
S688.1 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
旱柳NAC基因家族的全基因组鉴定及其在淹水和盐胁迫下的表达分析
钱超楠
徐孙然
李梦茹
邓明超
孙硕
刘国元
连博琳
张健
陈艳红
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
1
在线阅读
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职称材料
2
雀舌罗汉松与大叶罗汉松光合能力的比较
张琦
唐志璇
储歆彤
罗春影
姚彬
张健
陈艳红
余春梅
钟非
魏辉
连博琳
刘国元
《现代农业科技》
2023
1
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已选择
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