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MicroRNA-27b的生物学功能研究进展 被引量:1
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作者 吕蕾 朱丹丹 段义农 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2016年第10期1704-1706,共3页
Micro RNAs(mi RNAs)是一类约22个核苷酸长度的非编码RNAs,在物种之间具有高度的保守性。成熟mi RNAs为单链,能与靶基因3′-UTR区域结合诱导该靶基因m RNA降解,抑制靶基因表达,参与调节细胞生长、分化、衰老、凋亡等过程。
关键词 肿瘤血管生成 基因表达 保守性 细胞生长 MicroRNA-27b 细胞增殖 PPAR 宫颈癌细胞 脂肪细胞分化 RNA
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基于生信分析对脓毒症相关性脑病中神经炎症相关核心基因的筛选
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作者 苏思璇 尚彦星 +2 位作者 段程伟 梁彩霞 张冬梅 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第7期915-926,共12页
目的:通过生信分析筛选脓毒症相关性脑病(sepsis associated encephalopathy,SAE)中小胶质细胞介导神经炎症的核心基因,并通过体外细胞学实验验证。方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中获取脓毒症患者外周血全转... 目的:通过生信分析筛选脓毒症相关性脑病(sepsis associated encephalopathy,SAE)中小胶质细胞介导神经炎症的核心基因,并通过体外细胞学实验验证。方法:从基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)中获取脓毒症患者外周血全转录组测序数据集GSE65682以及体外脂多糖(lipopolysaccharides,LPS)诱导小胶质细胞活化模型基因芯片数据集GSE103156。采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)筛选GSE65682数据集中与脓毒症临床诊断显著相关的模块,与GSE103156数据集中LPS处理前后小胶质细胞的差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)相交,利用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)对DEG进行功能富集分析。采用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、Cytoscape以及Lasso回归分析筛选核心基因。构建LPS诱导BV2小胶质细胞活化体外细胞模型,采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)检测基因表达;采用慢病毒载体法过表达组蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9,HDAC9),Western blot检测炎症相关分子表达。结果:WGCNA分析得到GSE65682数据集中与脓毒症临床诊断相关的9个模块、共332个基因,通过Limma分析得到GSE103156数据集中LPS刺激前后小胶质细胞的1 272个DEGs,二者取交集后得到18个交集基因,进一步采用Lasso回归分析筛选得到4个枢纽基因分别为七跨膜G蛋白偶联受体183(G protein-coupled receptor 183,GPR183)、HDAC9、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸激酶(nicotinamide adenine dinucleotide kinase,NADK)、富含亮氨酸重复蛋白25(leucine rich repeat containing 25,LRRC25)。RT-qPCR结果证实在LPS刺激的小胶质细胞炎性活化模型中,Gpr183和Hdac9基因的m RNA表达下调、Lrrc25表达上调,而Nadk表达无明显变化;Western blot显示过表达HDAC9可促进LPS诱导小胶质细胞促炎因子白介素(interleukin,IL)-1β、诱导型一氧化氮合酶(inducible nitric oxide synthase,iNOS)的表达、促进JAK1-STAT3磷酸化。结论:本研究利用生物信息学筛选得到SAE中小胶质细胞介导神经炎症的4个关键基因,并初步证实HDAC9对于小胶质细胞具有促炎活性,为SAE的机制研究提供了新的思路和数据。 展开更多
关键词 脓毒症相关性脑病 小胶质细胞 生信分析 差异基因 核心基因
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日本血吸虫T2核酸酶的原核表达及活性分析 被引量:1
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作者 冯金荣 朱丹丹 +3 位作者 秦永伟 孙伟 庄重 段义农 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1039-1043,共5页
目的构建日本血吸虫T2核酸酶表达载体,并进行体外表达和酶活性分析。方法从日本血吸虫基因组数据库中找到与曼氏血吸虫虫卵抗原Omega-1同源性最高的蛋白AY814845,设计引物并通过PCR技术扩增得到该基因,将其成熟编码区连入pET32a表达载体... 目的构建日本血吸虫T2核酸酶表达载体,并进行体外表达和酶活性分析。方法从日本血吸虫基因组数据库中找到与曼氏血吸虫虫卵抗原Omega-1同源性最高的蛋白AY814845,设计引物并通过PCR技术扩增得到该基因,将其成熟编码区连入pET32a表达载体,转化大肠杆菌并用IPTG诱导其表达,最后对表达产物的核酸酶活性进行分析。结果成功的构建了日本血吸虫T2核酸酶的表达载体,其编码区能够在大肠杆菌中表达,且表达产物具有一定的核酸酶活性。结论从体外扩增了日本血吸虫T2核酸酶AY814845,明确其表达产物具有核酸酶活性,为今后深入研究该蛋白的功能打下了基础。 展开更多
关键词 日本血吸虫 T2核酸酶 虫卵抗原 AY14845 克隆 表达 活性分析
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肝星状细胞在逆转肝纤维化中的作用 被引量:7
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作者 徐天华 陈金铃 +2 位作者 朱丹丹 吕蕾 段义农 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1065-1068,1074,共5页
肝纤维化是一种能够导致门静脉高压、肝硬化、肝衰竭的严重疾病。已经发现肝星状细胞的活化是引起肝纤维化的中心环节,因此抑制肝星状细胞的活化、加速肝星状细胞的清除有望逆转肝纤维化。本文将对活化的肝星状细胞的凋亡、衰老以及清... 肝纤维化是一种能够导致门静脉高压、肝硬化、肝衰竭的严重疾病。已经发现肝星状细胞的活化是引起肝纤维化的中心环节,因此抑制肝星状细胞的活化、加速肝星状细胞的清除有望逆转肝纤维化。本文将对活化的肝星状细胞的凋亡、衰老以及清除的研究进展作综述,阐明肝星状细胞在肝纤维化过程中所起的作用及相关机制。 展开更多
关键词 肝纤维化逆转 肝星状细胞 凋亡 衰老
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Ⅲ型干扰素抵抗寨卡病毒感染导致不良妊娠的机制
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作者 王晶晶 曹阳青 陈金铃 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期153-157,共5页
寨卡病毒是一种蚊媒黄病毒,妊娠早期妇女感染寨卡病毒可引起新生儿小头畸形、胎儿宫内发育迟缓及胎儿自发性流产等不良妊娠。人胎盘原代滋养细胞分泌的Ⅲ型干扰素及Ⅲ型干扰素诱导产生的干扰素刺激基因可在细胞中建立抗病毒状态,保护胎... 寨卡病毒是一种蚊媒黄病毒,妊娠早期妇女感染寨卡病毒可引起新生儿小头畸形、胎儿宫内发育迟缓及胎儿自发性流产等不良妊娠。人胎盘原代滋养细胞分泌的Ⅲ型干扰素及Ⅲ型干扰素诱导产生的干扰素刺激基因可在细胞中建立抗病毒状态,保护胎儿免受寨卡病毒的感染。Ⅲ型干扰素对寨卡病毒导致的不良妊娠保护作用具有阶段特异性,对妊娠早期没有保护作用。本文就寨卡病毒导致不良妊娠和Ⅲ型干扰素抵抗寨卡病毒感染等方面的机制研究进行综述,为深入了解寨卡病毒致病机制和免疫预防提供参考。 展开更多
关键词 寨卡病毒 Ⅲ型干扰素 不良妊娠 小头畸形
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