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江西省3个地方鸡种遗传多样性分析
被引量:
7
1
作者
谭玉文
饶友生
+4 位作者
刘慧琳
肖月玲
徐霞
陈颖
朱学农
《河南农业科学》
北大核心
2020年第1期137-141,共5页
为探究江西省3个地方鸡种的遗传多样性,为江西省家禽群体遗传资源的合理利用和种质资源保护提供依据,利用飞行质谱分型技术对宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡3个群体(463只个体)1号染色体上的25个单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因型分型...
为探究江西省3个地方鸡种的遗传多样性,为江西省家禽群体遗传资源的合理利用和种质资源保护提供依据,利用飞行质谱分型技术对宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡3个群体(463只个体)1号染色体上的25个单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因型分型,计算每个SNP位点的等位基因频率、表观杂合度、期望杂合度、多态信息含量及群体间Nei氏标准遗传距离。结果显示,所有位点在3个群体中的平均有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量分别为1.636、0.367和0.291,其中白耳黄鸡的平均有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量最高(1.684、0.387和0.303),安义瓦灰鸡最低(1.562、0.328和0.262)。遗传距离和系统聚类结果显示,3个群体的遗传相似性都比较高,安义瓦灰鸡和白耳黄鸡2个群体聚为一类,宁都黄鸡单独聚为一类。
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关键词
地方鸡种
飞行质谱
遗传多样性
种质资源
单核苷酸多态性
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职称材料
宁都黄鸡生化指标与体重的相关性研究
2
作者
马家玉
罗雯
+2 位作者
艾佐佐
李丽群
林丽珍
《安徽农业科学》
CAS
2020年第11期116-118,共3页
[目的]以宁都黄鸡为试验对象,分析宁都黄鸡血清营养物质含量和血清免疫活性物质及盲肠消化酶活性与体重的相关性。[方法]选取健康状态良好的雄性宁都黄鸡150羽,散养条件下饲养至72日龄,按照体重由高到低分为较重组、中等组和较轻组。每...
[目的]以宁都黄鸡为试验对象,分析宁都黄鸡血清营养物质含量和血清免疫活性物质及盲肠消化酶活性与体重的相关性。[方法]选取健康状态良好的雄性宁都黄鸡150羽,散养条件下饲养至72日龄,按照体重由高到低分为较重组、中等组和较轻组。每组随机抽取样本10只,当日屠宰取血、静置并离心取血清,解剖后无菌取盲肠段内容物,以上样品置于-70℃冰箱中保存。血清总蛋白含量采用双缩脲常规法检测;血清白蛋白含量采用溴甲酚绿法检测;血清葡萄糖含量采用邻甲苯胺法检测,血清总胆固醇和甘油三酯含量采用GPO-PAP法测定;血清超氧化物歧化酶活性采用羟胺法测定;过氧化氢酶活性采用钼酸铵法测定;血清谷胱甘肽过氧化物酶和盲肠脂肪酶、胰蛋白酶活性均采用比色法测定;盲肠α淀粉酶活性采用淀粉-碘显色法测定。[结果]各体重组甘油三酯含量以及过氧化氢酶、总超氧化物歧化酶、胰蛋白酶和α淀粉酶活性均无显著差异,各生化指标与体重无相关性;各体重组总胆固醇含量和脂肪酶活性无显著差异,但与体重分别呈极显著正相关(P<0.01)和显著负相关(P<0.05);各体重组谷胱甘肽过氧化物酶活性存在极显著差异(P<0.01),且与体重呈极显著负相关。[结论]该研究结果对宁都黄鸡饲料中营养的合理配比及外源性消化酶的适时添加具有一定的指导作用。
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关键词
宁都黄鸡
体重
免疫活性物质
消化酶
相关性
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职称材料
文昌鸡白麻羽性状与SLC45A2多态性关系
被引量:
4
3
作者
何艺平
陈杰
+1 位作者
高鑫凤
许继国
《广东农业科学》
CAS
2019年第10期99-103,共5页
【目的】研究文昌鸡白麻羽性状的遗传规律,鉴定与白麻羽性状相关的基因变异,为文昌鸡白麻羽群体的利用以及白麻羽性状的分子标记辅助选择提供参考。【方法】利用正反交试验探索白麻羽性状的遗传规律;根据白麻羽性状的特点结合前人研究结...
【目的】研究文昌鸡白麻羽性状的遗传规律,鉴定与白麻羽性状相关的基因变异,为文昌鸡白麻羽群体的利用以及白麻羽性状的分子标记辅助选择提供参考。【方法】利用正反交试验探索白麻羽性状的遗传规律;根据白麻羽性状的特点结合前人研究结果,选取SLC45A2基因为候选基因,利用重测序的方法筛选外显子区域内的变异;并重点验证外显子区域的错义突变和无义突变与白麻羽性状的关系。【结果】黄麻羽个体与白麻羽个体正反交试验结果表明,白麻羽性状相对于黄麻羽呈伴性隐性遗传。试验以白麻羽和黄麻个体为DNA模板,扩增了SLC45A2上的7个外显子区域,结果共筛选到5个SNP,其中3个位于外显子上,2个为错义突变(c.a74g和c.g1154c),1个为同义突变(c.c561t)。以文昌鸡白麻羽群体的文昌鸡和非白麻羽性状的文昌鸡、霸王山鸡、清远麻鸡、杏花鸡、红色原鸡为材料,验证上述错义突变,结果显示c.g1154c位点与白麻羽性状完全连锁。【结论】白麻羽性状呈现伴性隐性遗传,c.g1154c可能是白麻羽性状的致因突变。
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关键词
文昌鸡
白麻羽
SLC45A2基因
银色羽基因座
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职称材料
沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析
4
作者
杨艳北
许晶
+2 位作者
李袁飞
贡继尚
饶友生
《江苏农业科学》
北大核心
2021年第6期40-45,共6页
LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构...
LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测,为后续研究生物被膜形成机制奠定基础,也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路。结果表明:LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白;定位在细菌的细胞质中;无信号肽结构,推断其为非分泌性蛋白;二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件;α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义;含有5个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸,其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸;无跨膜结构域,推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白;LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统,含有2个保守结构域,分别为Autoind_bind和HTH_LUXR,该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用。
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关键词
沼泽红假单胞菌
LUXR
生物信息学
生物被膜
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职称材料
题名
江西省3个地方鸡种遗传多样性分析
被引量:
7
1
作者
谭玉文
饶友生
刘慧琳
肖月玲
徐霞
陈颖
朱学农
机构
南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室
城南中学
江西省
南城县第一中学
出处
《河南农业科学》
北大核心
2020年第1期137-141,共5页
基金
江西省自然科学基金项目(20161BAB214155)
江西省教育厅项目(GJJ171123,GJJ171124)
南昌师范学院“11531”工程建设项目
文摘
为探究江西省3个地方鸡种的遗传多样性,为江西省家禽群体遗传资源的合理利用和种质资源保护提供依据,利用飞行质谱分型技术对宁都黄鸡、白耳黄鸡、安义瓦灰鸡3个群体(463只个体)1号染色体上的25个单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因型分型,计算每个SNP位点的等位基因频率、表观杂合度、期望杂合度、多态信息含量及群体间Nei氏标准遗传距离。结果显示,所有位点在3个群体中的平均有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量分别为1.636、0.367和0.291,其中白耳黄鸡的平均有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量最高(1.684、0.387和0.303),安义瓦灰鸡最低(1.562、0.328和0.262)。遗传距离和系统聚类结果显示,3个群体的遗传相似性都比较高,安义瓦灰鸡和白耳黄鸡2个群体聚为一类,宁都黄鸡单独聚为一类。
关键词
地方鸡种
飞行质谱
遗传多样性
种质资源
单核苷酸多态性
Keywords
Local chicken
Flight mass spectrometry
Genetic diversity
Germplasm resources
Single nucleotide polymorphism
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
宁都黄鸡生化指标与体重的相关性研究
2
作者
马家玉
罗雯
艾佐佐
李丽群
林丽珍
机构
南昌
师范学院
生物
系
南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室
出处
《安徽农业科学》
CAS
2020年第11期116-118,共3页
基金
江西省教育厅科技项目(GJJ171120)
南昌师范学院11531工程项目
南昌师范学院博士科研启动基金资助项目(NSBSJJ2014020)。
文摘
[目的]以宁都黄鸡为试验对象,分析宁都黄鸡血清营养物质含量和血清免疫活性物质及盲肠消化酶活性与体重的相关性。[方法]选取健康状态良好的雄性宁都黄鸡150羽,散养条件下饲养至72日龄,按照体重由高到低分为较重组、中等组和较轻组。每组随机抽取样本10只,当日屠宰取血、静置并离心取血清,解剖后无菌取盲肠段内容物,以上样品置于-70℃冰箱中保存。血清总蛋白含量采用双缩脲常规法检测;血清白蛋白含量采用溴甲酚绿法检测;血清葡萄糖含量采用邻甲苯胺法检测,血清总胆固醇和甘油三酯含量采用GPO-PAP法测定;血清超氧化物歧化酶活性采用羟胺法测定;过氧化氢酶活性采用钼酸铵法测定;血清谷胱甘肽过氧化物酶和盲肠脂肪酶、胰蛋白酶活性均采用比色法测定;盲肠α淀粉酶活性采用淀粉-碘显色法测定。[结果]各体重组甘油三酯含量以及过氧化氢酶、总超氧化物歧化酶、胰蛋白酶和α淀粉酶活性均无显著差异,各生化指标与体重无相关性;各体重组总胆固醇含量和脂肪酶活性无显著差异,但与体重分别呈极显著正相关(P<0.01)和显著负相关(P<0.05);各体重组谷胱甘肽过氧化物酶活性存在极显著差异(P<0.01),且与体重呈极显著负相关。[结论]该研究结果对宁都黄鸡饲料中营养的合理配比及外源性消化酶的适时添加具有一定的指导作用。
关键词
宁都黄鸡
体重
免疫活性物质
消化酶
相关性
Keywords
Ningdu Huang chicken
Body weight
Immunoactive substance
Digestive enzymes
Correlation
分类号
S831.89 [农业科学—畜牧学]
S831.4 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
文昌鸡白麻羽性状与SLC45A2多态性关系
被引量:
4
3
作者
何艺平
陈杰
高鑫凤
许继国
机构
广州市畜牧科学
研究所
南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室
/中国科
学院
家禽分子育
种
技术
联合
实验室
江丰实业股份有限公司
华南农业大学动物科学
学院
出处
《广东农业科学》
CAS
2019年第10期99-103,共5页
基金
江西省教育厅科技项目(GJJ181080)
南昌师范学院启动基金(GJJ181080)
南昌师范学院“11531”工程建设项目
文摘
【目的】研究文昌鸡白麻羽性状的遗传规律,鉴定与白麻羽性状相关的基因变异,为文昌鸡白麻羽群体的利用以及白麻羽性状的分子标记辅助选择提供参考。【方法】利用正反交试验探索白麻羽性状的遗传规律;根据白麻羽性状的特点结合前人研究结果,选取SLC45A2基因为候选基因,利用重测序的方法筛选外显子区域内的变异;并重点验证外显子区域的错义突变和无义突变与白麻羽性状的关系。【结果】黄麻羽个体与白麻羽个体正反交试验结果表明,白麻羽性状相对于黄麻羽呈伴性隐性遗传。试验以白麻羽和黄麻个体为DNA模板,扩增了SLC45A2上的7个外显子区域,结果共筛选到5个SNP,其中3个位于外显子上,2个为错义突变(c.a74g和c.g1154c),1个为同义突变(c.c561t)。以文昌鸡白麻羽群体的文昌鸡和非白麻羽性状的文昌鸡、霸王山鸡、清远麻鸡、杏花鸡、红色原鸡为材料,验证上述错义突变,结果显示c.g1154c位点与白麻羽性状完全连锁。【结论】白麻羽性状呈现伴性隐性遗传,c.g1154c可能是白麻羽性状的致因突变。
关键词
文昌鸡
白麻羽
SLC45A2基因
银色羽基因座
Keywords
Wenchang chicken
white-partridge feather
SLC45A2 gene
silver locus
分类号
S343.15 [农业科学—作物栽培与耕作技术]
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职称材料
题名
沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析
4
作者
杨艳北
许晶
李袁飞
贡继尚
饶友生
机构
南昌师范学院生物技术研究所/江西省地方鸡种遗传改良重点实验室
南昌
师范学院
生物
系
出处
《江苏农业科学》
北大核心
2021年第6期40-45,共6页
基金
江西省教育厅科学技术研究项目(编号:GJJ181090、GJJ202631)
南昌师范学院校级科研项目(编号:20RWYB02)
+2 种基金
南昌师范学院博士科研启动基金(编号:NSBSJJ2018023)
国家自然科学基金(编号:31460595)
南昌师范学院“11531”工程。
文摘
LuxR家族调控蛋白调控革兰氏阴性细菌群体感应系统,从而影响细菌生物被膜的形成。利用在线生物信息学预测软件,分析LuxR家族调控蛋白序列,对其理化性质、亲水性/疏水性、亚细胞定位、信号肽、二级结构、三级结构、磷酸化位点、跨膜结构域和功能结构域进行分析和预测,为后续研究生物被膜形成机制奠定基础,也为生物被膜增强剂的开发提供新的思路。结果表明:LuxR家族调控蛋白为不稳定的亲水性蛋白;定位在细菌的细胞质中;无信号肽结构,推断其为非分泌性蛋白;二级结构中含有α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲等结构元件;α-螺旋和无规则卷曲对三级结构的稳定和功能发挥具有重要意义;含有5个磷酸化位点,其中丝氨酸磷酸化位点包括第79位、第165位和第171位氨基酸,其中苏氨酸磷酸化位点包括第90位和第211位氨基酸;无跨膜结构域,推测LuxR家族调控蛋白不属于跨膜蛋白;LuxR家族调控蛋白参与细菌群体感应系统,含有2个保守结构域,分别为Autoind_bind和HTH_LUXR,该蛋白通过这2个保守结构域起到转录调控的作用。
关键词
沼泽红假单胞菌
LUXR
生物信息学
生物被膜
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
江西省3个地方鸡种遗传多样性分析
谭玉文
饶友生
刘慧琳
肖月玲
徐霞
陈颖
朱学农
《河南农业科学》
北大核心
2020
7
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职称材料
2
宁都黄鸡生化指标与体重的相关性研究
马家玉
罗雯
艾佐佐
李丽群
林丽珍
《安徽农业科学》
CAS
2020
0
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职称材料
3
文昌鸡白麻羽性状与SLC45A2多态性关系
何艺平
陈杰
高鑫凤
许继国
《广东农业科学》
CAS
2019
4
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职称材料
4
沼泽红假单胞菌LuxR家族调控蛋白的生物信息学分析
杨艳北
许晶
李袁飞
贡继尚
饶友生
《江苏农业科学》
北大核心
2021
0
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