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题名白耳黄鸡三叉冠性状分析
被引量：1
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作者
张文武
邱峰芳
许继国
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机构
东华理工大学化学生物与材料科学学院
南昌师范学院生物技术研究所/江西地方鸡种遗传改良重点实验室
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出处
《广东农业科学》
CAS
2022年第12期118-123,共6页
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基金
国家自然科学基金(32160784)
广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室开放课题
江西省自然科学基金(20171BAB204013)。
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文摘
【目的】对白耳黄鸡三叉冠性状进行分析,以期寻找与三叉冠性状相关的候选单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP)位点。【方法】60只白耳黄鸡用于杂交试验,120只白耳黄鸡用于受精率试验。对82只白耳黄鸡采集血样抽提DNA,用Illumina鸡60 k芯片进行基因型分型,利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用GEMMA软件对SNP与性状进行全基因组关联分析(Genome-wide Association Analysis,GWAS),寻找与白耳黄鸡三叉冠性状显著相关的SNP位点。【结果】白耳黄鸡三叉冠呈现常染色体遗传,其种蛋受精率与单冠的白耳黄鸡差异不显著。由82只白耳黄鸡群体得到55 023个有效SNP,群体内不存在明显的群体分层。与三叉冠相关的SNP位点有10个,分别位于第1、2、3、4、5、12、14号染色体上,邻近或座落于SPRY2、NDFIP2、ITGA9、EMC2、TMEM17、EHBP1、SCAF8、TIAM2、HTT、STON2、PRKCD、RBBP6、TNRC6A、MAPK8IP3基因上。【结论】通过GWAS分析发现10个SNP位点可能与白耳黄鸡三叉冠性状相关。研究结果将为白耳黄鸡的育种提供候选分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。
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关键词
全基因组关联分析
单核苷酸多态性
常染色体遗传
种蛋受精率
鸡冠型
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Keywords
genome-wide association analysis
single nucleotide polymorphisms
autosomal inheritance
fertility of breeding egg
comb type of chicken
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分类号
S831.2
[农业科学—畜牧学]
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