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KIAA0101基因在人非小细胞肺癌中的功能预测
被引量：
2
1
作者
李华
马文丽
+3 位作者
左长清
梁爽
叶云
郑文岭
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期157-159,共3页
目的应用生物信息学分析方法对肺癌组织中高表达的基因KIAA0101进行功能预测与分析。方法通过dChip软件对人肺癌基因表达谱数据集中癌旁组织与癌组织两组样本进行比较,筛选出与KIAA0101基因共表达的差异基因。运用DAVID、GO、STRING等...
目的应用生物信息学分析方法对肺癌组织中高表达的基因KIAA0101进行功能预测与分析。方法通过dChip软件对人肺癌基因表达谱数据集中癌旁组织与癌组织两组样本进行比较,筛选出与KIAA0101基因共表达的差异基因。运用DAVID、GO、STRING等生物信息学软件对筛选基因进行生物学功能分析,并通过GATHER转录因子预测软件预测该组基因的共同转录因子。结果与癌旁正常组织比较,肺癌组织中KIAA0101等9个基因表达水平升高两倍以上,并且具有相似表达变化趋势;转录因子预测发现该组多数基因启动子区含有转录因子E2F1结合位点。结论筛选出人非小细胞肺癌组织中与KIAA0101基因共表达的一组基因,其中BUB1B、CDC20、CCNB2等基因与细胞周期的调节密切相关,推测KIAA0101基因可能参与肺癌细胞周期的调节,并且该组基因转录水平表达升高可能受转录因子E2F1的调控。
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关键词
KIAA0101
非小细胞肺癌
基因表达谱
生物信息学
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职称材料
题名
KIAA0101基因在人非小细胞肺癌中的功能预测
被引量：
2
1
作者
李华
马文丽
左长清
梁爽
叶云
郑文岭
机构
南方医科大学
基因工程研究所
南方医科大学附属华瑞医院检验科
华南基因组中心
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期157-159,共3页
文摘
目的应用生物信息学分析方法对肺癌组织中高表达的基因KIAA0101进行功能预测与分析。方法通过dChip软件对人肺癌基因表达谱数据集中癌旁组织与癌组织两组样本进行比较,筛选出与KIAA0101基因共表达的差异基因。运用DAVID、GO、STRING等生物信息学软件对筛选基因进行生物学功能分析,并通过GATHER转录因子预测软件预测该组基因的共同转录因子。结果与癌旁正常组织比较,肺癌组织中KIAA0101等9个基因表达水平升高两倍以上,并且具有相似表达变化趋势;转录因子预测发现该组多数基因启动子区含有转录因子E2F1结合位点。结论筛选出人非小细胞肺癌组织中与KIAA0101基因共表达的一组基因,其中BUB1B、CDC20、CCNB2等基因与细胞周期的调节密切相关,推测KIAA0101基因可能参与肺癌细胞周期的调节,并且该组基因转录水平表达升高可能受转录因子E2F1的调控。
关键词
KIAA0101
非小细胞肺癌
基因表达谱
生物信息学
Keywords
KIAA0101 non-small cell lung cancer gene expression profile bioinformatics
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
KIAA0101基因在人非小细胞肺癌中的功能预测
李华
马文丽
左长清
梁爽
叶云
郑文岭
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
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