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Plunc基因AF172993序列不是complete CDS
被引量：
1
1
作者
方唯意
刘真
+5 位作者
李欣
王爽
刘求真
刘腾飞
乔贵林
姚开泰
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期621-623,共3页
目的明确Plunc基因AF172993序列是complete CDS还是transcript variant。方法利用RT-PCR方法扩增Plunc基因CDS区编码序列,将该序列克隆入pEGFP-N1真核表达载体中。正反双向测序分析,所得序列除了与AF172993序列两两比对,还与nr和人类基...
目的明确Plunc基因AF172993序列是complete CDS还是transcript variant。方法利用RT-PCR方法扩增Plunc基因CDS区编码序列,将该序列克隆入pEGFP-N1真核表达载体中。正反双向测序分析,所得序列除了与AF172993序列两两比对,还与nr和人类基因组数据库进行比对分析。结果新克隆序列在CDS区658位C取代了AF172993序列A,遗传密码子由AAG改变成CAG,相应氨基酸编码也从Gln变为Lys。与人类基因组比对,Plunc基因CDS区658位C碱基能与人类20号染色体基因组2094188位C碱基完全匹配。结论AF172993序列658位A为突变位点,改变了氨基酸编码,实际为Plunc基因的变异体。GenBank数据库注释该序列错误。
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关键词
Plunc
CDS
突变位点
转录变异体
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题名
Plunc基因AF172993序列不是complete CDS
被引量：
1
1
作者
方唯意
刘真
李欣
王爽
刘求真
刘腾飞
乔贵林
姚开泰
机构
南方医科大学肿瘤研究所/教育部和广东省共建重大疾病转录组与蛋白组学重点实验室临床部
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期621-623,共3页
基金
国家自然科学基金(30171037)~~
文摘
目的明确Plunc基因AF172993序列是complete CDS还是transcript variant。方法利用RT-PCR方法扩增Plunc基因CDS区编码序列,将该序列克隆入pEGFP-N1真核表达载体中。正反双向测序分析,所得序列除了与AF172993序列两两比对,还与nr和人类基因组数据库进行比对分析。结果新克隆序列在CDS区658位C取代了AF172993序列A,遗传密码子由AAG改变成CAG,相应氨基酸编码也从Gln变为Lys。与人类基因组比对,Plunc基因CDS区658位C碱基能与人类20号染色体基因组2094188位C碱基完全匹配。结论AF172993序列658位A为突变位点,改变了氨基酸编码,实际为Plunc基因的变异体。GenBank数据库注释该序列错误。
关键词
Plunc
CDS
突变位点
转录变异体
Keywords
Pluric
CDS
variant site
transcript variant
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Plunc基因AF172993序列不是complete CDS
方唯意
刘真
李欣
王爽
刘求真
刘腾飞
乔贵林
姚开泰
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
1
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