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基于T2WI的ResNet深度学习模型术前预测膀胱癌病理分级的研究 被引量:3
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作者 黄翔 曹康养 +6 位作者 邹玉坚 邓磊 张蔚菁 杨水清 张坤林 朱玉容 李建鹏 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期125-131,共7页
目的 本研究旨在构建并验证基于T2加权成像(T2-weighted imaging, T2WI)的50层深度残差网络(50-layer deep residualnetwork,ResNet-50)深度学习(deeplearning,DL)模型术前预测膀胱癌(bladder cancer, BCa)病理分级的效能。材料与方法 ... 目的 本研究旨在构建并验证基于T2加权成像(T2-weighted imaging, T2WI)的50层深度残差网络(50-layer deep residualnetwork,ResNet-50)深度学习(deeplearning,DL)模型术前预测膀胱癌(bladder cancer, BCa)病理分级的效能。材料与方法 回顾性分析来自南方医科大学第十附属医院(中心1)和中山大学肿瘤防治中心(中心2)共169名BCa患者的211个肿瘤病灶数据。以病理组织学诊断作为金标准,以肿瘤病灶为单位进行分析,其中高级别尿路上皮癌(high grade urothelial carcinoma, HGUC)为111个,低级别尿路上皮癌(low grade urothelial carcinoma, LGUC)为100个。采用DL模型的ResNet-50方法,基于中心1内部训练集构建模型,所得出的模型在中心1的内部测试集中测试后筛选出最优模型,随后在中心2的外部测试集上进行独立验证。采用受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线下面积(area under the curve, AUC)、准确率、敏感度和特异度对模型性能进行评估,并进行特征可视化展示。结果 DL模型在内部测试集的AUC为0.856(95%CI:0.723~0.941),准确率为80.9%(95%CI:69.6%~92.1%),敏感度为77.8%(95%CI:65.9%~89.7%),特异度为82.8%(95%CI:72.0%~93.6%);在外部测试集的AUC为0.814 (95%CI:0.686~0.906),准确率为78.2%(95%CI:67.3%~89.1%),敏感度为77.3%(95%CI:66.2%~88.3%),特异度为81.8%(95%CI:71.6%~92.0%)。特征可视化结果显示DL模型较高激活区域与BCa病灶基本重叠,可正确识别BCa靶区域,同时对HGUC与LGUC的特征有一定区分度。结论 本研究首次采用DL方法在术前建立基于T2WI的BCa病理分级预测模型,并在双中心进行验证。该模型无创、客观,泛化性及可重复性强,具有较高的预测准确性,有助于临床术前更精准地诊断。 展开更多
关键词 膀胱癌 深度学习 磁共振成像 肿瘤分级
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人工智能构建宫颈液基薄层细胞涂片质控模型对比研究
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作者 温永琴 张若愚 +4 位作者 李先蕾 许华 廖晓敏 袁炜 叶伟标 《西安交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第3期544-550,共7页
目的采用两种不同的人工智能(artificial intelligence,AI)算法技术构建两种不同的宫颈液基薄层细胞涂片(liquid-based cytology,LBC)质控模型,通过混合AI辅助,对比两种算法模型对宫颈LBC的质量控制水平的提高总用。方法使用了105例宫颈... 目的采用两种不同的人工智能(artificial intelligence,AI)算法技术构建两种不同的宫颈液基薄层细胞涂片(liquid-based cytology,LBC)质控模型,通过混合AI辅助,对比两种算法模型对宫颈LBC的质量控制水平的提高总用。方法使用了105例宫颈LBC样本,分别采用卷积神经网络(convolutional neural network,CNN)算法和Transformer网络算法作为具体的AI算法。标记的特征包括片内细胞量、红细胞过多、炎细胞过多、气泡,涂片样本经过涂片预处理和数字化,然后进行图像分割和特征提取。利用标记的特征数据,进行机器学习模型的训练和优化。统计两种AI模型与医师的质控结果,计算KAPPA指数、灵敏度、特异度、曲线下面积(area under the curve,AUC)等指标对AI质控结果进行分析。结果CNN算法在正常涂片、炎性背景和血性背景方面的质控结果与专家复核质控结果具有统计学差异(P<0.001);Transformer算法质控结果与专家复核结果相似,差异不具有统计学意义(P>0.05);普通医师质控结果与专家复核质控结果在正常涂片检出率和血性背景方面具有统计学差异(P<0.001)。CNN算法Kappa值=0.567,与专家复核结果一致性中等;Transformer算法Kappa值=0.890,与专家复核结果一致性最好;普通医师Kappa值=0.675,与专家复核结果一致性较好。以专家复核结果作为参考标准,对Transformer算法与普通医师的质控结果预测效能进行评价,在检出血性背景与正常涂片方面,Transformer算法的预测效能(炎性背景:AUC=1.000;正常涂片:AUC=0.768)高于普通医师(血性背景:AUC=0.849;正常涂片:AUC=0.500)。结论Transformer算法能够有效辅助医师进行宫颈LBC质控评分,提高涂片样本质量控制的效率和准确性,为宫颈癌细胞学筛查提供了一种新的质量控制方法,具有潜在的临床应用前景。 展开更多
关键词 人工智能(AI)辅助分析 宫颈细胞学 宫颈癌筛查
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华为云ModelArts平台驱动的AI辅助诊断系统在宫颈液基细胞学非典型病变检出中的应用研究 被引量:3
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作者 温永琴 张若愚 +2 位作者 李先蕾 许华 徐咏强 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期851-858,共8页
目的探索并验证基于华为云ModelArts平台构建的深度学习模型在宫颈液基细胞学(liquid-based cytology,LBC)非典型细胞诊断中的应用价值,并评估其对不同诊断经验医师的辅助效果。方法回顾性分析2020年东莞市人民医院1044例宫颈脱落细胞... 目的探索并验证基于华为云ModelArts平台构建的深度学习模型在宫颈液基细胞学(liquid-based cytology,LBC)非典型细胞诊断中的应用价值,并评估其对不同诊断经验医师的辅助效果。方法回顾性分析2020年东莞市人民医院1044例宫颈脱落细胞学标本,采用华为云ModelArts平台开发的人工智能(artifical intelligence,AI)辅助诊断系统与初级、中级、高级医师进行诊断比对,计算灵敏度、特异度、精确率、符合率、曲线下面积(area under the curve,AUC)等指标,评估AI系统的诊断效能及其对不同年资医师的辅助诊断效果。采用McNemar检验比较AI系统与人工诊断的差异。结果在1044例宫颈脱落细胞学标本中,AI系统在非典型细胞检出的灵敏度和特异度分别为98.96%和89.15%,均高于初级医师(81.95%和91.81%)。AI系统的总体诊断精确率为93.68%,显著高于初级医师(87.26%,P<0.001)。AI辅助可显著提高初级医师的诊断性能,灵敏度从80.1%提升至96.5%,特异度从85.6%提升至92.3%。结论本研究构建的AI辅助宫颈细胞学诊断系统性能优越,尤其能显著提高初级医师的诊断水平,具有良好的临床应用前景。 展开更多
关键词 宫颈癌 液基细胞学(LBC) 非典型鳞状细胞 深度学习 华为云ModelArts 创新应用 辅助诊断
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基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析 被引量:2
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作者 梁一豪 赖颖君 +4 位作者 袁燕文 袁炜 张锡波 张拔山 卢志锋 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期605-616,共12页
目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和... 目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。 展开更多
关键词 胃癌 基因芯片 生物信息学分析 差异表达基因 分子标志物
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