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猪链球菌Ⅱ型引起脑膜炎和脓毒症1例
1
作者
李丽娟
陈惠霞
+1 位作者
刘创业
喻志强
《中国感染与化疗杂志》
北大核心
2025年第3期330-333,共4页
猪链球菌(Streptococcus suis)是一种人畜共患病原体,可引起人类和动物的急性传染病[1]。该菌主要寄居于猪的上呼吸道(特别是扁桃体和鼻腔)、生殖道和消化道。因此,携带这些病原体的猪是主要的感染源。大多数患者是通过接触活猪或未经...
猪链球菌(Streptococcus suis)是一种人畜共患病原体,可引起人类和动物的急性传染病[1]。该菌主要寄居于猪的上呼吸道(特别是扁桃体和鼻腔)、生殖道和消化道。因此,携带这些病原体的猪是主要的感染源。大多数患者是通过接触活猪或未经加工的猪肉产品和食用未煮熟的猪肉而感染[2]。该细菌可引起脑膜炎、败血症、关节炎、心内膜炎、眼内炎等。听力损失是化脓性脑膜炎恢复后最常见的后遗症[3]。自1968年丹麦首次报告了猪链球菌感染[4],迄今为止,全球范围内约有1600多例散发性猪链球菌感染报道,我国病例数占其中的22%[5],且我国发病范围广,多散发,原因复杂,形式多样,临床工作中很少见,现将我院收治的1例流行病学不典型的猪链球菌脑膜炎和脓毒症患者的诊治过程报道如下,为猪链球菌感染提供流行病学监测数据。
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关键词
猪链球菌Ⅱ型
感染
听力障碍
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职称材料
基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析
被引量：
2
2
作者
梁一豪
赖颖君
+4 位作者
袁燕文
袁炜
张锡波
张拔山
卢志锋
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期605-616,共12页
目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和...
目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。
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关键词
胃癌
基因芯片
生物信息学分析
差异表达基因
分子标志物
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职称材料
题名
猪链球菌Ⅱ型引起脑膜炎和脓毒症1例
1
作者
李丽娟
陈惠霞
刘创业
喻志强
机构
南方医科大学
第十
附属
医院
(
东莞市人民医院
)
检验
科
出处
《中国感染与化疗杂志》
北大核心
2025年第3期330-333,共4页
基金
国家自然科学基金项目(82372115)。
文摘
猪链球菌(Streptococcus suis)是一种人畜共患病原体,可引起人类和动物的急性传染病[1]。该菌主要寄居于猪的上呼吸道(特别是扁桃体和鼻腔)、生殖道和消化道。因此,携带这些病原体的猪是主要的感染源。大多数患者是通过接触活猪或未经加工的猪肉产品和食用未煮熟的猪肉而感染[2]。该细菌可引起脑膜炎、败血症、关节炎、心内膜炎、眼内炎等。听力损失是化脓性脑膜炎恢复后最常见的后遗症[3]。自1968年丹麦首次报告了猪链球菌感染[4],迄今为止,全球范围内约有1600多例散发性猪链球菌感染报道,我国病例数占其中的22%[5],且我国发病范围广,多散发,原因复杂,形式多样,临床工作中很少见,现将我院收治的1例流行病学不典型的猪链球菌脑膜炎和脓毒症患者的诊治过程报道如下,为猪链球菌感染提供流行病学监测数据。
关键词
猪链球菌Ⅱ型
感染
听力障碍
分类号
R515.3 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析
被引量：
2
2
作者
梁一豪
赖颖君
袁燕文
袁炜
张锡波
张拔山
卢志锋
机构
南方医科大学
第十
附属
医院
(
东莞市人民医院
)
检验
科
南方医科大学
第十
附属
医院
(
东莞市人民医院
)消化内
科
南方医科大学
第十
附属
医院
(
东莞市人民医院
)病理
科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期605-616,共12页
基金
广东省医学科学技术研究基金项目(A2021239)
东莞市人民医院科研培育项目(K202028)。
文摘
目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。
关键词
胃癌
基因芯片
生物信息学分析
差异表达基因
分子标志物
Keywords
gastric cancer
microarray
bioinformatics analysis
differentially expressed genes
molecular markers
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪链球菌Ⅱ型引起脑膜炎和脓毒症1例
李丽娟
陈惠霞
刘创业
喻志强
《中国感染与化疗杂志》
北大核心
2025
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析
梁一豪
赖颖君
袁燕文
袁炜
张锡波
张拔山
卢志锋
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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