精准医学:从基础研究走向临床应用 被引量：3

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作者 徐湘民 袁慧军 杨正林 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期175-176,共2页

自＂人类基因组计划＂完成以来,人们对基因组变异信息与个体差异关系的认识在不断地加深,对疾病的发生机制、药物反应性,以及患者预后的预测等等生命健康密切相关的重要问题的研究,更是以空前的速度在不断完善和拓宽人们的认识。特别是... 自＂人类基因组计划＂完成以来,人们对基因组变异信息与个体差异关系的认识在不断地加深,对疾病的发生机制、药物反应性,以及患者预后的预测等等生命健康密切相关的重要问题的研究,更是以空前的速度在不断完善和拓宽人们的认识。特别是高通量测序技术的广泛应用,使科研人员得以累积多种疾病的基于大量病例的基因组、转录组、代谢组等多组学海量数据. 展开更多

关键词 人类基因组计划 测序技术 研究走向 药物反应 个体差异 科研人员 临床应用 遗传性耳聋 非小细胞肺癌 Β-地中海贫血

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斑马鱼红系造血缺陷突变体的正向遗传学筛选 被引量：2

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作者 霍中军 温宗华 +16 位作者 刘靖 王鹍 黄志斌 戴朝霞 马宁 颜广 陈英华 陈小辉 刘伟 马品芸 罗伟豪 赵颖 樊淑 赵嘉佳 黄红辉 温子龙 张文清 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期931-935,共5页

目的化学遗传学方法大规模筛选并初步鉴定所获得具有不同红系造血缺陷表型的斑马鱼突变体。方法乙基亚硝基脲(ENU)诱导雄性斑马鱼突变(founder),将其与野生型AB雌性斑马鱼交配产生F1代,源自不同来源的founder的F1代杂交产生F2家族。在F... 目的化学遗传学方法大规模筛选并初步鉴定所获得具有不同红系造血缺陷表型的斑马鱼突变体。方法乙基亚硝基脲(ENU)诱导雄性斑马鱼突变(founder),将其与野生型AB雌性斑马鱼交配产生F1代,源自不同来源的founder的F1代杂交产生F2家族。在F2代同家族内自交所产生的F3代胚胎中,用以βe1为探针,实施整体原位杂交实验,进行红系造血缺陷突变体筛选,并针对所筛选到的突变体在不同造血过程缺陷表型进行分类研究。结果和结论筛选得到4个βe1基因表达缺失突变体,其中2个为红系特异性造血缺陷突变体,另外2个突变体同时存在红系和淋系造血缺陷。 展开更多

关键词 斑马鱼 红系造血 正向遗传学筛选 βe1-globin

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囊胚细胞WGA结合短片段Gap-PCR的α-地贫SEA突变快速植入前遗传学诊断 被引量：2

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作者 徐惠玲 刘彦慧 +4 位作者 晏平 何怡 秦佳纯 娄季武 周万军 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1250-1254,共5页

目的建立一种基于囊胚细胞全基因组扩增(WGA)结合目的序列短片段Gap-PCR基因分型技术的α-地中海贫血东南亚型(SEA)缺失突变快速植入前遗传学诊断新方法。方法以多重置换扩增(MDA)WGA技术为基础,建立以管家基因GAPDH和β-actin为目的序... 目的建立一种基于囊胚细胞全基因组扩增(WGA)结合目的序列短片段Gap-PCR基因分型技术的α-地中海贫血东南亚型(SEA)缺失突变快速植入前遗传学诊断新方法。方法以多重置换扩增(MDA)WGA技术为基础,建立以管家基因GAPDH和β-actin为目的序列的WGA产物双重荧光PCR质检体系,以及突变和正常序列短片段Gap-PCR的α-地中海贫血SEA缺失基因分型体系,通过对不同细胞数SEA携带者淋巴细胞样本的检测进行灵敏度与准确性评价,对12例囊胚活检样本的检测进行应用评价。结果应用本研究建立的方法,不同淋巴细胞数样本的结果显示3细胞时即未出现等位基因脱扣,4细胞时目标模板的WGA产物量趋于稳定;10例WGA成功的囊胚活检样本的基因分型结果分别为--SEA/αα(5例)和αα/αα(5例),与验证基因型相符。结论本研究建立的方法为一个完整检测流程,即以4～6个囊胚活检细胞为检材,对MDA产物进行WGA质检及相对浓度评估后,以短片段Gap-PCR体系而实现α-地贫SEA缺失的PGD快速基因分型;此方法简单快速、结果准确、检测成本低而适合临床常规应用。 展开更多

关键词 Α-地中海贫血 多重置换扩增 植入前遗传学诊断 基因分型

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脑源性神经营养因子甲基化水平与氯胺酮治疗难治性抑郁障碍疗效的关系

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作者 蓝玉婷 周燕玲 +4 位作者 刘冠希 黎伟城 蓝晓凤 赵存友 宁玉萍 《中国神经精神疾病杂志》 北大核心 2025年第4期232-239,共8页

目的基于一项针对重复氯胺酮注射治疗难治性抑郁障碍(treatment-resistant depression,TRD)的临床队列研究,检测患者脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)甲基化在不同疗效反应中的差异,以探索其在疗效预测中的... 目的基于一项针对重复氯胺酮注射治疗难治性抑郁障碍(treatment-resistant depression,TRD)的临床队列研究,检测患者脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)甲基化在不同疗效反应中的差异,以探索其在疗效预测中的潜在作用。方法回顾性分析83例TRD患者在接受为期2周、共6次氯胺酮注射治疗前后的外周血浆BDNF水平,用蒙哥马利-艾森贝格抑郁评定量表(Montgomery-Asberg depression rating scale,MADRS)评价疗效,比较治疗有效组与无效组之间的BDNF甲基化水平,通过双荧光素酶报告基因系统验证目标CpG位点的甲基化对转录活性的影响。结果TRD患者在完成6次重复氯胺酮输注后,治疗有效组与治疗前的基线水平相比,MADRS评分[(25.20±7.54)分vs.(8.10±5.32)分]和血浆BDNF浓度[8.74(5.26,13.46)ng/mL vs.16.59(7.41,24.46)ng/mL]均显著改善(P<0.01)。基线水平时,BDNF上有35个CpG位点甲基化程度在不同疗效组之间的差异有统计学意义(P<0.05)。全部患者中,有2个位于BDNF启动子区域的CpG位点(rs1240718851和cg06260077)呈现出高甲基化低表达的关系,其中一个CpG位点经双荧光素酶实验验证其可能影响BDNF的表达。结论TRD患者血浆BDNF浓度随着抑郁症状的缓解而上升,BDNF甲基化对基因表达的调控可预测重复静脉注射氯胺酮抗抑郁疗效。 展开更多

关键词 重性抑郁障碍 难治性抑郁 氯胺酮 抗抑郁治疗 治疗效果 脑源性神经营养因子 DNA甲基 化 表观遗传学

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斑马鱼髓系造血细胞缺陷突变体的大规模遗传筛选

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作者 戴朝霞 颜广 +15 位作者 陈英华 刘伟 霍中军 温宗华 刘靖 王鹍 黄志斌 马宁 陈小辉 马品芸 罗伟豪 赵颖 樊淑 黄红辉 温子龙 张文清 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期1230-1233,共4页

目的通过大规模化学遗传学方法筛选斑马鱼髓系造血缺陷突变体。方法利用化学诱变剂乙基亚硝基脲(ENU)将雄鱼精原母细胞诱变,通过与AB野生型雌性斑马鱼交配产生F1代,源自不同founder(F0)的F1代同胞之间交配产生F2家族,F3代来F2家族同胞... 目的通过大规模化学遗传学方法筛选斑马鱼髓系造血缺陷突变体。方法利用化学诱变剂乙基亚硝基脲(ENU)将雄鱼精原母细胞诱变,通过与AB野生型雌性斑马鱼交配产生F1代,源自不同founder(F0)的F1代同胞之间交配产生F2家族,F3代来F2家族同胞内交配,并分别以中性红和苏丹黑B染色筛选巨噬细胞和粒细胞缺陷突变体。结果我们筛选了350个F2家族,共1424对鱼。初步筛选到6个斑马鱼髓系造血系统的突变体,其中3个突变体为中性红染色异常,另3个突变体为苏丹黑染色异常,表明以上突变体可能存在巨噬细胞或粒细胞的发育障碍。结论 ENU化学诱变和中性红及苏丹黑B染色筛选斑马鱼髓系造血缺陷突变体是简单、价廉、有效的化学遗传学方法。通过保留突变体对后代进行进一步的研究分析,有望鉴定和克隆影响斑马鱼髓系造血新的基因或已知基因的新的调控途径。 展开更多

关键词 斑马鱼 髓系造血 正向遗传学筛选 苏丹黑 中性红

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影响β-地中海贫血表型的遗传修饰作用 被引量：13

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作者 张倩倩 商璇 +1 位作者 林宛颖 徐湘民 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期669-676,共8页

β-地中海贫血(β-地贫)是一种可致死、致残的遗传性血液病,临床上具有较宽泛的表型变异谱,在致病基因型相同或类似的情况下,患者的临床表型严重程度有很大的差异。探索影响β-地贫表型的遗传修饰因素是当前血液病及遗传病领域的研究热... β-地中海贫血(β-地贫)是一种可致死、致残的遗传性血液病,临床上具有较宽泛的表型变异谱,在致病基因型相同或类似的情况下,患者的临床表型严重程度有很大的差异。探索影响β-地贫表型的遗传修饰因素是当前血液病及遗传病领域的研究热点和重点。本文从α-珠蛋白基因型和胎儿血红蛋白(Hb F)数量性状位点两个方面阐述了可加重或缓解β-地贫表型的遗传修饰因素,并着重介绍了调控-珠蛋白基因重激活的转录因子变异,以及β-珠蛋白基因簇顺式元件变异。最后,本文举例介绍了β-地贫遗传修饰的临床应用以及未来发展前景。 展开更多

关键词 Β-地中海贫血 胎儿血红蛋白 遗传修饰作用 基因编辑

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不同基因型轻型β-地中海贫血患者血液学特征 被引量：12

7

作者 裴元元 冉健 +4 位作者 丛潇怡 商璇 熊符 杜丽 魏凤香 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2018年第10期1691-1692,1697,共3页

目的探讨轻型β-地中海贫血患者的血液学特征,快速鉴别不同突变基因型。方法以646例轻型β-地中海贫血患者为研究对象,系统分析红细胞计数(RBC)、血红蛋白浓度(Hb)、平均红细胞体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白量(MCH)、平均红细胞血红蛋... 目的探讨轻型β-地中海贫血患者的血液学特征,快速鉴别不同突变基因型。方法以646例轻型β-地中海贫血患者为研究对象,系统分析红细胞计数(RBC)、血红蛋白浓度(Hb)、平均红细胞体积(MCV)、平均红细胞血红蛋白量(MCH)、平均红细胞血红蛋白浓度(MCHC)、红细胞分布宽度变异系数(RDW-CV)、血红蛋白A2(HbA2)等血液学参数,并对比β0/βN和β+/βN突变型间的区别。结果轻型β-地中海贫血患者主要表现为小细胞、低色素。646例患者最常见基因型依次为β654/βN(33%)、β41-42/βN(32.5%)、β17/βN(14.4%)、β-28/βN(10%),β0/βN突变型占比较高。对比分析发现,除Hb、MCHC外,组间RBC、MCV、MCH、RDW-CV、HbA2差异均有统计学意义。与β+/βN患者相比,β0/βN患者的MCV、MCH明显降低,RDW-CV、HbA2明显升高。结论不同基因型的轻型β-地中海贫血拥有各自独特的血液学特征,可以通过血液学分析快速有效鉴别提高临床工作效率。 展开更多

关键词 轻型β-地中海贫血 β0/βN β+/βN 血液学筛查

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TLR4/NLRP3炎症复合体介导对比剂诱导的肾小管上皮细胞炎症和损伤 被引量：10

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作者 林燕 林佳琼 +3 位作者 谢楚莉 管小凤 谭学贤 黄泽娜 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2252-2258,共7页

目的:探讨Toll样受体4(TLR4)/Nod样受体蛋白3(NLRP3)炎症复合体是否介导了对比剂(CM)引起的肾小管上皮细胞炎症和损伤。方法:本研究运用碘普罗胺作用于大鼠肾小管上皮细胞NRK-52E建立损伤模型。应用CCK-8法测定细胞存活率;Western blot... 目的:探讨Toll样受体4(TLR4)/Nod样受体蛋白3(NLRP3)炎症复合体是否介导了对比剂(CM)引起的肾小管上皮细胞炎症和损伤。方法:本研究运用碘普罗胺作用于大鼠肾小管上皮细胞NRK-52E建立损伤模型。应用CCK-8法测定细胞存活率;Western blot测定TLR4、NLRP3、凋亡相关斑点样蛋白(ASC)、caspase-1和cleaved caspase-3的蛋白水平;ELISA法检测炎症因子白细胞介素1β(IL-1β)和IL-18的水平;Hoechst 33258核染色法检测凋亡率;JC-1染色法测定线粒体膜电位。用小干扰RNA沉默NLRP3表达。结果:CM可降低NRK-52E细胞的存活率并上调cleaved caspase-3的蛋白水平(P<0.05);此外,CM可上调细胞TLR4/NLRP3炎症复合体的表达并促进炎症因子IL-1β和IL-18的分泌(P<0.05)。沉默NLRP3可以对抗CM诱导的炎症因子分泌;TLR4抑制剂TAK-242及沉默NLRP3能减轻CM引起的细胞凋亡和线粒体功能损伤。结论:TLR4/NLRP3炎症复合体参与了CM致急性肾损伤的发病机制,并介导了CM诱导的肾小管上皮细胞损伤和炎症。 展开更多

关键词 对比剂 肾损伤 炎症 TOLL样受体4 Nod样受体蛋白3炎症复合体

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中国汉族人群ABCB1基因SNPs与单倍型频率分析 被引量：6

9

作者 李亮 李川江 +1 位作者 江海霞 李忠海 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2011年第21期3831-3834,共4页

目的:分析中国汉族人群中ABCB1基因SNPs频率与单倍型频率。方法:采用DNA直接测序法对130例汉族人ABCB1基因-129T>C,1236C>T,2677G>T/A和3435C>T测序并构建单倍型,分析各个SNPs频率与单倍型频率。结果:突变位点-129C、1236T... 目的:分析中国汉族人群中ABCB1基因SNPs频率与单倍型频率。方法:采用DNA直接测序法对130例汉族人ABCB1基因-129T>C,1236C>T,2677G>T/A和3435C>T测序并构建单倍型,分析各个SNPs频率与单倍型频率。结果:突变位点-129C、1236T、2677T、2677A和3435T频率分别为4.62%、64.23%、35.00%、12.69%和35.38%;单倍型T-T-T-T和C-T-T-T频率分别为31.15%和0.77%。结论:汉族人群中ABCB1基因功能性的SNP突变位点与单倍型频率较高,对相关SNPs和单倍型进行基因分型可以指导临床上P-糖蛋白相关药物的安全有效使用。 展开更多

关键词 多态性 单核苷酸 ABCB1基因 单倍型 频率

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基于父源差异SNP位点的等位基因特异性实时荧光PCR方法建立及其在α^0-地中海贫血无创产前诊断中的应用

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作者 刘彦慧 吴亚敏 +6 位作者 石少权 娄季武 马秋林 何怡 徐婉芳 林洋洋 周万军 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第20期2082-2085,共4页

目的建立并评价1种纯合α0-地中海贫血排除性无创产前诊断的等位基因特异性实时荧光PCR技术(AS-qPCR)。方法用PCR微测序技术,检测SEA高风险夫妇基因缺失区内9个SNP以确定双亲差异位点;然后以AS-qPCR技术检测孕妇血浆中父源差异SNP位点,... 目的建立并评价1种纯合α0-地中海贫血排除性无创产前诊断的等位基因特异性实时荧光PCR技术(AS-qPCR)。方法用PCR微测序技术,检测SEA高风险夫妇基因缺失区内9个SNP以确定双亲差异位点;然后以AS-qPCR技术检测孕妇血浆中父源差异SNP位点,判断父方是否将正常单倍型遗传给胎儿。结果 167个家系中,160个家系找到1个或多个有双亲差异的SNP位点,检测率为98.16%;94例检测到父源性正常等位基因SNP而免于创伤性产前诊断,检出率57.67%;所有家系的绒毛或羊水基因检测结果与本方法的符合率为100%。结论采用AS-qPCR检测孕妇血浆游离DNA中双亲差异SNP位点的方法,在孕早期即可进行纯合α0-地中海贫血的排除性无创产前诊断,可使约50%高风险孕产妇免于创伤性产前诊断。 展开更多

关键词 Α-地中海贫血 无创产前诊断 游离DNA 基因缺失

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三重实时荧光PCR相对定量法快速诊断21和X染色体数目异常

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作者 刘彦慧 吴亚敏 +2 位作者 黎丽芬 李超强 周万军 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第13期1479-1481,共3页

目的建立三重TaqMan实时荧光定量PCR体系,快速诊断21、X染色体数目异常。方法选取21号染色体唐氏综合征特异区域(DSCR3)和X染色体1113KDNA序列范围分别作为21号和X染色体目的基因,同时选择12号染色体上磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)为参... 目的建立三重TaqMan实时荧光定量PCR体系,快速诊断21、X染色体数目异常。方法选取21号染色体唐氏综合征特异区域(DSCR3)和X染色体1113KDNA序列范围分别作为21号和X染色体目的基因,同时选择12号染色体上磷酸甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)为参比基因,分别设计引物和TaqMan探针,经PCR反应体系优化,采用单管三重及2-ΔΔCt相对定量数据分析,根据基因拷贝数变化诊断21号和X染色体数目异常,并进行方法学应用评价。结果通过优化,模板量在5～30ng/μl时3个基因都可以得到有效扩增,目的基因和参照基因扩增效率基本一致,均接近100%。采用上述体系检测24例正常标本和20例异常标本(包括血液和羊水标本),正常标本的21号2-ΔΔCt值均为2,而唐氏综合征患者均为3;正常男性的X染色体2-ΔΔCt值均为1,而正常女性均为2。其临床标本检测结果的敏感性、特异性均达100%。结论建立的三重TaqMan实时荧光PCR相对定量法快速诊断21和X染色体数目异常方法 ,稳定性、可靠性和实用性均较好。 展开更多

关键词 荧光定量PCR 拷贝数 染色体数目异常

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同源不同辐射抗拒NPC细胞间总甲基化水平及基因甲基化表达差异的探讨

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作者 罗海丹 王冬辉 +3 位作者 林伟达 苏箔金 赵存友 杨惠玲 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1300-1304,共5页

目的:比较同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞CNE2R/CNE2间总甲基化水平及其区域的差异。方法:采用赵存友博士改良的基于甲基化敏感酶全基因组甲基化法检测CNE2R/CNE2细胞全基因组甲基化水平;同时采用Me DIP-Seq测序法对CNE2R/CNE2细胞... 目的:比较同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞CNE2R/CNE2间总甲基化水平及其区域的差异。方法:采用赵存友博士改良的基于甲基化敏感酶全基因组甲基化法检测CNE2R/CNE2细胞全基因组甲基化水平;同时采用Me DIP-Seq测序法对CNE2R/CNE2细胞进行测序,分析比较DNA甲基化区域(主要包括6个基因功能元件即CDS、intron、downstream2k、upstream2k、3’UTR及5’UTR)的差异。结果:CNE2R细胞全基因组甲基化水平比CNE2细胞低约30%;在CNE2R和CNE2细胞中,虽然分布在6个基因功能元件上的峰值个数和峰值在各基因元件上的覆盖度均无明显差异,但2种细胞的6个基因功能元件上基因甲基化存在差异。结论:同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞间总甲基化水平及基因甲基化存在差异,推测DNA甲基化的差异可能与鼻咽癌辐射抗拒相关。 展开更多

关键词 辐射抗拒 甲基化 鼻咽癌 基因元件

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人类珠蛋白相关基因上游开放阅读框的变异分析 被引量：3

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作者 叶宇华 张倩倩 +4 位作者 钟建美 黎倚红 张立 喻秋霞 徐湘民 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期232-240,共9页

β-地中海贫血症是一种珠蛋白生成障碍的常染色体隐性遗传病。而γ珠蛋白基因的开放表达和胎儿血红蛋白的合成,是缓解β地中海贫血病人临床表型的一个重要因素。本研究针对202个血红蛋白相关调控基因或mi RNA,对1802个β-地中海贫血症... β-地中海贫血症是一种珠蛋白生成障碍的常染色体隐性遗传病。而γ珠蛋白基因的开放表达和胎儿血红蛋白的合成,是缓解β地中海贫血病人临床表型的一个重要因素。本研究针对202个血红蛋白相关调控基因或mi RNA,对1802个β-地中海贫血症患者进行了目标区域捕获测序。通过生物信息学的分析,检测出了所有捕获区域内的突变。进一步对位于5′端非编码区(5′untranslated region,5′UTR)的突变进行系统扫描,共计寻找到41个影响u ORF(upstream open reading frame,u ORF)有或无的功能性突变。从中选取了CHTOP基因(chr1:153606541 C>T)和TGFB1基因(chr19:41859418 G>A)的两个突变,通过定点诱变和双荧光素酶报告实验,在体外证实这两个突变均可显著地改变下游基因的表达。该研究结果为β-地中海贫血症临床表型的精确诊断提供了潜在的筛查靶点。 展开更多

关键词 Β-地中海贫血 突变 5′端非编码区 上游开放阅读框

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广东人群中α珠蛋白基因多拷贝频率分布研究 被引量：3

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作者 魏小凤 徐湘民 +6 位作者 郭晓玲 周玉球 黄烁丹 刘彦慧 陈亚军 丁红梅 商璇 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第10期1376-1380,共5页

目的调查广东人群中α珠蛋白基因多拷贝的变异类型及分布频率。方法采用靶向二代测序方法(next⁃generation sequencing,NGS)对广东六个城市的2310对夫妇(4620例样本)的珠蛋白基因型进行分析,采用多重连接探针扩增技术(multiplex ligatio... 目的调查广东人群中α珠蛋白基因多拷贝的变异类型及分布频率。方法采用靶向二代测序方法(next⁃generation sequencing,NGS)对广东六个城市的2310对夫妇(4620例样本)的珠蛋白基因型进行分析,采用多重连接探针扩增技术(multiplex ligation⁃dependent probe amplification,MLPA)对NGS分析提示有α珠蛋白基因多拷贝的样本进行验证。结果经NGS和MLPA双重分析发现92例样本携带α珠蛋白基因多拷贝,基因型为αααanti3.7/αα的45例,αααanti4.2/αα的47例。结论在4620例样本中发现92例携带珠蛋白基因多拷贝,广东人群中的携带率约为1.99%。 展开更多

关键词 Α珠蛋白基因 多拷贝 二代测序 多重连接探针扩增技术 拷贝数变异

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中国人血红蛋白病突变数据集和临床辅助决策管理系统 被引量：2

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作者 张倩倩 张立 +4 位作者 唐耀华 李厦戎 徐晓鹏 祁鸣 徐湘民 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期746-753,共8页

个体基因组信息得益于大数据的积累,其应用不再局限于科学研究,正在经历逐步走向日常医疗实践的过程中。对疾病关联基因组信息的系统整理、归档及合理应用配置是未来精准医学的重要基础。血红蛋白病在我国南方发病率高,其分子病理学基... 个体基因组信息得益于大数据的积累,其应用不再局限于科学研究,正在经历逐步走向日常医疗实践的过程中。对疾病关联基因组信息的系统整理、归档及合理应用配置是未来精准医学的重要基础。血红蛋白病在我国南方发病率高,其分子病理学基础有明显的种族特异性。为助力我国南方血红蛋白病的临床诊断和遗传筛查的应用,本项目团队建立了中国人群血红蛋白病变异谱及表型谱 LOVD 基因变异数据管理系统,并通过设计全面整合和高效分析的在线辅助精确诊断及风险评估系统,展示了基于云端标准化的特定血红蛋白病变异注释库和诊断知识库辅助医生快速做出综合、全面的诊断和遗传咨询的操作。通过数据整合和人工智能技术的结合提高疾病临床决策效率的方法和经验,可为其他疾病的临床和预防应用起示范作用。 展开更多

关键词 LOVD 血红蛋白病 变异谱 临床辅助决策

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加尾引物多重PCR技术检测Y染色体微缺失

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作者 邹德亮 温晓君 +3 位作者 张雪莲 吴晓伟 周万军 吴英松 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第18期1901-1904,共4页

目的设计加尾引物多重PCR策略,并采用此技术建立一种快速检测Y染色体15个STS位点微缺失的多重PCR方法。方法以Y染色体无精子因子(azoospermia factor,AZF)区域15个特异性序列标签位点(sequence-tagged site,STS)为扩增子,根据加尾引物多... 目的设计加尾引物多重PCR策略,并采用此技术建立一种快速检测Y染色体15个STS位点微缺失的多重PCR方法。方法以Y染色体无精子因子(azoospermia factor,AZF)区域15个特异性序列标签位点(sequence-tagged site,STS)为扩增子,根据加尾引物多重PCR策略设计5'端加尾引物,建立一种Y染色体微缺失多重PCR体系;并检测18例已知样本和112例临床样本观察其灵敏度与准确性。结果基于此策略的多重PCR体系优化过程简单快速,建立的多重PCR检测体系稳定可靠,各目的条带的电泳分析亮度基本一致;18例已知样本的检测结果与靶值相符;112例临床样本的检测结果也与对照方法一致。结论本研究设计的加尾引物策略可提高多重PCR扩增效率,简化优化过程,为其他多重PCR检测体系的设计与建立提供参考和借鉴;建立的Y染色体AZF15个STS位点微缺失多重PCR检测方法结果稳定,可供临床样本的快速检测。 展开更多

关键词 多重PCR Y染色体 微缺失

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精神分裂症相关单核苷酸多态性调控microRNA功能研究进展 被引量：9

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作者 梁文权 侯豫 赵存友 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期677-685,共9页

MicroRNA(miRNAs)是一类长约22nt且对基因表达具有广泛的调控作用的非编码RNA,并在神经元增殖、分化和发育成熟的过程中扮演重要角色。近年来全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)发现了众多的精神分裂症相关单核苷... MicroRNA(miRNAs)是一类长约22nt且对基因表达具有广泛的调控作用的非编码RNA,并在神经元增殖、分化和发育成熟的过程中扮演重要角色。近年来全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)发现了众多的精神分裂症相关单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点多位于非编码区,表明miRNA在精神分裂症的发病过程中存在重要作用。本文综述了精神分裂症相关SNP与miRNA可能发生相互作用的4种机制(SNP位于miRNA基因、SNP位于miRNA宿主基因、SNP位于miRNA种子序列和SNP位于miRNA结合位点),为研究miRNA在精神分裂症发生发展中的作用提供参考。 展开更多

关键词 全基因组关联研究 单核苷酸多态性 微小 RNA 精神分裂症

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微滴式数字PCR(ddPCR)快速检测α珠蛋白基因ααα^(anti-3.7)三联体 被引量：1

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作者 龚小倩 杨学煌 +2 位作者 乔伶俐 陈亚军 周万军 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1265-1269,共5页

目的建立一种基于微滴式数字PCR(ddPCR)技术的α珠蛋白基因αααanti-3.7快速检测方法。方法以β-actin为参比基因、α1基因X1/Y1盒之间的差异性序列为目的基因代表性扩增子,设计特异性引物和Taq Man探针,建立基于ddPCR技术的拷贝数定... 目的建立一种基于微滴式数字PCR(ddPCR)技术的α珠蛋白基因αααanti-3.7快速检测方法。方法以β-actin为参比基因、α1基因X1/Y1盒之间的差异性序列为目的基因代表性扩增子,设计特异性引物和Taq Man探针,建立基于ddPCR技术的拷贝数定量方法;检测28例已知基因型和60例临床样本,评价此方法的灵敏度和准确性。结果采用本研究建立的方法,28例已知基因型样本的检测结果均与靶基因型结果相符;60例临床样本中检出5例αα/αααanti-3.7,与MLPA的验证结果一致;方法学评价结果显示此ddPCR体系的灵敏度与准确性均达100%。结论建立了一种α珠蛋白基因αααanti-3.7三联体ddPCR检测方法,操作简单快速、结果准确可靠,可应用于人群筛查和临床常规分子诊断。 展开更多

关键词 数字PCR 珠蛋白基因 多拷贝 地中海贫血

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