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Illumina测序16S rRNA标签法分析细菌性阴道病患者阴道菌群多样性
被引量：
18
1
作者
许苏容
宗利丽
+3 位作者
刘木彪
何彦
黄雪梅
周宏伟
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期672-677,共6页
目的从菌群总体角度分析和比较健康育龄期女性和细菌性阴道病(BV)患者阴道菌群差异。方法采集临床Amsel标准及Nugent评分筛选的37例BV患者及37例健康育龄期女性阴道穹窿分泌物标本,提取总基因组DNA,对16S rRNA V6区基因进行扩增,所有扩...
目的从菌群总体角度分析和比较健康育龄期女性和细菌性阴道病(BV)患者阴道菌群差异。方法采集临床Amsel标准及Nugent评分筛选的37例BV患者及37例健康育龄期女性阴道穹窿分泌物标本,提取总基因组DNA,对16S rRNA V6区基因进行扩增,所有扩增的PCR产物经IIlumina测序后,通过BIPES、UCHIME、TSC、GAST最终得到样品的物种信息。结果健康育龄期女性阴道分泌物乳酸杆菌占95%以上,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者比例相当,同时存在少量加德纳氏菌属,颗粒链球菌属,链球菌属,普氏菌菌属,埃希氏杆菌属和其它菌属;30例BV患者阴道菌群Alpha多样性明显增加(P<0.001),Beta多样性也发生了明显变化,表现为乳酸杆菌明显减少,其相对比例从45%到1%(24例),以惰性乳酸杆菌为主,部分患者(6例)甚至未检出,同时加德纳氏菌属,普氏菌菌属,颗粒链球菌属,厌氧球菌,微单胞菌属,Peptoniphilus.harei-消化链球菌属,戴阿李斯特杆菌属等相对丰富度增加,不同于既往研究的是7例BV患者以少见的格氏乳杆菌,嗜酸乳杆菌为优势菌群,约占75%～50%。结论健康育龄女性阴道菌群以乳酸杆菌占绝对优势,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者相当,并与多种微生物并存;大部分BV患者阴道菌群表现为乳酸杆菌显著减少甚至缺失,小部分BV患者以少见的格氏乳酸杆菌、嗜酸乳酸杆菌为优势菌群。
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关键词
Illumina测序
BIPES
细菌性阴道病
阴道菌群
16S
RRNA
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职称材料
白假丝酵母菌基因型和假丝酵母菌群分布与外阴阴道假丝酵母菌病严重程度的相关性分析(英文)
被引量：
6
2
作者
曾俊
宗利丽
+2 位作者
毛婷
黄郁馨
徐正美
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1649-1653,共5页
探讨致病假丝酵母菌菌群分布以及白假丝酵母菌基因型与外阴阴道假丝酵母菌病症状严重程度的关系。方法我们对2009年9月~2010年10月在我院就诊的,以及生活习惯、饮食、既往用药及工作环境相似的急性VVC患者,利用聚合酶链反应-单链构象多...
探讨致病假丝酵母菌菌群分布以及白假丝酵母菌基因型与外阴阴道假丝酵母菌病症状严重程度的关系。方法我们对2009年9月~2010年10月在我院就诊的,以及生活习惯、饮食、既往用药及工作环境相似的急性VVC患者,利用聚合酶链反应-单链构象多态性分析技术（PCR-SSCP）对其阴道来源的假丝酵母菌进行分子水平的菌种鉴定,结合SSCP和基因扫描（GeneScan）对白假丝酵母菌CAI区进行多态性分析确定其基因型,对VVC的严重程度进行临床症状体征的评分。结果从获得的198份标本中分离白假丝酵母菌140株（70.7%）;58株非白假丝酵母菌（29.3%）。198名患者中重度VVC 95人,轻中度VVC 103人。白假丝酵母菌在重度VVC和轻中度VVC患者中所占比列分别为62.1%和76.6%（P=0.011）。140株C.albican共检出38种CAI基因型且集中分布于少数几种,其中基因型30-45（44株,31.43%）和32-46（23株,16.43%）最常见,其次为基因型30-46（4株,2.86%）和32-47（9株,6.42%）。以上4种优势基因型菌株在重度VVC和轻中度VVC患者中的分布差异有统计学意义（77.9%vs 42.0%,P〈0.001）。结论白假丝酵母菌仍然是VVC的主要致病菌,但非白假丝酵母菌与白假丝酵母菌相比更容易引起重度VVC,白假丝酵母菌的基因型与VVC严重程度有关。
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关键词
外阴阴道假丝酵母菌病
白假丝酵母菌
CAI基因型
单链构象多态性分析
基因扫描
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职称材料
题名
Illumina测序16S rRNA标签法分析细菌性阴道病患者阴道菌群多样性
被引量：
18
1
作者
许苏容
宗利丽
刘木彪
何彦
黄雪梅
周宏伟
机构
南方医科大学
珠江
医院
妇产科
南方医科大学中西医结合医院妇产科
南方医科大学
公共卫生与热带医学学院环境卫生学系
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期672-677,共6页
基金
国家自然科学基金(3 12701 52)
教育部"新世纪优秀人才"项目(NCET-11-0921)~~
文摘
目的从菌群总体角度分析和比较健康育龄期女性和细菌性阴道病(BV)患者阴道菌群差异。方法采集临床Amsel标准及Nugent评分筛选的37例BV患者及37例健康育龄期女性阴道穹窿分泌物标本,提取总基因组DNA,对16S rRNA V6区基因进行扩增,所有扩增的PCR产物经IIlumina测序后,通过BIPES、UCHIME、TSC、GAST最终得到样品的物种信息。结果健康育龄期女性阴道分泌物乳酸杆菌占95%以上,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者比例相当,同时存在少量加德纳氏菌属,颗粒链球菌属,链球菌属,普氏菌菌属,埃希氏杆菌属和其它菌属;30例BV患者阴道菌群Alpha多样性明显增加(P<0.001),Beta多样性也发生了明显变化,表现为乳酸杆菌明显减少,其相对比例从45%到1%(24例),以惰性乳酸杆菌为主,部分患者(6例)甚至未检出,同时加德纳氏菌属,普氏菌菌属,颗粒链球菌属,厌氧球菌,微单胞菌属,Peptoniphilus.harei-消化链球菌属,戴阿李斯特杆菌属等相对丰富度增加,不同于既往研究的是7例BV患者以少见的格氏乳杆菌,嗜酸乳杆菌为优势菌群,约占75%～50%。结论健康育龄女性阴道菌群以乳酸杆菌占绝对优势,单独以惰性乳酸杆菌或卷曲乳酸杆菌为主,或者两者相当,并与多种微生物并存;大部分BV患者阴道菌群表现为乳酸杆菌显著减少甚至缺失,小部分BV患者以少见的格氏乳酸杆菌、嗜酸乳酸杆菌为优势菌群。
关键词
Illumina测序
BIPES
细菌性阴道病
阴道菌群
16S
RRNA
Keywords
Illumina Sequcencing
BIPES
bacterial vaginosis
vaginal microbiomes
16S rRNA
分类号
R711.3 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
白假丝酵母菌基因型和假丝酵母菌群分布与外阴阴道假丝酵母菌病严重程度的相关性分析(英文)
被引量：
6
2
作者
曾俊
宗利丽
毛婷
黄郁馨
徐正美
机构
南方医科大学
珠江
医院
妇产科
南方医科大学中西医结合医院妇产科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第10期1649-1653,共5页
基金
Supported by Key Technologies Research and Development Program of the Ministry of Science and Technology(2004BA720A05-02)~~
文摘
探讨致病假丝酵母菌菌群分布以及白假丝酵母菌基因型与外阴阴道假丝酵母菌病症状严重程度的关系。方法我们对2009年9月~2010年10月在我院就诊的,以及生活习惯、饮食、既往用药及工作环境相似的急性VVC患者,利用聚合酶链反应-单链构象多态性分析技术（PCR-SSCP）对其阴道来源的假丝酵母菌进行分子水平的菌种鉴定,结合SSCP和基因扫描（GeneScan）对白假丝酵母菌CAI区进行多态性分析确定其基因型,对VVC的严重程度进行临床症状体征的评分。结果从获得的198份标本中分离白假丝酵母菌140株（70.7%）;58株非白假丝酵母菌（29.3%）。198名患者中重度VVC 95人,轻中度VVC 103人。白假丝酵母菌在重度VVC和轻中度VVC患者中所占比列分别为62.1%和76.6%（P=0.011）。140株C.albican共检出38种CAI基因型且集中分布于少数几种,其中基因型30-45（44株,31.43%）和32-46（23株,16.43%）最常见,其次为基因型30-46（4株,2.86%）和32-47（9株,6.42%）。以上4种优势基因型菌株在重度VVC和轻中度VVC患者中的分布差异有统计学意义（77.9%vs 42.0%,P〈0.001）。结论白假丝酵母菌仍然是VVC的主要致病菌,但非白假丝酵母菌与白假丝酵母菌相比更容易引起重度VVC,白假丝酵母菌的基因型与VVC严重程度有关。
关键词
外阴阴道假丝酵母菌病
白假丝酵母菌
CAI基因型
单链构象多态性分析
基因扫描
Keywords
vulvovaginal candidiasis
Candida albican
microsatellite locus I genotype
single-strand conformation polymorphism
GeneScan
分类号
R711.3 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Illumina测序16S rRNA标签法分析细菌性阴道病患者阴道菌群多样性
许苏容
宗利丽
刘木彪
何彦
黄雪梅
周宏伟
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
18
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职称材料
2
白假丝酵母菌基因型和假丝酵母菌群分布与外阴阴道假丝酵母菌病严重程度的相关性分析(英文)
曾俊
宗利丽
毛婷
黄郁馨
徐正美
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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