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基于线粒体基因序列的广西柑橘木虱遗传多样性及种群结构分析: 1; 作者邓铁军杨丽婷 +3 位作者雷薇刘丽辉刘吉敏陈琦《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2100-2107,共8页; 【目的】研究广西柑橘木虱遗传多样性及种群结构,为制定柑橘木虱的防控措施提供理论基础。【方法】通过分析来自我国广东、贵州、云南、海南、广西以及越南太平和柬埔寨暹粒等地区的9个柑橘木虱线粒体基因组序列,确定并设计针对多态性... 展开更多; 关键词柑橘木虱遗传多样性种群结构单倍型柑橘广西; 在线阅读下载PDF 职称材料

一株具有烟草甲幼虫毒杀作用苏云金芽孢杆菌的遗传多样性分析及cry基因鉴定被引量：4: 2; 作者胡逸超雷薇 +7 位作者孙建生李季刚邹克兴苏赞梁伟蔡联合陈琦邹承武《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期319-324,共6页; 【目的】明确一株具有烟草甲幼虫毒杀作用苏云金芽孢杆菌在蜡样芽孢杆菌群中的进化关系,并对该菌株所携带的cry基因进行鉴定,为其在农业上的开发应用提供参考依据。【方法】对苏云金芽孢杆菌GXZY032菌株的16S rRNA和gyrB基因序列进行PC... 展开更多; 关键词苏云金芽孢杆菌进化关系 16S RRNA序列 cry基因鉴定; 在线阅读下载PDF 职称材料

一株具有烟草甲毒杀作用的苏云金芽孢杆菌对烟叶的影响被引量：2: 3; 作者胡逸超苏赞 +4 位作者雷薇陈义昌邹克兴陈琦邹承武《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1568-1576,共9页; 【目的】明确一株具有烟草甲毒杀作用的苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)在醇化过程中对烟叶的影响,为烟叶仓库中应用Bt菌剂防控烟草甲的可行性和安全性评价提供参考依据。【方法】按照0.1 g Bt菌剂处理1 kg烟叶的比例作处理... 展开更多; 关键词苏云金芽孢杆菌烟叶醇化化学成分感官质量细菌群落结构多样性; 在线阅读下载PDF 职称材料

一株侵染掌叶半夏的大豆花叶病毒的全基因组序列测定和vsiRNA特征分析被引量：1: 4; 作者胡逸超卢晓静 +4 位作者李璞廖咏梅何新华邹承武陈琦《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3392-3399,共8页; 【目的】探究侵染掌叶半夏(Pinellia pedatisecta)的大豆花叶病毒(Soybean mosaicvirus,SMV)衍生的干扰小RNA(virus-derivedsmallinterferingRNA,vsiRNA)序列特征,为掌叶半夏抵御病毒的作用机制研究提供参考。【方法】以一株来自广西的... 展开更多; 关键词掌叶半夏病毒基因组大豆花叶病毒小RNA深度测序 vsiRNA; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基于线粒体基因序列的广西柑橘木虱遗传多样性及种群结构分析: 1; 作者邓铁军杨丽婷雷薇刘丽辉刘吉敏陈琦; 机构广西农业科学院植物保护研究所/广西柑橘黄龙病防控工程技术研究中心/广西作物病虫害生物学重点实验室南宁国拓生物科技有限公司南宁新技术创业者中心; 出处《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期2100-2107,共8页; 基金广西创新驱动发展专项(桂科AA18118046-1) 国家现代农业产业技术体系广西创新团队建设项目(nycytxgxcxtd-2021-05-02) +1 种基金广西特色作物试验站项目(桂TS2022008)。; 文摘【目的】研究广西柑橘木虱遗传多样性及种群结构,为制定柑橘木虱的防控措施提供理论基础。【方法】通过分析来自我国广东、贵州、云南、海南、广西以及越南太平和柬埔寨暹粒等地区的9个柑橘木虱线粒体基因组序列,确定并设计针对多态性位点的引物。利用获得的引物对采集自广西合浦、环江、富川、西林、永福和右江6个柑橘产区的柑橘木虱线粒体基因序列进行扩增和测序;使用DnaSP 6.12对测序序列进行多态性分析和单倍型多样性分析;采用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育进化树;使用PopART绘制单倍型网络图以展示种群进化结构和关系。【结果】对来自我国和越南太平、柬埔寨暹粒的9个柑橘木虱线粒体基因组序列进行比对分析,共获得22个多态性位点,针对多态性位点区域序列设计引物并筛选获得5对有效引物,其中包括8个多态性位点。利用5对引物对采集自广西6个柑橘产区的18个柑橘木虱线粒体基因进行PCR扩增并测序,获得总长度2272 bp的线粒体基因序列,经分析发现广西柑橘木虱共包含6种单倍型,单倍型多样性为0.882、核苷酸多样性为0.00181。最大似然进化树、贝叶斯进化树和单倍型网络分析发现,广西西林柑橘木虱种群与云贵川等我国西南地区高海拔的柑橘木虱种群在遗传距离上较近,其他地区的柑橘木虱种群与我国南方和东南亚的种群更接近。【结论】广西柑橘木虱种群展现较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,表现明显的种群结构分化和多样性;广西柑橘木虱种群遗传分化受地理距离影响明显,二者存在相关性。; 关键词柑橘木虱遗传多样性种群结构单倍型柑橘广西; Keywords Diaphorina citri Kuwayama genetic diversity population structure haplotype citrus Guangxi; 分类号 S511.31 [农业科学—作物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一株具有烟草甲幼虫毒杀作用苏云金芽孢杆菌的遗传多样性分析及cry基因鉴定被引量：4: 2; 作者胡逸超雷薇孙建生李季刚邹克兴苏赞梁伟蔡联合陈琦邹承武; 机构广西中烟工业有限责任公司技术中心南宁国拓生物科技有限公司广西大学农学院; 出处《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期319-324,共6页; 基金广西自然科学基金项目(2016GXNSFAA380027) 广西中烟工业有限责任公司项目(GXZYCX2017B005) 2019年度广西中央引导地方科技发展专项(桂科计字【2019】183号)。; 文摘【目的】明确一株具有烟草甲幼虫毒杀作用苏云金芽孢杆菌在蜡样芽孢杆菌群中的进化关系,并对该菌株所携带的cry基因进行鉴定,为其在农业上的开发应用提供参考依据。【方法】对苏云金芽孢杆菌GXZY032菌株的16S rRNA和gyrB基因序列进行PCR扩增测序,并进行相应的进化树分析;使用PCR技术对GXZY032菌株基因组所包含的cry杀虫基因进行鉴定。【结果】菌株GXZY032的16S rRNA序列经PCR扩增得到1.5 kb片段,在进化树中以较低的置信值与多个BtII群菌株聚到一起。gyrB基因序列经PCR扩增并测序得到1.2 kb片段,所构建的进化树有6个置信值较高的分支,构成BtI、BtII、B.cereus I、BtIII、Bt+Bw和Bt+Ba 6个群,其中菌株GXZY032的序列与BtII群聚集一起,置信值为99%。对8种cry基因进行PCR鉴定,结果表明,菌株GXZY032包含cry1、cry2和cry10 3种类型cry基因。【结论】苏云金芽孢杆菌菌株GXZY032属于BtII群,具有cry1、cry2和cry10 3种类型cry杀虫基因。; 关键词苏云金芽孢杆菌进化关系 16S RRNA序列 cry基因鉴定; Keywords Bacillus thuringiensis Phylogenetic relationship 16S rRNA sequence cry gene profiling; 分类号 S476.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一株具有烟草甲毒杀作用的苏云金芽孢杆菌对烟叶的影响被引量：2: 3; 作者胡逸超苏赞雷薇陈义昌邹克兴陈琦邹承武; 机构广西中烟工业有限责任公司技术中心南宁国拓生物科技有限公司广西大学农学院/植物科学国家级实验教学示范中心; 出处《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1568-1576,共9页; 基金广西创新驱动发展专项(桂科AA17204054) 广西中烟工业有限责任公司科技项目(GXZYCX 2019H002,GXZYCX2017B005) 广西工业创新发展项目(科技20190029)。; 文摘【目的】明确一株具有烟草甲毒杀作用的苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)在醇化过程中对烟叶的影响,为烟叶仓库中应用Bt菌剂防控烟草甲的可行性和安全性评价提供参考依据。【方法】按照0.1 g Bt菌剂处理1 kg烟叶的比例作处理,以未喷施Bt菌剂的烟叶作为对照,在仓库中贮藏12个月后,每隔2个月采集醇化阶段烟叶,对总糖、还原糖、氯、总植物碱、钾、总氮和淀粉等7项常规化学成分,以及香气质、香气量、杂气、刺激性、透发性、柔细度、甜度、余味、浓度和劲头等10项感官品质进行测定和评估。同时对醇化24个月的烟叶样品使用16S rDNA扩增子测序,比较分析喷施Bt菌剂和未喷施Bt菌剂的烟叶细菌群落结构多样性变化。【结果】Bt菌剂处理后,烟叶的7项常规化学成分均未出现显著变化(P>0.05);而感官质量的5项指标出现显著性差异(P<0.05,下同),其中香气量和杂气的评吸得分表现为处理组优于对照组,香气质、透发性和甜度的评吸得分表现为对照组优于处理组;处理组和对照组的细菌种类存在明显差异,在处理组中,纲、目、科和属分类中相对丰度最高的分别为杆菌纲(Bacilli,95.9%)、芽孢杆菌目(Bacillales,95.9%)、芽孢杆菌科(Bacillaceae,96.0%)和芽孢杆菌属(Bacillus,95.9%),而在对照组中,相对丰度最高的分别为丙型变形菌纲(Gammaproteobacteria,47.6%)、肠杆菌目(Enterobacteriales,31.3%)、肠杆菌科(Enterobac-teriaceae,33.7%)和志贺氏大肠杆菌属(Escherichia-Shigella,22.9%)。处理组和对照组的Alpha多样性指数中Ob-served species指数和Chao1指数存在显著差异,处理组的细菌群落丰富度显著低于对照组,Beta多样性分析证明2组间的群落结构存在显著差异。【结论】使用苏云金芽孢杆菌处理后,烟叶中的细菌群落结构发生显著变化,但对烟叶化学成分和感官质量的影响较小,不造成烟叶品质的下降,说明在仓储中使用该菌株防控烟草甲的经济风险较小。; 关键词苏云金芽孢杆菌烟叶醇化化学成分感官质量细菌群落结构多样性; Keywords Bacillus thuringiensis tobacco leaves tobacco alcoholization chemical components sensory quality bacterial community structural diversity; 分类号 S476.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治] S572 [农业科学—烟草工业]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一株侵染掌叶半夏的大豆花叶病毒的全基因组序列测定和vsiRNA特征分析被引量：1: 4; 作者胡逸超卢晓静李璞廖咏梅何新华邹承武陈琦; 机构广西中烟工业有限责任公司技术中心广西大学农学院植物科学国家级实验教学示范中心南宁市疾病预防控制中心南宁国拓生物科技有限公司; 出处《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期3392-3399,共8页; 基金广西创新驱动发展专项(科技重大专项)(桂科AA17204054) 广西中烟科技项目(科技20190029)。; 文摘【目的】探究侵染掌叶半夏(Pinellia pedatisecta)的大豆花叶病毒(Soybean mosaicvirus,SMV)衍生的干扰小RNA(virus-derivedsmallinterferingRNA,vsiRNA)序列特征,为掌叶半夏抵御病毒的作用机制研究提供参考。【方法】以一株来自广西的具有典型病毒病症状的掌叶半夏为材料,取其褪绿斑驳的叶片采用TRIzol法提取总RNA,并进行小RNA深度测序(Small RNADeepSequencing);利用快速扩增cDNA末端(Rapid AmplificationofcDNAEnds,RACE)和分段克隆技术获得病毒的全长基因组序列,利用MEGA 7.0将其与有代表性的病毒序列构建系统发育进化树并分析亲缘关系;以克隆测序获得的基因组序列作为参考进行vsiRNA特征分析。【结果】小RNA深度测序共获得4851249条高质量的读段(reads),长度为21、22和24 nt的reads具有较高的丰度,占比分别为33.4%、13.7%和11.3%。该病毒分离物的基因组全长为9735 nt,编码3105个氨基酸,其基因组全序列与SMV HZ1分离物核苷酸序列相似性为86.93%,暂命名为SMV NN;系统发育进化树显示,SMV NN与分离自半夏的SMV HZ1分离物的亲缘关系最近。将vsiRNA定位到克隆测序后获得的SMV NN的基因组上,分析该病毒的vsiRNA特征,结果发现长度为21和22 nt的vsiRNA具有较高的丰度,病毒全基因组的正链和负链均能被vsiRNA覆盖,且分别在HC-Pro和P3蛋白编码区具有最强热点。【结论】掌叶半夏主要通过dicer样核糖核酸酶4(dicer-likeribonuclease 4,DCL4)和Argonaute蛋白1(Argonaute1,AGO1)对SMV的HC-Pro和P3蛋白编码区进行剪切,主要产生长度为21和22 nt的vsiRNA,从而抑制SMV在植株体内的复制。; 关键词掌叶半夏病毒基因组大豆花叶病毒小RNA深度测序 vsiRNA; Keywords Pinellia pedatisecta rirus genome Soybean mosaic virus small RNA deep sequencing vsiRNA; 分类号 S432 [农业科学—植物病理学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	基于线粒体基因序列的广西柑橘木虱遗传多样性及种群结构分析	邓铁军杨丽婷雷薇刘丽辉刘吉敏陈琦	《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	一株具有烟草甲幼虫毒杀作用苏云金芽孢杆菌的遗传多样性分析及cry基因鉴定	胡逸超雷薇孙建生李季刚邹克兴苏赞梁伟蔡联合陈琦邹承武	《西南农业学报》 CSCD 北大核心	2020	4	在线阅读下载PDF 职称材料
3	一株具有烟草甲毒杀作用的苏云金芽孢杆菌对烟叶的影响	胡逸超苏赞雷薇陈义昌邹克兴陈琦邹承武	《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心	2022	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	一株侵染掌叶半夏的大豆花叶病毒的全基因组序列测定和vsiRNA特征分析	胡逸超卢晓静李璞廖咏梅何新华邹承武陈琦	《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心	2021	1	在线阅读下载PDF 职称材料