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鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析
被引量:
2
1
作者
侯德富
关勇军
+5 位作者
关瑞
万恂恂
李国庆
欧阳咏梅
余艳辉
陈主初
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期841-850,共10页
NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克...
NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游-85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于-25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(3'-TTGCAG-3')的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质).本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码1种由98个氨基酸组成的蛋白质.
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关键词
NPCEDRG基因
mRNA剪接变异体
5'-RACE
3'-RACE
RT-PCR
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职称材料
湖南汉族人群TNF-α基因-308G/A多态与原发性高血压相关性研究
被引量:
2
2
作者
彭翠英
周翠兰
贺庆芝
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2011年第1期57-60,共4页
目的:研究TNF-α基因-308G/A多态与原发性高血压(EH)的相关性。方法:选择246例EH患者和208例正常对照组为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法检测TNF-α基因启动子区-308G/A多态位点等位基因以及基因型...
目的:研究TNF-α基因-308G/A多态与原发性高血压(EH)的相关性。方法:选择246例EH患者和208例正常对照组为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法检测TNF-α基因启动子区-308G/A多态位点等位基因以及基因型频率分布特点,并分析其多态与EH遗传易感性的关系。结果:EH组患者TNF-α(-308G/A)位点GG、GA、AA三种基因型的频率分别为85.0%、11.8%、3.2%;G、A两种等位基因的频率分别为90.9%、9.1%。对照组TNF-α(-308G/A)位点GG、GA、AA三种基因型的频率分别为89.4%、10.6%、0;G、A两种等位基因的频率分别为94.7%、5.3%。EH组GA、AA基因型频率显著高于对照组(P=0.028);A等位基因的频率亦明显高于对照组,患高血压的危险性增加1.729倍,95%的可信区间为1.056~2.831,差异均有统计学意义(P=0.030)。结论:TNF-α基因-308G/A位点多态与湖南汉族人群EH可能相关,A等位基因可能是EH的遗传易感基因。
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关键词
肿瘤坏死因子
原发性高血压
基因多态性
遗传易感性
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职称材料
题名
鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析
被引量:
2
1
作者
侯德富
关勇军
关瑞
万恂恂
李国庆
欧阳咏梅
余艳辉
陈主初
机构
中南
大学
湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室
中南
大学
肿瘤研究所
湖南师范
大学
医
学院
生物
化学与分子
生物
学教研室
南华大学药学与生命科学学院生物科学系
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期841-850,共10页
基金
国家自然科学基金项目(No.30772401)~~
文摘
NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的1个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.本研究对CNE2细胞所表达的NPCEDRG基因mRNA剪接变异体克隆、鉴定,发现NPCEDRG基因至少有7个转录起始位点,其中NM_032316的TSS位于ATG上游-85 nt处,AF538150和AK094248的TSS位于-25 nt处;AF538150不存在第2外显子中6核苷酸序列(3'-TTGCAG-3')的缺失,其CDs为516 bp,编码1种由171个氨基酸组成的蛋白质(而非GenBank中公布的CDs为510 bp,1种由169个氨基酸组成的蛋白质).本研究成功克隆得到1种新的NPCEDRG基因的mRNA剪接变异体V2,其TSS位于-23 nt处,其CDs为297 bp,编码1种由98个氨基酸组成的蛋白质.
关键词
NPCEDRG基因
mRNA剪接变异体
5'-RACE
3'-RACE
RT-PCR
Keywords
NPCEDRG
alternative splicing variants
5′-RACE
3′-RACE
RT-PCR
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
湖南汉族人群TNF-α基因-308G/A多态与原发性高血压相关性研究
被引量:
2
2
作者
彭翠英
周翠兰
贺庆芝
机构
南华大学药学与生命科学学院生物科学系
出处
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2011年第1期57-60,共4页
基金
国家863基金项目(2007AA02Z4A7)
文摘
目的:研究TNF-α基因-308G/A多态与原发性高血压(EH)的相关性。方法:选择246例EH患者和208例正常对照组为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法检测TNF-α基因启动子区-308G/A多态位点等位基因以及基因型频率分布特点,并分析其多态与EH遗传易感性的关系。结果:EH组患者TNF-α(-308G/A)位点GG、GA、AA三种基因型的频率分别为85.0%、11.8%、3.2%;G、A两种等位基因的频率分别为90.9%、9.1%。对照组TNF-α(-308G/A)位点GG、GA、AA三种基因型的频率分别为89.4%、10.6%、0;G、A两种等位基因的频率分别为94.7%、5.3%。EH组GA、AA基因型频率显著高于对照组(P=0.028);A等位基因的频率亦明显高于对照组,患高血压的危险性增加1.729倍,95%的可信区间为1.056~2.831,差异均有统计学意义(P=0.030)。结论:TNF-α基因-308G/A位点多态与湖南汉族人群EH可能相关,A等位基因可能是EH的遗传易感基因。
关键词
肿瘤坏死因子
原发性高血压
基因多态性
遗传易感性
Keywords
Tumor necrosis factor
Essential hypertension
Gene polymorphism
Hereditary susceptibility
分类号
R544.1 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鼻咽癌细胞系CNE2中NPCEDRG基因mRNA剪接变异体分析
侯德富
关勇军
关瑞
万恂恂
李国庆
欧阳咏梅
余艳辉
陈主初
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
湖南汉族人群TNF-α基因-308G/A多态与原发性高血压相关性研究
彭翠英
周翠兰
贺庆芝
《中国临床药理学与治疗学》
CAS
CSCD
2011
2
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