期刊导航
期刊开放获取
上海教育软件发展有限公..
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
1
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
苏山猪和巴克夏猪全基因组ROH检测和选择信号分析
被引量：
2
1
作者
戴超辉
崔乐康
+8 位作者
李辉
赵为民
付言峰
李碧侠
王学敏
廖超
陈彦羽
包文斌
程金花
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期5452-5463,共12页
旨在明确苏山猪群体和巴克夏猪群体的遗传变异位点和多态信息,本研究首先对43个苏山猪样本和21个巴克夏猪样本进行DNA提取,然后利用“中芯一号”50K SNP芯片对DNA的SNP位点进行检测;使用Plink软件对SNP位点进行主成分分析;使用DetectRUN...
旨在明确苏山猪群体和巴克夏猪群体的遗传变异位点和多态信息,本研究首先对43个苏山猪样本和21个巴克夏猪样本进行DNA提取,然后利用“中芯一号”50K SNP芯片对DNA的SNP位点进行检测;使用Plink软件对SNP位点进行主成分分析;使用DetectRUNS软件包对样本进行全基因组ROH检测;选用3种方法(ROH、CLR和iHS)对选择信号进行分析。本研究总共鉴定到苏山猪42282个SNPs位点和巴克夏猪27718个SNPs位点。其中,苏山猪和巴克夏猪均被划分为3个家系。本研究在苏山猪中共检测到2071个ROH片段,F_(ROH)平均值为0.096。巴克夏猪中共检测到1853个ROH片段,F_(ROH)平均值为0.199。在苏山猪和巴克夏猪群体中分别检测到4个和40个高频ROH区域,分别注释到8个和103个基因,通过富集分析鉴定了50个显著的候选基因。另外,通过ROH、CLR和iHS共3种选择信号分析方法,对苏山猪和巴克夏猪的选择信号区域进行了鉴定,发现有42个基因可能受到选择。本研究初步揭示了苏山猪和巴克夏猪的基因组SNP图谱,并通过高频ROH分析和选择信号检测鉴定到一些可能影响猪的生长发育、肉质、营养和一般抗病力的基因,为苏山猪和巴克夏猪的选育利用提供了理论基础。
展开更多
关键词
猪
ROH
CLR
IHS
选择信号
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
苏山猪和巴克夏猪全基因组ROH检测和选择信号分析
被引量：
2
1
作者
戴超辉
崔乐康
李辉
赵为民
付言峰
李碧侠
王学敏
廖超
陈彦羽
包文斌
程金花
机构
江苏省农业科学院畜牧研究所/农业农村部种养结合重点实验室/江苏省农业种质资源保护与利用平台
扬州大学动物科学与
技术
学院
南京瑞源生物技术有限公司
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期5452-5463,共12页
基金
江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS[2021]099)
江苏省青年基金项目(BK20230753)
国家生猪产业技术体系(CARS-PIG-35)。
文摘
旨在明确苏山猪群体和巴克夏猪群体的遗传变异位点和多态信息,本研究首先对43个苏山猪样本和21个巴克夏猪样本进行DNA提取,然后利用“中芯一号”50K SNP芯片对DNA的SNP位点进行检测;使用Plink软件对SNP位点进行主成分分析;使用DetectRUNS软件包对样本进行全基因组ROH检测;选用3种方法(ROH、CLR和iHS)对选择信号进行分析。本研究总共鉴定到苏山猪42282个SNPs位点和巴克夏猪27718个SNPs位点。其中,苏山猪和巴克夏猪均被划分为3个家系。本研究在苏山猪中共检测到2071个ROH片段,F_(ROH)平均值为0.096。巴克夏猪中共检测到1853个ROH片段,F_(ROH)平均值为0.199。在苏山猪和巴克夏猪群体中分别检测到4个和40个高频ROH区域,分别注释到8个和103个基因,通过富集分析鉴定了50个显著的候选基因。另外,通过ROH、CLR和iHS共3种选择信号分析方法,对苏山猪和巴克夏猪的选择信号区域进行了鉴定,发现有42个基因可能受到选择。本研究初步揭示了苏山猪和巴克夏猪的基因组SNP图谱,并通过高频ROH分析和选择信号检测鉴定到一些可能影响猪的生长发育、肉质、营养和一般抗病力的基因,为苏山猪和巴克夏猪的选育利用提供了理论基础。
关键词
猪
ROH
CLR
IHS
选择信号
Keywords
pig
ROH
CLR
iHS
selection signal
分类号
S828.2 [农业科学—畜牧学]
在线阅读
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苏山猪和巴克夏猪全基因组ROH检测和选择信号分析
戴超辉
崔乐康
李辉
赵为民
付言峰
李碧侠
王学敏
廖超
陈彦羽
包文斌
程金花
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
