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用cDNA芯片技术筛选中华绒鳌蟹卵巢发育相关基因
1
作者 马长艳 郭豫杰 周开亚 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期76-80,共5页
为了克隆中华绒螯蟹卵巢发育相关基因,我们构建了中华绒螯蟹卵巢差减cDNA文库.本研究用cDNA芯片技术对中华绒螯蟹卵巢差减cDNA文库进行了初步筛选,并从cDNA芯片筛选的正向差减文库中随机选取50个克隆进行序列测定.结果共获得2倍以上差... 为了克隆中华绒螯蟹卵巢发育相关基因,我们构建了中华绒螯蟹卵巢差减cDNA文库.本研究用cDNA芯片技术对中华绒螯蟹卵巢差减cDNA文库进行了初步筛选,并从cDNA芯片筛选的正向差减文库中随机选取50个克隆进行序列测定.结果共获得2倍以上差异表达克隆167个,其中Ⅲ期高表达克隆104个,Ⅱ期高表达克隆63个.正向差减文库中共获得7个独立的EST(expressed sequence tag,EST).同源性分析结果表明,这些EST皆为新的EST,dbEST登录号分别为:CA591892、CA591893、CA591894、CA591895、CA591896、CA591897和CA591898.本研究结果为进一步克隆中华绒螯蟹卵巢发育相关基因的全长cDNA序列并研究其功能,阐明中华绒螯蟹卵巢发育的分子机理奠定了重要的前期工作基础. 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 卵巢 抑制性差减杂交 CDNA芯片 表达序列标签
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基于线粒体基因Cytb和COI的蝗科中五亚科分子系统发育关系分析(直翅目:蝗总科)(英文) 被引量：12
2
作者 王乃馨 封霞 +2 位作者 蒋国芳 方宁 轩文娟 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1187-1195,共9页
本研究基于Cytb基因和COI基因的部分序列来推断17种蝗虫之间的系统发育关系。这17种蝗虫均采自国内,代表了蝗科(Acrididae)5个亚科:黑蝗亚科(Melanoplinae)、斑腿蝗亚科(Catantopinae)、刺胸蝗亚科(Cyrtacanthacridinae)、斑翅蝗亚科(Oe... 本研究基于Cytb基因和COI基因的部分序列来推断17种蝗虫之间的系统发育关系。这17种蝗虫均采自国内,代表了蝗科(Acrididae)5个亚科:黑蝗亚科(Melanoplinae)、斑腿蝗亚科(Catantopinae)、刺胸蝗亚科(Cyrtacanthacridinae)、斑翅蝗亚科(Oedipodinae)和大足蝗亚科(Gomphocerinae)。采用联合序列方法进行分析,结果显示:Cytb和COI联合序列长度为1998bp,其中A和T总含量为72.13%,G和C总含量为27.87%。联合序列共包含了889个保守位点,1109个变异位点,在这些变异位点中有838个简约信息位点。系统发生树采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)进行构建。使用蜢总科的变色乌蜢Erianthus versicolor和Erianthus sp.两个种作为外群。结果表明:大足蝗亚科和斑腿蝗亚科的单系性没有得到支持。斑翅蝗亚科内部各种聚成一个大支,在本研究中该亚科的单系性得到支持,与前人的研究结论相同。大足蝗亚科、斑腿蝗亚科、刺胸蝗亚科和黑蝗亚科这4科关系非常近,可以考虑将其合并为一个亚科。同时,我们发现基于Cytb和COI基因联合序列推断蝗科内各亚科间的系统发生关系并不十分可靠。 展开更多
关键词 直翅目 蝗科 线粒体DNA CYTB基因 COI基因 系统发育
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对虾白斑综合症病毒的概述 被引量：14
3
作者 马晓燕 李鹏 +1 位作者 严洁 周开亚 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期90-100,共11页
白斑综合症病毒(White spot syndrome virus,WSSV),已在全球范围内成为对虾养殖业中最普遍、分布最广、最致命的病毒.但目前仍没有一种有效可行的措施来控制该病毒的发生和扩散.自1993年发现该病毒至今,国内外学者对对虾白斑综合症病毒... 白斑综合症病毒(White spot syndrome virus,WSSV),已在全球范围内成为对虾养殖业中最普遍、分布最广、最致命的病毒.但目前仍没有一种有效可行的措施来控制该病毒的发生和扩散.自1993年发现该病毒至今,国内外学者对对虾白斑综合症病毒的认识也越来越全面深入,取得了一些突破性的进展.本文全面综述了近年来对对虾白斑综合症病毒的认识和研究进展.这些信息将会拓展我们的认知,可能有助于发展有效的预防策略或治疗措施. 展开更多
关键词 白斑综合症病毒 综述 研究进展 预防策略
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变色树蜥(Calotes versicolor)选择体温、热耐受性及温度对食物同化的影响 被引量：7
4
作者 邱清波 曾小飚 +1 位作者 林隆慧 计翔 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期1738-1744,共7页
研究变色树蜥（Calotes versicolor）的选择体温、热耐受性、温度对食物同化的影响。结果显示：幼体的选择体温、临界高温和临界低温的平均值分别为32.6、41.7℃和7.7℃;成体的选择体温、临界高温和临界低温的平均值分别为33.1、42.0℃... 研究变色树蜥（Calotes versicolor）的选择体温、热耐受性、温度对食物同化的影响。结果显示：幼体的选择体温、临界高温和临界低温的平均值分别为32.6、41.7℃和7.7℃;成体的选择体温、临界高温和临界低温的平均值分别为33.1、42.0℃和8.2℃。②环境温度在26～34℃时,对变色树蜥食物通过时间和摄入能有显著的影响;对表观消化系数（ADC）和同化效率（AE）无显著的影响;在28～34℃时食物通过时间随温度升高而缩短;在26、28℃和30℃时,摄入能小于更高温度的对应值。 展开更多
关键词 鬣蜥科 变色树蜥 选择体温 热耐受性 食物同化
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月季ISSR反应体系的优化 被引量：10
5
作者 金凤 陈崇顺 +3 位作者 邹爱兰 曹伟杰 瞿大枞 杨燕燕 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2006年第1期72-75,共4页
以萨曼莎月季为材料,对影响ISSR-PCR扩增的主要影响因子进行了优化,建立了适于月季的ISSR反应体系:25μl反应体积中,1×Buffer、1.5 mmol/L Mg2+、1 U Taq DNA聚合酶、0.6μmol/L引物、0.48 mmol/LdNTPs、20 ng模板DNA;并将该优化... 以萨曼莎月季为材料,对影响ISSR-PCR扩增的主要影响因子进行了优化,建立了适于月季的ISSR反应体系:25μl反应体积中,1×Buffer、1.5 mmol/L Mg2+、1 U Taq DNA聚合酶、0.6μmol/L引物、0.48 mmol/LdNTPs、20 ng模板DNA;并将该优化体系应用于其他5个ISSR引物和6个月季品种,证实了该体系的适用性和稳定性。 展开更多
关键词 月季 ISSR 反应体系优化
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中国臭蛙类一新种 被引量：10
6
作者 陈晓虹 周开亚 郑光美 《北京师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期606-609,F0002,共5页
通过形态学比较和12S、16S mtDNA序列比对分析,结果显示分布于浙江省西天目山的花臭蛙(Odorrana schmackeri Boettger,1892)与地模产地花臭蛙以及花臭蛙2个新隐种南江臭蛙和黄岗臭蛙之间存在显著差异,其主要鉴别特征为:1)雌性成体体长... 通过形态学比较和12S、16S mtDNA序列比对分析,结果显示分布于浙江省西天目山的花臭蛙(Odorrana schmackeri Boettger,1892)与地模产地花臭蛙以及花臭蛙2个新隐种南江臭蛙和黄岗臭蛙之间存在显著差异,其主要鉴别特征为:1)雌性成体体长约为雄性的1.75倍;2)头长大于头宽,吻端钝尖;3)后肢前伸胫跗关节达眼鼻间;4)趾间全蹼,第4趾两侧及第2、3趾内侧蹼以缘膜达趾吸盘基部;5)背部褐色斑稀疏,形状、大小、排列不规则;6)四肢背面浅褐色横纹宽窄不一,胫部横纹4或5条;7)雄性具1对咽侧下外声囊,背面有肉粉色雄性线,第1指具乳白色婚垫;8)雌性成熟卵动物极棕褐色、植物极米黄色,卵径2.17 mm左右.故将浙江省西天目山区的花臭蛙鉴定为一新种——天目臭蛙(Odorranatianmuii sp.nov.). 展开更多
关键词 两栖纲 无尾目 蛙科 臭蛙类 新种 中国
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中华绒鳌蟹卵巢发育相关的新基因EJO3的克隆和特征分析(英文) 被引量：1
7
作者 马长艳 郭豫杰 周开亚 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期71-75,共5页
运用了抑制性差减杂交和cDNA芯片技术鉴定中华绒鳌蟹卵巢发育相关基因,并用5′和3′RACE的方法克隆了一个与Ⅱ期相比在卵巢发育的Ⅲ期高表达的新基因EJO3(GenBank登录号:AY185919).EJO3基因的开放阅读框(ORF)长1368 bp,编码455个氨基酸... 运用了抑制性差减杂交和cDNA芯片技术鉴定中华绒鳌蟹卵巢发育相关基因,并用5′和3′RACE的方法克隆了一个与Ⅱ期相比在卵巢发育的Ⅲ期高表达的新基因EJO3(GenBank登录号:AY185919).EJO3基因的开放阅读框(ORF)长1368 bp,编码455个氨基酸.从氨基酸序列推算的EJO3的等电点和相对分子质量分别为5.79和50 000.生物信息学分析表明,EJO3可能是一个含有VWD结构域的分泌蛋白.EJO3在Ⅱ期和Ⅲ期卵巢的差异表达用Northern blot进行了进一步验证.组织表达谱分析表明EJO3在卵巢高表达,在肠、心脏、肌肉和肝胰腺中弱表达或不表达.本研究结果为进一步深入研究中华绒鳌蟹卵巢发育的分子机制奠定了重要的前期工作基础. 展开更多
关键词 抑制性差减杂交 CDNA芯片 中华绒鳌蟹 卵巢 EJO3
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中华绒螯蟹内源性白斑综合症病毒基因EjsWSSV的克隆与鉴定(英文)
8
作者 解文利 李鹏 +1 位作者 靳芳草 周开亚 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期63-72,共10页
基于已获得的表达序列标签序列,应用RACE技术从中华绒螯蟹基因组中获得了一个白斑综合症病毒基因(EjsWSSV)的全长cDNA序列,全长为3 864 bp并包含一个3 732 bp的开放阅读框,编码一个138.25 kDa的含1 243个氨基酸的多肽,编码的氨基酸序列... 基于已获得的表达序列标签序列,应用RACE技术从中华绒螯蟹基因组中获得了一个白斑综合症病毒基因(EjsWSSV)的全长cDNA序列,全长为3 864 bp并包含一个3 732 bp的开放阅读框,编码一个138.25 kDa的含1 243个氨基酸的多肽,编码的氨基酸序列包含一个VWA结构域.通过序列比对、序列结构比较和一些生物信息学预测分析,表明EjsWSSV蛋白序列与白斑综合症病毒基因组的ORF16具有高同源性,它不含有信号肽和跨膜区,为非分泌型和α-螺旋型蛋白,可能定位于细胞质.通过PCR检测验证,EjsWSSV基因可能为内源性病毒基因. 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 白斑综合症病毒 CDNA末端快速扩增 CDNA克隆 序列分析
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中华绒螯蟹卵巢EJO1基因在大肠杆菌BL21(DE3)中的表达
9
作者 陆钟岩 冯金叶 +3 位作者 宋大祥 马长艳 郭豫杰 周开亚 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2006年第5期3-6,共4页
扩增中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)卵巢EJO1基因(GenBank检索号:AY185917)的cDNA全序列得到编码区序列,并将其插入原核表达载体pET28b中,构建成表达质粒pET28b-EJO1。该表达质粒在大肠杆菌(Esche-richia coli)BL21(DE3)中经IPTG诱导表... 扩增中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)卵巢EJO1基因(GenBank检索号:AY185917)的cDNA全序列得到编码区序列,并将其插入原核表达载体pET28b中,构建成表达质粒pET28b-EJO1。该表达质粒在大肠杆菌(Esche-richia coli)BL21(DE3)中经IPTG诱导表达,得到EJO1-H IS6融合蛋白。SDS-PAGE电泳分析表明,该融合蛋白的相对分子质量约为32 000。经镍离子柱亲和层析进一步纯化得到纯度较高的EJO1-H IS6融合蛋白。 展开更多
关键词 中华绒螯蟹 EJ01基因 原核表达 EJ01-HIS6融合蛋白
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无蹼壁虎6个鸟类Z染色体连锁基因的cDNA克隆和序列分析
10
作者 夏文君 袁亚辉 +3 位作者 贺晓烈 李鹏 严洁 周开亚 《南京师大学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期128-132,共5页
利用RT-PCR技术从无蹼壁虎中获得了6个鸟类Z染色体连锁基因的cDNA片段序列。与铅山壁虎的同源基因序列相比，除CHD1-5＆#39;端序列中有3 bp的缺失外，其他基因序列均具有相同的核苷酸和氨基酸长度，且核苷酸序列和氨基酸序列的保守性均... 利用RT-PCR技术从无蹼壁虎中获得了6个鸟类Z染色体连锁基因的cDNA片段序列。与铅山壁虎的同源基因序列相比，除CHD1-5＆#39;端序列中有3 bp的缺失外，其他基因序列均具有相同的核苷酸和氨基酸长度，且核苷酸序列和氨基酸序列的保守性均非常高（97%~100%）。在与有鳞目、龟鳖目和鳄目的其他已知序列比较时，发现6个基因的8个片段有不同程度的同源性，其中GHR基因的同源性最低，与该基因片段在进化分析中较高的ω值（ Ka/Ks）是一致的。性染色体连锁基因的克隆和染色体定位，将有助于进一步了解壁虎类甚至高等脊椎动物不同类型性染色体的起源和进化。 展开更多
关键词 无蹼壁虎 性别决定 Z连锁基因
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