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基因芯片检测拉米夫定引起的乙型肝炎病毒基因YMDD变异的研究
被引量：
3
1
作者
曹新民
赵伟
+5 位作者
刘伟
刘全俊
张林
张汉荣
刘新珏
周镇先
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期637-640,共4页
目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)变异基因诊断芯片,对拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中出现的肝炎病毒P基因区YMDD变异进行快速准确的检测诊断。方法:设计特异性寡核苷酸探针。用点样法制备HBV变异基因诊断芯片。选择住院患者30例服用拉米夫...
目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)变异基因诊断芯片,对拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中出现的肝炎病毒P基因区YMDD变异进行快速准确的检测诊断。方法:设计特异性寡核苷酸探针。用点样法制备HBV变异基因诊断芯片。选择住院患者30例服用拉米夫定后,HBVDNA转阴[<500拷贝(opies/ml)]68周后又反跳≥5000copies/ml的患者进行基因芯片杂交检测。同时用PCR直接测序法对30例患者血清标本进行双盲HBVDNA聚合酶活性区域测序对照。结果:30例服药后HBVDNA反跳患者中基因芯片测得HBVYMDD变异21例,其中YVDD变异11例,YIDD变异10例。直接序列测定发现有核苷酸A741变为G,使氨基酸由蛋氨酸552变为缬氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YVDD)11例,有6例核苷酸A669变为C,使氨基酸由亮氨酸528变为蛋氨酸;核苷酸G743变为T,使氨基酸由蛋氨酸552变为异亮氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YIDD)10例。其中有3例伴有核苷酸T781变为C,使氨基酸由亮氨酸565变为脯氨酸。其结果与基因芯片完全一致。结论:HBV变异基因诊断芯片可以同时检测YVDD、YIDD变异,同PCR直接测序法比较,准确率达100%,无假阳性。
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关键词
基因芯片
拉米夫定
病毒变异
乙型肝炎病毒
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职称材料
检测GPC3和GP73两种方法的比较及与临床的相关性
被引量：
5
2
作者
马洁
汪顺才
+5 位作者
朱梦琪
马久明
周华
虞腊青
杨永峰
经继生
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2015年第5期707-710,共4页
采用ELISA法检测70例标本(肝癌组39例、肝硬化组31例)血清中磷脂酰肌醇蛋白聚糖3(GPC3)和高尔基体蛋白73(GP73)的水平,qRT-PCR法检测相同标本外周血单个核细胞(PBMC)中GPC3 mRNA和GP73 mRNA的相对表达量。结果显示肝癌组血清中GPC3和GP7...
采用ELISA法检测70例标本(肝癌组39例、肝硬化组31例)血清中磷脂酰肌醇蛋白聚糖3(GPC3)和高尔基体蛋白73(GP73)的水平,qRT-PCR法检测相同标本外周血单个核细胞(PBMC)中GPC3 mRNA和GP73 mRNA的相对表达量。结果显示肝癌组血清中GPC3和GP73表达量显著高于肝硬化组(P<0.0 001);两组间PBMC中GPC3 mRNA和GP73 mRNA水平差异无统计学意义;相关性分析结果显示,肝硬化组和肝癌组血清中GPC3、GP73含量均有正相关性(P<0.01)。血清中GPC3和GP73的水平均能预测原发性肝癌,且GPC3和GP73的水平具有一定的相关性;PBMC中GPC3 mRNA和GP73 mRNA的表达水平不能很好的区分肝癌组与肝硬化组,提示ELISA法检测血清中GPC3和GP73的表达水平是临床预测原发性肝癌的首选方法。
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关键词
原发性肝癌
高尔基体蛋白73
磷脂酰肌醇蛋白聚糖3
ELISA法
qRT—PCR法
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职称材料
题名
基因芯片检测拉米夫定引起的乙型肝炎病毒基因YMDD变异的研究
被引量：
3
1
作者
曹新民
赵伟
刘伟
刘全俊
张林
张汉荣
刘新珏
周镇先
机构
东南大学医学院附属
南京市第二医院肝内科
东南大学分子与生物电子国家重点实验室
出处
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第9期637-640,共4页
基金
江苏省科技厅重点资助项目
江苏省卫生厅重点资助项目(BS2000028)
文摘
目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)变异基因诊断芯片,对拉米夫定治疗慢性乙型肝炎过程中出现的肝炎病毒P基因区YMDD变异进行快速准确的检测诊断。方法:设计特异性寡核苷酸探针。用点样法制备HBV变异基因诊断芯片。选择住院患者30例服用拉米夫定后,HBVDNA转阴[<500拷贝(opies/ml)]68周后又反跳≥5000copies/ml的患者进行基因芯片杂交检测。同时用PCR直接测序法对30例患者血清标本进行双盲HBVDNA聚合酶活性区域测序对照。结果:30例服药后HBVDNA反跳患者中基因芯片测得HBVYMDD变异21例,其中YVDD变异11例,YIDD变异10例。直接序列测定发现有核苷酸A741变为G,使氨基酸由蛋氨酸552变为缬氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YVDD)11例,有6例核苷酸A669变为C,使氨基酸由亮氨酸528变为蛋氨酸;核苷酸G743变为T,使氨基酸由蛋氨酸552变为异亮氨酸(氨基酸基序由YMDD变为YIDD)10例。其中有3例伴有核苷酸T781变为C,使氨基酸由亮氨酸565变为脯氨酸。其结果与基因芯片完全一致。结论:HBV变异基因诊断芯片可以同时检测YVDD、YIDD变异,同PCR直接测序法比较,准确率达100%,无假阳性。
关键词
基因芯片
拉米夫定
病毒变异
乙型肝炎病毒
Keywords
gene chip
lamivudine
HBV YMDD motif mutation
HBV
分类号
R575.2 [医药卫生—消化系统]
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职称材料
题名
检测GPC3和GP73两种方法的比较及与临床的相关性
被引量：
5
2
作者
马洁
汪顺才
朱梦琪
马久明
周华
虞腊青
杨永峰
经继生
机构
江苏大学医学院临床生化检验系
江苏省句容市人民
医院
感染病科
复旦大学附属华山
医院
传染科
肝
病研究室
南京市第二医院肝内科
出处
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2015年第5期707-710,共4页
基金
江苏省卫生厅自然科学基金项目(编号:Y201311)
江苏大学临床科技发展基金项目(编号:JLY20120103)
文摘
采用ELISA法检测70例标本(肝癌组39例、肝硬化组31例)血清中磷脂酰肌醇蛋白聚糖3(GPC3)和高尔基体蛋白73(GP73)的水平,qRT-PCR法检测相同标本外周血单个核细胞(PBMC)中GPC3 mRNA和GP73 mRNA的相对表达量。结果显示肝癌组血清中GPC3和GP73表达量显著高于肝硬化组(P<0.0 001);两组间PBMC中GPC3 mRNA和GP73 mRNA水平差异无统计学意义;相关性分析结果显示,肝硬化组和肝癌组血清中GPC3、GP73含量均有正相关性(P<0.01)。血清中GPC3和GP73的水平均能预测原发性肝癌,且GPC3和GP73的水平具有一定的相关性;PBMC中GPC3 mRNA和GP73 mRNA的表达水平不能很好的区分肝癌组与肝硬化组,提示ELISA法检测血清中GPC3和GP73的表达水平是临床预测原发性肝癌的首选方法。
关键词
原发性肝癌
高尔基体蛋白73
磷脂酰肌醇蛋白聚糖3
ELISA法
qRT—PCR法
Keywords
HCC
GPC3
GP73
ELISA
qRT-PCR
分类号
R512 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基因芯片检测拉米夫定引起的乙型肝炎病毒基因YMDD变异的研究
曹新民
赵伟
刘伟
刘全俊
张林
张汉荣
刘新珏
周镇先
《南京医科大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2005
3
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职称材料
2
检测GPC3和GP73两种方法的比较及与临床的相关性
马洁
汪顺才
朱梦琪
马久明
周华
虞腊青
杨永峰
经继生
《安徽医科大学学报》
CAS
北大核心
2015
5
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