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题名基于三个干扰素刺激基因的肝细胞癌预后模型
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作者
王硕
吴俊楠
张旭
曹胤
王忠夏
江春平
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机构
南京大学医学院附属鼓楼医院肝胆与肝移植外科
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出处
《肝胆外科杂志》
2024年第6期459-468,共10页
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基金
江苏省初步研发计划(BE2022840)
山东省实验室项目(SYS202202)资助。
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文摘
目的构建基于干扰素刺激基因(Interferon-stimulated genes,ISGs)的肝细胞癌预后模型,并分析其与肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后、肿瘤微环境和抗肿瘤药物治疗之间的关系。方法从TCGA和ICGC数据库下载HCC的转录组数据和相关临床数据。将HCC组织与癌旁组织差异表达的基因和与预后相关的ISGs取交集,使用LASSO回归分析构建ISGs相关预后模型。将患者分为高风险和低风险两组,具体分析不同风险组与患者临床数据、免疫浸润以及治疗敏感度等方面的联系,使用Q-PCR验证评分相关ISGs在人正常肝细胞系和肿瘤细胞系中的差异表达。结果我们建立了首个基于ISGs的HCC新型三基因风险评分模型,并将风险评分证明为HCC患者的独立预后因素。基于ICGC的外部验证表明了该模型的预测效力,除此之外,它对HCC患者的总体生存期(Overall Survival,OS)、无进展生存期(Progression-free Survival,PFS)、疾病特异性生存期(Disease-specific Survival,DSS)、无病生存期(Disease-free Survival,DFS)也有较好的预测能力。进一步的研究表明,高风险评分(High risk score,HR)和较差的预后相关,其特征是较差的临床病理因素,较高的干性评分、肿瘤突变负荷以及共同淋巴样祖细胞、CD4+记忆T细胞、Th2 CD4+T细胞的浸润水平,伴有氧化磷酸化,脂肪生成信号通路的显著激活,并且HR组的肿瘤免疫功能障碍和排斥(Tumor immune dysfunction and exclusion,TIDE)评分评分较低,对不同抗肿瘤药物敏感性较好。最后我们使用Q-PCR验证了与较差预后相关的BUB1和NDC80在肿瘤细胞系中的高表达,以及与较好预后相关的SOCS2在肿瘤细胞系中的低表达。结论本研究构建的三基因预后模型可以用于预测HCC患者的预后,免疫微环境,信号通路,肿瘤突变和药物敏感性,这可能为改善HCC的预后和治疗策略提供新的见解。
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关键词
生物信息学
干扰素刺激基因
肝细胞癌
预后模型
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Keywords
bioinformatics
interferon stimulated genes
hepatocellular carcinoma
prognostic models
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分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
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题名双原发肝细胞癌-胆管细胞癌手术切除1例
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作者
马虎成
吴星宇
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机构
南京大学医学院附属鼓楼医院肝胆与肝移植外科
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出处
《中国现代普通外科进展》
CAS
2023年第8期667-669,共3页
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文摘
1病例资料患者男,61岁。因“反复发热1月半余”收入我院感染科。既往有乙肝病史和腹腔镜胆囊切除手术史。查体:未及明显阳性体征。实验室检查:血常规正常,血培养阴性,ALT 33.6 U/L,AST 41.4 U/L,ALP 228.3 U/L,GGT 137.3 U/L,血清铁蛋白:383.80 ng/mL,肝癌异常凝血酶原(PIVKA-Ⅱ)243.58 mAU/mL,HBsAg 182.00 IU/mL,HBeAb 195.91 C.O.I。腹部增强CT示:肝脏右叶见多发类圆形稍低密度影,边缘模糊,较大者直径6.0 cm,增强后轻度、不均匀强化;胆囊未见显示(图1)。
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关键词
双原发肝细胞癌-胆管细胞癌
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分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
R735.8
[医药卫生—肿瘤]
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