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微滴式数字PCR在检测胃腺癌和结直肠腺癌NTRK基因融合中的应用
1
作者
刘彬彬
濮晓红
+1 位作者
付尧
张东英
《临床与实验病理学杂志》
CAS
北大核心
2024年第10期1052-1058,共7页
目的评估微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)应用于NTRK基因融合检测的可行性。方法回顾性分析830例原发性结直肠腺癌和560例胃腺癌样本,分别运用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交(FISH)技术检测石蜡包埋肿瘤组织中pan-TRK蛋白...
目的评估微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)应用于NTRK基因融合检测的可行性。方法回顾性分析830例原发性结直肠腺癌和560例胃腺癌样本,分别运用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交(FISH)技术检测石蜡包埋肿瘤组织中pan-TRK蛋白表达情况以及NTRK1/2/3基因断裂情况。FISH及IHC阳性样本进一步行二代测序(NGS)检测及ddPCR检测。结果所有石蜡包埋肿瘤样本均成功进行IHC和FISH检测。FISH或IHC阳性样本合计26例,其中FISH阳性21例,IHC阳性18例。26例阳性样本进一步行RNA Seq NGS、DNA Seq NGS及ddPCR检测。DNA Seq NGS合计检测到14例NTRK基因融合,2例扩增。RNA Seq NGS合计检测到3例NTRK基因融合,ddPCR检测结果与RNA Seq NGS完全一致。结论ddPCR可有效区分FISH和DNA Seq NGS检测为NTRK非典型融合的结直肠腺癌和胃腺癌病例,可以作为除FISH之外NTRK基因初筛方法的补充。
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关键词
胃肠道腺癌
NTRK基因融合
微滴式数字PCR
荧光原位杂交
免疫组织化学
二代测序
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职称材料
题名
微滴式数字PCR在检测胃腺癌和结直肠腺癌NTRK基因融合中的应用
1
作者
刘彬彬
濮晓红
付尧
张东英
机构
南京
中医药
大学
附属
中西医结合
医院
病理科
江苏省中医药研究院
南京大学医学院附属鼓楼医院/南京鼓楼医院病理科
徐州市中心
医院
病理
诊断中心
出处
《临床与实验病理学杂志》
CAS
北大核心
2024年第10期1052-1058,共7页
文摘
目的评估微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)应用于NTRK基因融合检测的可行性。方法回顾性分析830例原发性结直肠腺癌和560例胃腺癌样本,分别运用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交(FISH)技术检测石蜡包埋肿瘤组织中pan-TRK蛋白表达情况以及NTRK1/2/3基因断裂情况。FISH及IHC阳性样本进一步行二代测序(NGS)检测及ddPCR检测。结果所有石蜡包埋肿瘤样本均成功进行IHC和FISH检测。FISH或IHC阳性样本合计26例,其中FISH阳性21例,IHC阳性18例。26例阳性样本进一步行RNA Seq NGS、DNA Seq NGS及ddPCR检测。DNA Seq NGS合计检测到14例NTRK基因融合,2例扩增。RNA Seq NGS合计检测到3例NTRK基因融合,ddPCR检测结果与RNA Seq NGS完全一致。结论ddPCR可有效区分FISH和DNA Seq NGS检测为NTRK非典型融合的结直肠腺癌和胃腺癌病例,可以作为除FISH之外NTRK基因初筛方法的补充。
关键词
胃肠道腺癌
NTRK基因融合
微滴式数字PCR
荧光原位杂交
免疫组织化学
二代测序
Keywords
gastrointestinal adenocarcinoma
NTRK fusion
ddPCR
FISH
immunohistochemistry
NGS
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
R735.3 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
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被引量
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1
微滴式数字PCR在检测胃腺癌和结直肠腺癌NTRK基因融合中的应用
刘彬彬
濮晓红
付尧
张东英
《临床与实验病理学杂志》
CAS
北大核心
2024
0
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