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基于生物信息学方法分析心肌梗死大鼠miRNA芯片
被引量:
3
1
作者
姚道敏
谢亮
+2 位作者
宫剑滨
朱静
刘晶
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期673-680,共8页
目的筛选大鼠梗死心肌组织microarray芯片中差异表达的miRNA,预测其互作lncRNA和靶基因,探索心肌梗死潜在的病理机制。方法结扎左前降支冠状动脉建立大鼠心梗模型。应用TRIzol法提取梗死左心室心肌区总RNA进行芯片检测。用生物信息学方...
目的筛选大鼠梗死心肌组织microarray芯片中差异表达的miRNA,预测其互作lncRNA和靶基因,探索心肌梗死潜在的病理机制。方法结扎左前降支冠状动脉建立大鼠心梗模型。应用TRIzol法提取梗死左心室心肌区总RNA进行芯片检测。用生物信息学方法找出可能存在的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果19个明显差异表达的miRNAs中8个miRNAs(miR-21、miR-132、miR-222、miR-223-3p、miR-146a/b、miR-181b、miR-449a-5p、miR-122)已被证明是治疗心梗的候选分子,7个miRNAs(miR-365-5p、miR-490-5p、miR-6333、miR-30c-1-3p、miR-3591、miR-3596c、miR-877)是否与心肌梗死有关未知。心肌梗死发生发展中可能存在几条新的lncRNA-miRNA-mRNA作用机制。ENSRNOT00000076620-miR-146b-5p-STAT3/Rnf7/Qrsl1可能参与梗死心肌细胞的凋亡和线粒体损伤过程。ENSRNOT00000071991-miR-122-Deptor可能抑制心肌细胞自噬的发生,加剧心肌梗死的过程。NR_132625-miR-21-3P/miR-18a-5p-Coq5/Acsl1/Tmem65可能参与心肌梗死线粒体损伤过程。结论通过心肌梗死大鼠miRNA芯片分析得到的lncRNA-miRNA-mRNA三元关系,为深入研究心肌梗死分子水平的病理机制,揭示相关药物作用机制以及寻找治疗新靶标提供方向和理论依据。
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关键词
心肌梗死
MICRORNA
long
non-coding
RNA
MRNA
表达谱
生物信息学
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职称材料
题名
基于生物信息学方法分析心肌梗死大鼠miRNA芯片
被引量:
3
1
作者
姚道敏
谢亮
宫剑滨
朱静
刘晶
机构
南京
中医药
大学
药
学院
南京大学医学院附属金陵医院心脏内科
出处
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期673-680,共8页
基金
国家自然科学基金面上资助项目(No 81773963)。
文摘
目的筛选大鼠梗死心肌组织microarray芯片中差异表达的miRNA,预测其互作lncRNA和靶基因,探索心肌梗死潜在的病理机制。方法结扎左前降支冠状动脉建立大鼠心梗模型。应用TRIzol法提取梗死左心室心肌区总RNA进行芯片检测。用生物信息学方法找出可能存在的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果19个明显差异表达的miRNAs中8个miRNAs(miR-21、miR-132、miR-222、miR-223-3p、miR-146a/b、miR-181b、miR-449a-5p、miR-122)已被证明是治疗心梗的候选分子,7个miRNAs(miR-365-5p、miR-490-5p、miR-6333、miR-30c-1-3p、miR-3591、miR-3596c、miR-877)是否与心肌梗死有关未知。心肌梗死发生发展中可能存在几条新的lncRNA-miRNA-mRNA作用机制。ENSRNOT00000076620-miR-146b-5p-STAT3/Rnf7/Qrsl1可能参与梗死心肌细胞的凋亡和线粒体损伤过程。ENSRNOT00000071991-miR-122-Deptor可能抑制心肌细胞自噬的发生,加剧心肌梗死的过程。NR_132625-miR-21-3P/miR-18a-5p-Coq5/Acsl1/Tmem65可能参与心肌梗死线粒体损伤过程。结论通过心肌梗死大鼠miRNA芯片分析得到的lncRNA-miRNA-mRNA三元关系,为深入研究心肌梗死分子水平的病理机制,揭示相关药物作用机制以及寻找治疗新靶标提供方向和理论依据。
关键词
心肌梗死
MICRORNA
long
non-coding
RNA
MRNA
表达谱
生物信息学
Keywords
myocardial infarction
MicroRNA
long non-coding RNA
mRNA
expression profiles
bioinformatics
分类号
R-332 [医药卫生]
R342.2 [医药卫生—基础医学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
基于生物信息学方法分析心肌梗死大鼠miRNA芯片
姚道敏
谢亮
宫剑滨
朱静
刘晶
《中国药理学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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