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面向蛋白质功能预测中有向无环图标记结构的多示例多标记学习
被引量：
1
1
作者
吴建盛
唐诗迪
+2 位作者
梅德进
朱燕翔
刁业敏
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期23-30,共8页
在多示例多标记学习问题中,标记之间往往是相互关联的,其中有向无环图结构是一种常见的层次关联结构,可见于蛋白质的基因本体学生物学功能预测的应用场景中。针对其标记间的有向无环图结构,提出了一种新的多示例多标记学习算法。算法从...
在多示例多标记学习问题中,标记之间往往是相互关联的,其中有向无环图结构是一种常见的层次关联结构,可见于蛋白质的基因本体学生物学功能预测的应用场景中。针对其标记间的有向无环图结构,提出了一种新的多示例多标记学习算法。算法从原始数据的特征空间训练出所有标记共享的低维子空间,通过随机梯度下降方法来降低模型排序损失,并融入标记间有向无环图结构关系对预测标记进行优化。将该算法应用于多个数据集的蛋白质功能预测中,实验结果表明,该算法具有更高的效率及预测性能。
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关键词
多示例多标记学习
蛋白质功能预测
有向无环图标记结构
标记相关性
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题名
面向蛋白质功能预测中有向无环图标记结构的多示例多标记学习
被引量：
1
1
作者
吴建盛
唐诗迪
梅德进
朱燕翔
刁业敏
机构
南京
邮电大学地理与生物信息学院
南京
邮电大学通信与信息工程学院
南京
仁面集成电路技术有限公司
南京叁角加文化发展中心
出处
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022年第3期23-30,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(61872198,61971216)
江苏省科技厅基础研究计划面上资助项目(BK20201378)。
文摘
在多示例多标记学习问题中,标记之间往往是相互关联的,其中有向无环图结构是一种常见的层次关联结构,可见于蛋白质的基因本体学生物学功能预测的应用场景中。针对其标记间的有向无环图结构,提出了一种新的多示例多标记学习算法。算法从原始数据的特征空间训练出所有标记共享的低维子空间,通过随机梯度下降方法来降低模型排序损失,并融入标记间有向无环图结构关系对预测标记进行优化。将该算法应用于多个数据集的蛋白质功能预测中,实验结果表明,该算法具有更高的效率及预测性能。
关键词
多示例多标记学习
蛋白质功能预测
有向无环图标记结构
标记相关性
Keywords
multi-instance multi-label learning
protein function prediction
labels with directed acyclic graph structure
label relationship
分类号
TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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作者
出处
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被引量
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1
面向蛋白质功能预测中有向无环图标记结构的多示例多标记学习
吴建盛
唐诗迪
梅德进
朱燕翔
刁业敏
《国防科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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