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通过机器学习探究外周血相关指标对非小细胞肺癌EGFR突变及预后的预测价值研究
1
作者 付书磊 温少迪 +3 位作者 张佳强 杜晓月 李茹 沈波 《中国肺癌杂志》 北大核心 2025年第2期105-113,共9页
背景与目的 表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)敏感突变是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)靶向治疗的有效靶点之一。然而,由于部分原发组织难以获取及部分经济欠发达地区经济因素,部分患者无... 背景与目的 表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor, EGFR)敏感突变是非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)靶向治疗的有效靶点之一。然而,由于部分原发组织难以获取及部分经济欠发达地区经济因素,部分患者无法进行传统基因检测。本研究旨在利用非侵入性的外周血指标,建立机器学习(machine learning, ML)模型,探索NSCLC中与EGFR突变状态密切相关的生物标志物,并评估其在预后中的潜在价值。方法 回顾性地收集2016年11月至2023年5月就诊于江苏省肿瘤医院的2642例肺癌患者的临床指标,将有完整随访数据的175例NSCLC患者纳入研究。根据外周血指标构建ML模型,按照8:2的比例分为训练集和测试集。采用无监督学习算法对血液特征进行聚类,使用互信息法进行特征筛选,并设计基于Shapley值的集成学习算法,计算每个特征对于模型预测结果的贡献程度。使用受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线对模型预测能力进行评估。结果 通过基于Shapley值的可解释ML模型的特征提取和对预测结果的贡献度分析,筛选出前10个贡献度最高的指标,分别为:病理类型、磷、嗜酸性粒细胞、单核细胞计数、活化部分凝血活酶时间、钾、总胆红素、钠、嗜酸性粒细胞百分比及总胆固醇。本研究模型的曲线下面积(area under the curve, AUC)为0.80。此外,低血钠及病理类型为鳞癌组的患者预后较差(P<0.05)。结论 本研究构建的可解释的模型为NSCLC患者EGFR突变状态的预测提供了新方法,这对无法进行基因检测的患者的诊疗提供了较为科学的依据。 展开更多
关键词 肺肿瘤 表皮生长因子受体 机器学习 预测模型
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外周血炎症指标作为预测性指标在晚期非小细胞肺癌免疫治疗中的应用 被引量：9
2
作者 夏经纬 陈羽中 +2 位作者 温少迪 杜晓月 沈波 《中国肺癌杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期632-645,共14页
背景与目的肺癌是癌症相关死亡最主要的病因,其中非小细胞肺癌(non small cell lung cancer, NSCLC)是最常见的类型。目前免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors, ICIs)已经成为晚期NSCLC主要的治疗方法之一。本文回顾性研究... 背景与目的肺癌是癌症相关死亡最主要的病因,其中非小细胞肺癌(non small cell lung cancer, NSCLC)是最常见的类型。目前免疫检查点抑制剂(immune checkpoint inhibitors, ICIs)已经成为晚期NSCLC主要的治疗方法之一。本文回顾性研究了外周血炎症指标对晚期NSCLC患者免疫治疗疗效及生存预后的影响,以寻找指导NSCLC免疫治疗的策略。方法选取2018年10月-2019年8月于南京医科大学附属肿瘤医院住院治疗的晚期NSCLC患者,均接受抗PD-1(Pembrolizumab、Sintilimab或Toripalimab)单药或者联合方案治疗。随访至2020年12月10日,根据RECIST1.1标准评价疗效,分析影响疗效的显著变量,并随访无进展生存期(progression-free survival, PFS)及总生存期(overall survival, OS)进行生存分析。根据治疗前、治疗后6周、治疗后12周(0 w、6 w、12 w)三个不同时间点中性粒细胞计数与淋巴细胞计数比值(neutrophil-to-lymphocyte ratio, NLR)数据构建临床预测模型分析NLR的预测价值,并验证模型准确性。结果最终纳入173例患者,所有患者均接受上述治疗方案,中位随访时间19.7个月。客观缓解率(objective response rate, ORR)27.7%(48/173),疾病控制率(disease control rate, DCR)89.6%(155/173),中位PFS为8.3个月(7.491-9.109),中位OS为15.5个月(14.087-16.913)。χ^(2)检验及Logistic多因素分析显示NLR_(6w)与ORR相关,NLR_(12w)与ORR、DCR相关,进一步Cox回归分析显示NLR_(6w)和NLR_(12w)影响PFS,NLR_(0w)、NLR_(6w)和NLR_(12w)与OS相关。结论在晚期NSCLC患者中,不同时间点的NLR数值是免疫治疗反应的有效预测因子,并且NLR<3往往与良好的预后相关。 展开更多
关键词 肺肿瘤 免疫检查点抑制剂 中性粒细胞与淋巴细胞计数比值 列线图
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乳腺癌组织中tRF-31的表达及其对癌细胞增殖的影响 被引量：3
3
作者 江盼 严枫 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2020年第7期726-731,共6页
目的目前关于tRF-31对乳腺癌的影响研究报道较少。文中旨在检测和分析乳腺癌组织中tRF-31的表达水平,探讨其对乳腺癌细胞增殖的影响。方法收集2017年11月至2019年2月南京医科大学附属肿瘤医院乳腺外科乳腺癌患者的32份肿瘤组织标本及对... 目的目前关于tRF-31对乳腺癌的影响研究报道较少。文中旨在检测和分析乳腺癌组织中tRF-31的表达水平,探讨其对乳腺癌细胞增殖的影响。方法收集2017年11月至2019年2月南京医科大学附属肿瘤医院乳腺外科乳腺癌患者的32份肿瘤组织标本及对应的癌旁组织。从中选取6份癌组织以及对应的癌旁组织进行高通量测序,通过高通量测序,选择tRF-31(FC=6.5781,P=0.023)作为研究对象。采用RT-PCR法测定癌组织及癌旁组织的tRF-31表达量,运用ROC曲线分析tRF-31的表达对乳腺癌诊断的灵敏度和特异性。将2种人乳腺癌细胞株(MDA-MB-231和MCF-7)分别分为:对照组(转染negative control)和tRF-31组(转染tRF-31抑制试剂tRF-31 inhibitor)。采用CCK-8和克隆形成实验检测转染后乳腺癌细胞增殖的情况。并测定转染后乳腺癌细胞苏氨酸激酶(AKT)和雷帕霉素靶蛋白(mTOR)表达的变化,探索tRF-31与AKT/mTOR信号通路的关系。结果tRF-31在癌组织(0.103±0.207)的表达显著高于癌旁组织(0.028±0.039),差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析显示,tRF-31检测乳腺癌的灵敏性为90.63%,特异性为53.13%。MDA-MB-231细胞中,tRF-31组tRF-31的表达量较对照组明显降低[(0.267±0.012)vs(1±0.040),P<0.01];MCF-7细胞中,tRF-31组tRF-31的表达量较对照组亦明显降低(P<0.01)。MDA-MB-231和MCF-7细胞中,tRF-31组细胞0、24、48、72 h增殖能力较对照组均降低(P<0.05)。MDA-MB-231细胞中,tRF-31组细胞克隆形成率[(43.67±3.29)%]较对照组[(100±3.74)%]明显降低(P<0.01);MCF-7细胞中,tRF-31组细胞克隆形成率[(49±2.94)%]较对照组[(100±4.89)%]明显降低(P<0.01)。MDA-MB-231和MCF-7细胞中,tRF-31组AKT和mTOR的蛋白水平较对照组明显下降。结论tRF-31在乳腺癌组织中显著高表达,并可促进乳腺癌细胞的增殖。这一结果有望为乳腺癌治疗提供新靶点。 展开更多
关键词 乳腺癌组织 tRF-31 细胞增殖 表达水平
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