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江苏人群12个非CODIS STR基因座的遗传多态性及在亲权鉴定中的应用 被引量:1
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作者 居晓斌 潘猛 +3 位作者 刘燕婷 崔鹤 周惠英 顾民 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1348-1350,共3页
目的 :利用3130遗传基因测序仪的电泳图谱分析江苏人群D11S4463、D2S1776、D14S1434、D4S2408、D10S1043、D20S482、D12SATA63、D19S433等12个非CODIS STR基因座多态性分布,计算该12个基因座的基因频率(P)、个体鉴别能力(DP)、无... 目的 :利用3130遗传基因测序仪的电泳图谱分析江苏人群D11S4463、D2S1776、D14S1434、D4S2408、D10S1043、D20S482、D12SATA63、D19S433等12个非CODIS STR基因座多态性分布,计算该12个基因座的基因频率(P)、个体鉴别能力(DP)、无偏倚期望杂合度(H)、多态性信息总量(PIC)、二联体非父排除率(PEduo)和三联体非父排除率(PEtrio),并评估其法医学应用价值。方法:利用PCR扩增,产物通过3130测序仪毛细管电泳。读出数据后用分析软件进行分析。结果:12个非CODIS STR基因座的频率分布在本组人群中均符合Hardy-Weinberg平衡。杂合度分布为0.707 6~0.804 6,个体鉴别能力为0.846 8~0.948 6,二联体非父排除率为0.278 6~0.482 6,三联体非父排除率为0.446 7~0.663 2,多态性信息总量为0.643 8~0.807 4。结论:通过大量的样本实验和等位基因频率的统计,得出等位基因多态性数据,用于比对验证,具有很好的辅助作用,在一些CPI值不足10 000及突变案例中具有重要的补充作用。 展开更多
关键词 短串联重复序列 亲权鉴定 遗传多态性
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mtDNA基因多态性分析在母系遗传鉴定中应用的研究
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作者 居晓斌 苏恩本 +3 位作者 陈子庆 周惠英 丁小健 顾民 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期1763-1764,共2页
目的:探讨线粒体DNA中的HV1、HV2基因的序列多态性,并讨论其在母系遗传鉴定中的应用价值。方法:针对线粒体HV1、HV2基因位点采用文献报道引物,PCR扩增后应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果:一代母系遗传中可能有1~2个点突... 目的:探讨线粒体DNA中的HV1、HV2基因的序列多态性,并讨论其在母系遗传鉴定中的应用价值。方法:针对线粒体HV1、HV2基因位点采用文献报道引物,PCR扩增后应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果:一代母系遗传中可能有1~2个点突变,而非母系遗传则突变点一定大于3个。结论:对于认定2个个体是否母子(女)关系或者是否有同一个母亲的案例具有很重要的意义。 展开更多
关键词 线粒体DNA 控制区 序列长度多态性 母系亲权鉴定 测序
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江苏人群19个STR基因座的遗传多态性 被引量:8
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作者 居晓斌 潘猛 +4 位作者 刘燕婷 周蓉 陈奇 霍然 周惠英 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期750-754,792,共6页
目的 :利用3130遗传基因测序仪的电泳图谱分析江苏人群D21S11、D6S1043、Penta E、PGA、D2S1338、D11S51、D19S433、D12S391、CSF1PO、D3S1358、Penta D、VWA、D13S317、THO1、TPOX、D8S1179、D16S539、D5S818、D7S820 19个STR基因座多... 目的 :利用3130遗传基因测序仪的电泳图谱分析江苏人群D21S11、D6S1043、Penta E、PGA、D2S1338、D11S51、D19S433、D12S391、CSF1PO、D3S1358、Penta D、VWA、D13S317、THO1、TPOX、D8S1179、D16S539、D5S818、D7S820 19个STR基因座多态性分布,并计算该19个基因座的基因频率、个体鉴别能力、无偏倚期望杂合度、多态性信息总量和非父排除率。方法:利用PCR扩增,产物通过3130测序仪毛细管电泳。读出数据后用分析软件进行分析。结果:19个STR位点中Penta E的个体鉴别能力值和非父排除率值最高,19个STR位点的累积非父排除率达0.9999以上。结论:通过大量的样本实验和等位基因频率的统计,得出了更加客观的等位基因多态性数据,为江苏地区亲权鉴定的判定提供更加客观的依据。 展开更多
关键词 短串联重复序列 亲权鉴定 遗传多态性
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江苏汉族24个Y-STR基因座遗传多态性及遗传关系研究 被引量:3
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作者 潘猛 居晓斌 +3 位作者 陈奇 周蓉 陈子庆 周惠英 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1426-1429,共4页
目的:分析24个Y染色体短串联重复序列(STR)基因座在江苏汉族群体的基因多态性、基因频率和其他地域人群之间的遗传距离。方法:取2011-2012年来自江苏省的262份无血缘关系的汉族个体,对24个STR位点进行复合扩增.ABI3130自动基因分... 目的:分析24个Y染色体短串联重复序列(STR)基因座在江苏汉族群体的基因多态性、基因频率和其他地域人群之间的遗传距离。方法:取2011-2012年来自江苏省的262份无血缘关系的汉族个体,对24个STR位点进行复合扩增.ABI3130自动基因分析仪进行片段分析并进行基因分型。结果:共发现172个STR等位基因,其中DYS385b、DYS449基因座发现14种等位基因,单倍型共发现262个,单倍型多样性为0.9999,统计10个群体遗传距离Rst矩阵,提示江苏人群更偏向于以天津(-0.0018)、河南(-0.00176)、山西(-0.0016)为群体的中原人群,而与湖南(O.01754)和辽宁(0.01464)人群的遗传距离最远(P〈0.05)。结论:获得具有江苏汉族人群特征的遗传学和法医学客观基础数据,对建立具有江苏地区特点的Y—STR数据库有重要意义。 展开更多
关键词 Y染色体 短串联重复序列 基因多态性 遗传距离
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10例孕妇血浆中胎儿游离DNA-STR位点检测分析 被引量:3
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作者 高慧双 苏恩本 +6 位作者 陈子庆 居晓斌 丁小建 周惠英 陈奇 周容 夏新辉 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期522-526,共5页
目的:探索短串连重复序列(STR)多位点检测孕妇血浆中胎儿游离DNA的可行性。方法:改进QIAamp离心柱型DNA提取方法提取10例孕中期孕妇血浆中总游离DNA,进行D3S1358、D13S317、CSF1PO、D12S391、D6S477、VWA6个STR位点扩增,并以孕妇与胎儿... 目的:探索短串连重复序列(STR)多位点检测孕妇血浆中胎儿游离DNA的可行性。方法:改进QIAamp离心柱型DNA提取方法提取10例孕中期孕妇血浆中总游离DNA,进行D3S1358、D13S317、CSF1PO、D12S391、D6S477、VWA6个STR位点扩增,并以孕妇与胎儿羊水细胞基因组DNA为对照,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析胎儿游离DNA提取效果及检测效率。结果:10例孕中期孕妇血浆样本共检测位点60个,检出有结果位点44个,除去母体与胎儿DNA基因型完全一致的14个位点,剩余的30个位点中,18个位点成功检出胎儿DNA基因型,检出率30%。检出率最高的位点是D13S317和D12S391。结论:STR多位点的扩增可以检测得出胎儿特异性DNA序列,有望应用于无创伤性产前遗传性疾病的诊断和法医学亲子鉴定中。 展开更多
关键词 胎儿游离DNA STR 产前诊断
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江苏汉族人群全新STR基因座的遗传多态性分析
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作者 陈奇 潘猛 +4 位作者 张小燕 居晓斌 刘燕婷 崔鹤 周惠英 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1344-1347,共4页
目的 :分析全新短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座在江苏人群中的基因多态性和基因频率。方法 :2015年江苏省598例无血缘关系的汉族个体,利用STRtyper-10G Direct Kit试剂盒对9个STR位点进行扩增,自动基因分析仪进行片段... 目的 :分析全新短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座在江苏人群中的基因多态性和基因频率。方法 :2015年江苏省598例无血缘关系的汉族个体,利用STRtyper-10G Direct Kit试剂盒对9个STR位点进行扩增,自动基因分析仪进行片段分析并进行基因分型。结果:累积STR等位基因共发现111个,其中罕见等位基因13个。基因型频率大于0.08的基因型组合13个,其中D13S325基因座的等位基因型19/20的频率最高达到0.130 4,杂合度达到了0.851±0.068,随机个体相同表型偶合率为0.054±0.022,个体识别能力为0.946±0.022,多态信息总量为0.808±0.052,非父排除率达到了0.697±0.130。结论:通过大量的样本实验和等位基因频率总结,得到了江苏人群更多基因多样性的客观数据,以便在出现微变异等情况时满足进一步实际应用的需要。 展开更多
关键词 亲权鉴定 江苏人群 基因多态性 全新短串联重复序列
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江苏地区汉族人群6812例亲子鉴定案例中39个STR基因座突变特征分析
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作者 叶琴 居晓斌 +2 位作者 吴蕾 陈群 徐婷 《南京医科大学学报(自然科学版)》 2025年第9期1293-1300,共8页
目的:分析江苏省汉族人群亲子鉴定中39个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座的突变特征。方法:选取2019年1月—2024年12月南京医科大学第一附属医院司法鉴定所受理的6812例亲子鉴定案例,采用GoldenEye^(TM) DNA身份鉴定系... 目的:分析江苏省汉族人群亲子鉴定中39个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)基因座的突变特征。方法:选取2019年1月—2024年12月南京医科大学第一附属医院司法鉴定所受理的6812例亲子鉴定案例,采用GoldenEye^(TM) DNA身份鉴定系统检测39个STR基因座的突变情况,对突变率、突变来源和步数进行统计分析。结果:在6812例认定亲子关系的案例中,三联体1680例,二联体5132例。共发现214例突变案例,总突变率2.52%。其中,D12S391基因座突变率最高,达0.3297%(28/8492),其次为Penta E、FGA、D21S11、D18S51、D3S1358基因座,突变率均在0.20%以上。突变来源分析中,父源突变189例,母源突变20例,不明原因突变5例,父源突变显著高于母源(P<0.001)。203例(94.86%)突变为一步突变,二步突变9例,FGA和D21S11基因座三步突变各1例。结论:亲子鉴定中39个STR基因座总突变率较高,达2.52%,具有性别和地区差异,在亲子鉴定实践中需加以重视,该结果为江苏地区汉族人群STR基因座突变情况提供数据支撑,有助于提升复杂亲缘关系鉴定的准确性。 展开更多
关键词 亲子鉴定 短串联重复序列 基因突变 法医遗传学
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长链非编码RNA BANCR在胃癌中表达及其对胃癌细胞迁移、侵袭的影响 被引量:4
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作者 崔鹤 居晓斌 +2 位作者 叶琴 潘猛 周惠英 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期1674-1678,共5页
目的:检测长链非编码RNA BANCR在胃癌组织中的表达,并探讨其对胃癌细胞迁移、侵袭生物学行为的调控作用与相关机制。方法:采用荧光定量PCR(QPCR)和TCGA-STDA数据库分析胃癌组织和癌旁组织中BANCR的表达水平,采用小干扰RNA(siRNA)技术敲... 目的:检测长链非编码RNA BANCR在胃癌组织中的表达,并探讨其对胃癌细胞迁移、侵袭生物学行为的调控作用与相关机制。方法:采用荧光定量PCR(QPCR)和TCGA-STDA数据库分析胃癌组织和癌旁组织中BANCR的表达水平,采用小干扰RNA(siRNA)技术敲低胃癌细胞MKN28 BANCR的表达,采用Transwell、QPCR检测MKN28细胞的迁移、侵袭情况以及肿瘤细胞转移相关标志物的表达水平变化。结果:胃癌组织中BANCR的表达水平呈明显上调。敲低BANCR表达后,MKN28细胞的迁移、侵袭能力被抑制,转移相关分子CDH1的表达量显著增加,而Vimentin的表达量显著降低。此外,敲低BANCR下调ZEB1表达,同时干扰miR-203能部分恢复ZEB1的表达水平。结论:BANCR在胃癌组织中呈高表达,其可能通过调节miR-203-ZEB1-CDH1轴促进胃癌细胞迁移和侵袭。 展开更多
关键词 胃癌 长链非编码RNA BANCR 迁移 侵袭
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