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SENP1在SPOP去SUMO化修饰中的作用研究被引量：1: 1; 作者张赟豪韩博昂 +5 位作者王瑜朱琴乐珅俞婷婷程雁刘晨《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第6期753-761,共9页; 目的:研究小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)修饰对SPOP(speckle type BTB/POZ protein)蛋白水平和细胞定位的影响,并尝试在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中探讨SUMO特异性蛋白酶1(sentr... 展开更多; 关键词 SPOP SENP1 SUMO修饰肾透明细胞癌; 在线阅读下载PDF 职称材料

LncRNA RP11-490M8.1在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌细胞增殖的影响被引量：2: 2; 作者杨莹王子璇 +5 位作者陈狄陈方亚群金玉翠马长艳陈翔《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第5期611-616,共6页; 目的:确定lncRNA RP11-490M8.1在乳腺癌中的表达情况及其在乳腺癌细胞增殖中的作用。方法:基于癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和Kaplan-Meier plotter数据库分析RP11-490M8.1在乳腺癌中的表达情况及与患者预后的关系... 展开更多; 关键词 RP11-490M8.1 乳腺癌增殖预后; 在线阅读下载PDF 职称材料

利用CRISPR/Cas9和piggyBac实现果蝇基因组无缝编辑被引量：4: 3; 作者王珏黄娟许蕊《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期422-429,451-461,共9页; CRISPR/Cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated protein9)是第三代基因组编辑技术。在sgRNA引导下,Cas9核酸内切酶作用于特定基因组序列,产生DNA双链断裂(double-strandedbreaks... 展开更多; 关键词果蝇无缝基因组编辑 CRISPR/Cas9 PIGGYBAC; 在线阅读下载PDF 职称材料

不同固定方法对初级纤毛蛋白免疫荧光的影响: 4; 作者李田元王悦 +4 位作者艾紫荷刘晨俞婷婷程雁乐珅《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2023年第3期343-348,379,共7页; 目的:比较不同固定方法对动物细胞初级纤毛组分免疫荧光染色的影响,探究初级纤毛免疫荧光成像的优化策略。方法:选择4%多聚甲醛(paraformaldehyde,PFA)、甲醇(MeOH)、10%三氯乙酸(trichloroacetic acid,TCA)固定细胞,后续使用相同的透... 展开更多; 关键词初级纤毛固定细胞免疫荧光; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名SENP1在SPOP去SUMO化修饰中的作用研究被引量：1: 1; 作者张赟豪韩博昂王瑜朱琴乐珅俞婷婷程雁刘晨; 机构南京医科大学基础医学院医学遗传学系; 出处《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第6期753-761,共9页; 基金国家自然科学基金(81702747,82172629)。; 文摘目的:研究小泛素相关修饰物(small ubiquitin-related modifier,SUMO)修饰对SPOP(speckle type BTB/POZ protein)蛋白水平和细胞定位的影响,并尝试在肾透明细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)中探讨SUMO特异性蛋白酶1(sentrin-specific proteases 1,SENP1)和SPOP之间的相关性。方法:利用野生型(wild type,WT)和Senp1敲除的小鼠胚胎成纤维细胞研究Senp1对Spop蛋白水平和细胞定位的影响,并通过比较外源WT-Spop和Spop的SUMO修饰位点突变体的蛋白表达量,进一步确认SUMO修饰对Spop蛋白水平的影响。后续通过邻位连接技术(proximity ligation assay,PLA)研究WT-Spop及其SUMO修饰位点突变体与SUMO1的结合能力。最后通过ccRCC患者的RNA表达数据和ccRCC细胞系探讨SENP1和SPOP在ccRCC中的相关性。结果:Senp1敲除下调小鼠胚胎成纤维细胞中Spop的蛋白量和稳定性,但不影响其细胞核定位。突变Spop的SUMO修饰位点后,其与Sumo1的结合能力下降,蛋白量也有所降低。SENP1和SPOP的表达在ccRCC中呈正相关。结论:Senp1通过去SUMO化修饰稳定Spop蛋白,SENP1和SPOP的表达在ccRCC中呈正相关。; 关键词 SPOP SENP1 SUMO修饰肾透明细胞癌; Keywords SPOP SENP1 SUMO modification clear cell renal cell carcinoma; 分类号 Q343 [生物学—遗传学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名LncRNA RP11-490M8.1在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌细胞增殖的影响被引量：2: 2; 作者杨莹王子璇陈狄陈方亚群金玉翠马长艳陈翔; 机构南京医科大学基础医学院医学遗传学系江苏大学附属宜兴市人民医院甲乳外科; 出处《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第5期611-616,共6页; 基金国家自然科学基金(81872389) 新锐肿瘤支持治疗课题研究项目(cphcf-2022-121) +1 种基金江苏省高等学校大学生创新创业训练计划(202110312002Z)。; 文摘目的:确定lncRNA RP11-490M8.1在乳腺癌中的表达情况及其在乳腺癌细胞增殖中的作用。方法:基于癌症基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和Kaplan-Meier plotter数据库分析RP11-490M8.1在乳腺癌中的表达情况及与患者预后的关系;qRT-PCR检测RP11-490M8.1在乳腺癌和癌旁组织中的表达;CCK8和克隆形成实验检测过表达和敲低RP11-490M8.1对乳腺癌细胞增殖的影响。结果:与癌旁组织相比,RP11-490M8.1在乳腺癌组织中表达明显下调,且RP11-490M8.1低表达和较差的总生存期(overall survival,OS)密切相关(P=0.034);RP11-490M8.1表达水平与乳腺癌患者的临床分期呈负相关,而与雌激素受体、孕激素受体、人表皮生长因子受体-2的表达以及年龄均无相关性;过表达RP11-490M8.1显著抑制乳腺癌细胞的增殖,敲低RP11-490M8.1表达则促进其增殖。结论:RP11-490M8.1在乳腺癌中可能发挥抑癌基因的作用,是潜在的乳腺癌预后分子和治疗靶点。; 关键词 RP11-490M8.1 乳腺癌增殖预后; Keywords RP11⁃490M8.1 breast cancer proliferation prognosis; 分类号 R737.9 [医药卫生—肿瘤]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名利用CRISPR/Cas9和piggyBac实现果蝇基因组无缝编辑被引量：4: 3; 作者王珏黄娟许蕊; 机构南京医科大学基础医学院医学遗传学系; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期422-429,451-461,共9页; 基金南京医科大学引进人才启动经费项目(编号:2012RC04)资助~~; 文摘 CRISPR/Cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)/CRISPR-associated protein9)是第三代基因组编辑技术。在sgRNA引导下,Cas9核酸内切酶作用于特定基因组序列,产生DNA双链断裂(double-strandedbreaks,DSBs),利用同源定向修复(homology-directedrepair,HDR)可实现对靶基因的特异性基因敲除(knock-out)或敲入(knock-in)。传统的技术方案将CRISPR/Cas9技术与Cre/loxP或FLP/FRT系统联用,可实现高效的基因打靶,也易于移除打靶过程中引入的筛选标记。然而,筛选标记移除过程中会在基因组中残留34个碱基的标签序列。因此,对基因组进行精确编辑的同时不引入无关序列仍有一定难度。在人工诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells, iPSCs)的基因组编辑中,CRISPR/Cas9技术和piggyBac转座酶联用的两步法策略能够实现这一目标:首先运用CRISPR/Cas9技术,利用同源定向修复原理引入基因突变及筛选标记,然后利用piggyBac转座酶将筛选标记精确移除。借鉴该方法的技术原理,本研究对果蝇(Drosophila melanogaster)CG4894基因进行了无缝编辑(seamless genome editing),成功将该基因第18外显子上第21位的酪氨酸(tyrosine,Y)突变为半胱氨酸(cysteine,C),且测序结果显示基因组中除设计位点之外并无其他外源序列残留。CRISPR/Cas9技术和piggyBac转座酶联用策略为果蝇基因组的精确编辑提供了更多选择。; 关键词果蝇无缝基因组编辑 CRISPR/Cas9 PIGGYBAC; Keywords Drosophila seamless genome editing CRISPR/Cas9 piggyBac; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名不同固定方法对初级纤毛蛋白免疫荧光的影响: 4; 作者李田元王悦艾紫荷刘晨俞婷婷程雁乐珅; 机构南京医科大学基础医学院医学遗传学系; 出处《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2023年第3期343-348,379,共7页; 基金国家自然科学基金(82173291,82172629)。; 文摘目的:比较不同固定方法对动物细胞初级纤毛组分免疫荧光染色的影响,探究初级纤毛免疫荧光成像的优化策略。方法:选择4%多聚甲醛(paraformaldehyde,PFA)、甲醇(MeOH)、10%三氯乙酸(trichloroacetic acid,TCA)固定细胞,后续使用相同的透化、封闭、抗体孵育条件,最后比较相同拍摄参数下初级纤毛的成像效果。结果:PFA固定法可使纤毛轴丝蛋白和部分纤毛膜蛋白有更好的染色效果,MeOH固定法可以更清晰地展现纤毛底部定位的蛋白。相比前两种方法,TCA固定的细胞虽然纤毛轴丝的染色效果很差,但适用于部分纤毛膜蛋白和轴丝结合蛋白。除荧光强弱不同外,使用不同方法固定后染色得到的蛋白定位也有微小差异。结论:3种固定方法在初级纤毛免疫荧光实验中各有优劣,需要综合考虑实验目的以及目标蛋白的特点进行选择。; 关键词初级纤毛固定细胞免疫荧光; Keywords primary cilia fixation cellular immunofluorescence; 分类号 R329.24 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	SENP1在SPOP去SUMO化修饰中的作用研究	张赟豪韩博昂王瑜朱琴乐珅俞婷婷程雁刘晨	《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心	2024	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	LncRNA RP11-490M8.1在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌细胞增殖的影响	杨莹王子璇陈狄陈方亚群金玉翠马长艳陈翔	《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心	2023	2	在线阅读下载PDF 职称材料
3	利用CRISPR/Cas9和piggyBac实现果蝇基因组无缝编辑	王珏黄娟许蕊	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2019	4	在线阅读下载PDF 职称材料
4	不同固定方法对初级纤毛蛋白免疫荧光的影响	李田元王悦艾紫荷刘晨俞婷婷程雁乐珅	《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心	2023	0	在线阅读下载PDF 职称材料