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腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育
被引量:
14
1
作者
王金成
季镭
+2 位作者
黄国明
杨秀丽
林茂松
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期79-83,98,共6页
为弄清我国腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)不同地理种群ITS(Internal transcribed spacer)区之间的碱基差异及系统发育关系,本研究通过网络软件Clustalw1.83对腐烂茎线虫的核糖体ITS区核酸序列进行了比对,结果发现腐烂茎线虫的8个...
为弄清我国腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)不同地理种群ITS(Internal transcribed spacer)区之间的碱基差异及系统发育关系,本研究通过网络软件Clustalw1.83对腐烂茎线虫的核糖体ITS区核酸序列进行了比对,结果发现腐烂茎线虫的8个种群中,DEll、DEly、DEAY987007三个种群(I组)内部之间的碱基差异在1%以内,其它的5个种群(II组)之间的差异为0~1%,而I组与II组种群之间的差异达到了15%(根据ITS1+5.8s+ITS2序列)或20%(根据ITS1+ITS2序列)。这说明我国腐烂茎线虫很可能是1个复合种。根据ITS区核酸序列构建的系统发育图同样显示,我国腐烂茎线虫的7个地理种群明显分为2个分支A和B。
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关键词
腐烂茎线虫
鳞球茎茎线虫
食菌茎线虫
ITS(Internal
transcribed
spacer)
系统发育关系
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职称材料
题名
腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育
被引量:
14
1
作者
王金成
季镭
黄国明
杨秀丽
林茂松
机构
天津出入境检验检疫局
南京农业大学植病系
出处
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期79-83,98,共6页
基金
天津自然科学基金资助项目(05YFJMJC10800)
文摘
为弄清我国腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)不同地理种群ITS(Internal transcribed spacer)区之间的碱基差异及系统发育关系,本研究通过网络软件Clustalw1.83对腐烂茎线虫的核糖体ITS区核酸序列进行了比对,结果发现腐烂茎线虫的8个种群中,DEll、DEly、DEAY987007三个种群(I组)内部之间的碱基差异在1%以内,其它的5个种群(II组)之间的差异为0~1%,而I组与II组种群之间的差异达到了15%(根据ITS1+5.8s+ITS2序列)或20%(根据ITS1+ITS2序列)。这说明我国腐烂茎线虫很可能是1个复合种。根据ITS区核酸序列构建的系统发育图同样显示,我国腐烂茎线虫的7个地理种群明显分为2个分支A和B。
关键词
腐烂茎线虫
鳞球茎茎线虫
食菌茎线虫
ITS(Internal
transcribed
spacer)
系统发育关系
Keywords
Ditylenchus destructor
D. dipsaci
D. myceliophagus
ITS(Internal Transcribed Spacer)
phylogenetic relationships
分类号
S435.621.29 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育
王金成
季镭
黄国明
杨秀丽
林茂松
《河北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
14
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