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芹菜品种‘津南实芹’AgICE1基因的克隆及其对非生物胁迫的响应 被引量:3
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作者 杨青青 刘洁霞 +3 位作者 徐志胜 冯凯 黄莹 熊爱生 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期16-24,共9页
从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)叶片RNA中克隆获得1个转录因子基因,命名为AgICE1。序列分析结果显示:AgICE1基因含有1个长度为1 455 bp的开放阅读框(ORF),编码484个氨基酸。AgICE1转录因子氨基酸... 从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)叶片RNA中克隆获得1个转录因子基因,命名为AgICE1。序列分析结果显示:AgICE1基因含有1个长度为1 455 bp的开放阅读框(ORF),编码484个氨基酸。AgICE1转录因子氨基酸序列的理论相对分子质量为53 140,理论等电点为pI 5.09,为亲水性蛋白。AgICE1转录因子的氨基酸组成中脂肪族氨基酸的比例最高,酸性氨基酸的比例次之,碱性氨基酸的比例较低,芳香族氨基酸的比例最低。序列比对与系统进化分析结果表明:ICE1转录因子在不同植物中高度保守。实时荧光定量PCR检测结果表明:AgICE1基因在叶片中的相对表达水平显著高于在根和叶柄中的相对表达水平;在高温(38℃)、低温(4℃)、干旱(质量体积分数20%PEG6000)和高盐(0.2 mol·L^(-1) NaCl)处理下,AgICE1基因的相对表达水平总体上升高。研究结果表明:AgICE1转录因子在芹菜非生物胁迫调控中起重要作用。 展开更多
关键词 芹菜 AgICE1转录因子 基因克隆 非生物胁迫 相对表达水平
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室温贮藏过程中胡萝卜口感及部分营养成分含量变化 被引量:8
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作者 谭国飞 王枫 +3 位作者 马静 田畅 陈逸云 熊爱生 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期107-109,共3页
胡萝卜(Daucus carota var.sativaDC.)别名红萝卜,为2年生草本植物,原产于中亚、西亚和非洲北部,于13世纪末传人中国;其根部营养物质丰富,特别是胡萝卜素及维生素等含量较高。胡萝卜在中国南北方栽种广泛,主要种植在长江以北... 胡萝卜(Daucus carota var.sativaDC.)别名红萝卜,为2年生草本植物,原产于中亚、西亚和非洲北部,于13世纪末传人中国;其根部营养物质丰富,特别是胡萝卜素及维生素等含量较高。胡萝卜在中国南北方栽种广泛,主要种植在长江以北地区,特别是高寒地区,是该地区主要冬贮蔬菜之一。中国是胡萝卜栽种和产量大国,栽种面积占全球栽种面积的40%,产量占全球总产量的30%左右。 展开更多
关键词 胡萝卜 室温贮藏 口感 VC 还原性糖 可溶性糖
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3个芹菜品种Agnp-G3PDH基因的克隆及其序列和表达特性分析 被引量:5
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作者 田畅 蒋倩 +3 位作者 王枫 李梦瑶 贾晓玲 熊爱生 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期1-10,共10页
从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘六合黄心芹’(‘Liuhe Huangxinqin’)、‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)和‘文图拉’(‘Ventura’)中分别克隆获得非磷酸化甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因Agnp-G3PDH。3个品种的AgnpG3PDH基因序列均包... 从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘六合黄心芹’(‘Liuhe Huangxinqin’)、‘津南实芹’(‘Jinnan Shiqin’)和‘文图拉’(‘Ventura’)中分别克隆获得非磷酸化甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因Agnp-G3PDH。3个品种的AgnpG3PDH基因序列均包含1个全长1 491 bp的开放阅读框(ORF),编码496个氨基酸;存在84个碱基位点差异,导致14个氨基酸位点改变。由该基因编码的‘六合黄心芹’、‘津南实芹’和‘文图拉’的Agnp-G3PDH蛋白的理论相对分子质量分别为53 201.6、53 051.4和52 960.3,理论等电点分别为pI 7.49、pI 7.86和pI 8.12,氨基酸组成中碱性氨基酸数量大于酸性氨基酸数量;该蛋白质具有亲水性与疏水性双重特性,均为疏水性蛋白。多重比对结果表明:3个品种Agnp-G3PDH基因编码的氨基酸序列同源性达到99.09%,具有高度保守性;且与其他11种植物npG3PDH的氨基酸序列的相似度也较高。在基于np-G3PDH基因编码的氨基酸序列进化树上,3个芹菜品种聚在同一分支中,并与杨柳科(Salicaceae)种类毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)聚在一起,表明它们的np-G3PDH进化关系较近。实时定量PCR分析结果表明:在3个芹菜品种的不同组织中Agnp-G3PDH基因的相对表达水平均有明显差异,其中,在‘津南实芹’的叶、‘文图拉’的花和‘六合黄心芹’的根中该基因的相对表达水平最高;经高温(38℃)、低温(4℃)和干旱(20%PEG)胁迫处理后3个品种Agnp-G3PDH基因的相对表达水平均极显著高于或低于对照,但经盐(0.2 mol·L-1NaCl)胁迫处理后仅品种‘津南实芹’Agnp-G3PDH基因的相对表达水平显著高于对照,品种‘六合黄心芹’和‘文图拉’Agnp-G3PDH基因的相对表达水平与对照无显著差异。表明该基因的表达具有组织特异性且与品种间的抗逆性差异有关。 展开更多
关键词 芹菜 Agnp—G3PDH基因 序列分析 同源性 非生物胁迫 表达特性
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2个芹菜品种泛变应原Api g 4基因的克隆与分析 被引量:3
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作者 李梦瑶 王枫 +3 位作者 侯喜林 蒋倩 马静 熊爱生 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期1-7,共7页
从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘津南实芹’(‘Jinnanshiqin’)和‘美国西芹’(‘Meiguoxiqin’)中分别克隆获得泛变应原基因Api g 4;2个品种的Api g 4基因均包含1个长度为405 bp的开放阅读框,二者间有3个核苷酸位点的差异。2个... 从芹菜(Apium graveolens Linn.)品种‘津南实芹’(‘Jinnanshiqin’)和‘美国西芹’(‘Meiguoxiqin’)中分别克隆获得泛变应原基因Api g 4;2个品种的Api g 4基因均包含1个长度为405 bp的开放阅读框,二者间有3个核苷酸位点的差异。2个品种的Api g 4基因均能编码134个氨基酸,但二者编码的氨基酸序列有2个位点的差异。多重比对以及进化树分析结果均表明:2个芹菜品种Api g 4基因编码的氨基酸序列与其他植物的泛变应原氨基酸序列同源性较高,氨基酸序列高度保守;与同科植物欧芹〔Petroselinum crispum(Miller)Nyman ex A.W.Hill〕和胡萝卜(Daucus carota Linn.)的泛变应原氨基酸序列的同源性均达到90%以上,在进化树上也归为同一支。2个品种的泛变应原Api g 4均为疏水性蛋白,具有相似的三维空间结构,均包含3个α螺旋和7个β折叠。实时定量PCR分析结果显示:Api g 4基因在‘津南实芹’和‘美国西芹’根中的表达水平均最高,在茎和茎尖分生组织中的表达水平相对较低,在叶中的表达水平很弱,且2个品种间同一组织的Api g 4基因表达水平也有差异,表明Api g 4基因的表达具有明显的组织特异性。 展开更多
关键词 芹菜 泛变应原 API g4基因 克隆 同源性 基因表达
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芹菜品种‘六合黄心芹’AgCCoAOMT基因的克隆及表达特性分析 被引量:3
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作者 苑笑阳 吴雪君 +2 位作者 聂力 许珂 熊爱生 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期19-27,共9页
根据伞形科(Apiaceae)植物芹菜(Apium graveolens Linn.)的转录组数据库,从芹菜品种‘六合黄心芹’(‘Liuhe Huangxinqin’)叶片总RNA中克隆获得咖啡碱-辅酶A-O-甲基转移酶基因,命名为Ag CCo AOMT基因。序列分析结果表明:Ag CCo AOMT基... 根据伞形科(Apiaceae)植物芹菜(Apium graveolens Linn.)的转录组数据库,从芹菜品种‘六合黄心芹’(‘Liuhe Huangxinqin’)叶片总RNA中克隆获得咖啡碱-辅酶A-O-甲基转移酶基因,命名为Ag CCo AOMT基因。序列分析结果表明:Ag CCo AOMT基因包含1个长度726 bp的开放阅读框(ORF),编码241个氨基酸;该基因编码的蛋白质为Ag CCo AOMT,其理论相对分子质量为27 010,理论等电点p I 5.35;在Ag CCo AOMT蛋白中,酸性氨基酸所占比例高于碱性氨基酸,脂肪族氨基酸所占比例约为芳香族氨基酸的3倍;该蛋白属于疏水性蛋白,并含有1个保守的Ado Met_MTases结构域,说明Ag CCo AOMT蛋白属于Ado Met_MTases超级家族;Ag CCo AOMT蛋白的三级结构包含多个α-螺旋和β-折叠,与紫花苜蓿(Medicago sativa Linn.)CCo AOMT蛋白三级结构的一致性为84.58%。多重比对和系统树分析结果表明:Ag CCo AOMT蛋白有较高的保守性;该蛋白与同科植物大阿米芹(Ammi majus Linn.)和欧芹〔Petroselinum crispum(Mill.)Nyman ex A.W.Hill〕CCo AOMT蛋白的进化关系最近,与睡莲科(Nymphaeaceae)植物莲(Nelumbo nucifera Gaertn.)CCo AOMT蛋白的进化关系较近。qRT-PCR检测结果表明:Ag CCo AOMT基因能够在‘六合黄心芹’的根、茎、叶柄和叶片中表达,且在叶片中的相对表达量极显著(P<0.01)高于其他组织,说明该基因的表达具有明显的组织特异性;不同生长发育阶段该基因在叶片中的相对表达量有明显差异,其在商品期(播种后第65天)的相对表达量极显著高于幼苗期(播种后第25天)和生长旺盛期(播种后第45天)。研究结果显示:Ag CCo AOMT基因与‘六合黄心芹’叶的老化和木质素含量升高有关,且在进化过程中具有较高的保守性。 展开更多
关键词 芹菜 AgCCoAOMT基因 序列分析 多重比对 表达特性
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