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盐池滩羊背最长肌中与肌肉发育和肉质形成相关lncRNA的筛选与功能分析
被引量：
1
1
作者
刘依兰
胡亚美
+2 位作者
李惠侠
卢佳伟
刘媛
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025年第2期284-295,共12页
盐池滩羊是我国宁夏特产,凭借极佳肉质驰名中外,但目前仍不清楚其肌肉发育和肉质形成的详细机制。为初步探究滩羊肌肉发育中独有的分子机制,本研究以6月龄和12月龄雌性滩羊为研究对象,采集其背最长肌(longissimus dorsi muscle,LDM)样品...
盐池滩羊是我国宁夏特产,凭借极佳肉质驰名中外,但目前仍不清楚其肌肉发育和肉质形成的详细机制。为初步探究滩羊肌肉发育中独有的分子机制,本研究以6月龄和12月龄雌性滩羊为研究对象,采集其背最长肌(longissimus dorsi muscle,LDM)样品,通过转录物组测序(transcriptome sequencing,RNA-seq)筛选出可能在调控滩羊肌肉发育和肉质形成方面发挥重要作用的基因和长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。结果表明,两组LDM间共有504条mRNA和1483条lncRNA差异显著(P<0.05),还预测到了103个差异显著的潜在lncRNA-mRNA顺式调控关系对(P<0.05)。随后根据差异表达mRNA功能分析筛选出MSTN、CDKN1A、FHL 1等骨骼肌发育相关基因和LPL、SCD等骨骼肌代谢相关基因,根据差异表达lncRNA靶基因功能分析筛选出13个可能与肌肉发育相关(ADDIN CNKISM.UserStyleLNC.17926.1、LNC.981.1、LNC.16284.1等)和8个可能与骨骼肌代谢相关(LNC.15496.1、LNC.18149.1等)的lncRNA。随机选取2组均表达的5个lncRNA和4个mRNA进行qPCR验证,结果与RNA-seq一致,佐证了测序结果的可靠性。本研究为今后探究滩羊肌肉发育、肉质形成机制和开展分子育种打下了坚实基础,为改良国内其他绵羊品种的产肉性能提供了科学依据。
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关键词
滩羊
肌肉发育
肉质
长非编码RNA
转录物组测序
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职称材料
题名
盐池滩羊背最长肌中与肌肉发育和肉质形成相关lncRNA的筛选与功能分析
被引量：
1
1
作者
刘依兰
胡亚美
李惠侠
卢佳伟
刘媛
机构
南京农业大学动物科技学院动物繁殖科学系草食动物教研室
宁夏
大学
动物
科技
学院
动物
遗传育种与
繁殖
系
牛羊繁育
教研室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025年第2期284-295,共12页
基金
宁夏自然科学基金重点项目(No.2023AAC02013)资助。
文摘
盐池滩羊是我国宁夏特产,凭借极佳肉质驰名中外,但目前仍不清楚其肌肉发育和肉质形成的详细机制。为初步探究滩羊肌肉发育中独有的分子机制,本研究以6月龄和12月龄雌性滩羊为研究对象,采集其背最长肌(longissimus dorsi muscle,LDM)样品,通过转录物组测序(transcriptome sequencing,RNA-seq)筛选出可能在调控滩羊肌肉发育和肉质形成方面发挥重要作用的基因和长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。结果表明,两组LDM间共有504条mRNA和1483条lncRNA差异显著(P<0.05),还预测到了103个差异显著的潜在lncRNA-mRNA顺式调控关系对(P<0.05)。随后根据差异表达mRNA功能分析筛选出MSTN、CDKN1A、FHL 1等骨骼肌发育相关基因和LPL、SCD等骨骼肌代谢相关基因,根据差异表达lncRNA靶基因功能分析筛选出13个可能与肌肉发育相关(ADDIN CNKISM.UserStyleLNC.17926.1、LNC.981.1、LNC.16284.1等)和8个可能与骨骼肌代谢相关(LNC.15496.1、LNC.18149.1等)的lncRNA。随机选取2组均表达的5个lncRNA和4个mRNA进行qPCR验证,结果与RNA-seq一致,佐证了测序结果的可靠性。本研究为今后探究滩羊肌肉发育、肉质形成机制和开展分子育种打下了坚实基础,为改良国内其他绵羊品种的产肉性能提供了科学依据。
关键词
滩羊
肌肉发育
肉质
长非编码RNA
转录物组测序
Keywords
Tan sheep
muscle development
meat quality
long non-coding RNA(lncRNAs)
transcriptome sequencing(RNA-seq)
分类号
Q752 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
盐池滩羊背最长肌中与肌肉发育和肉质形成相关lncRNA的筛选与功能分析
刘依兰
胡亚美
李惠侠
卢佳伟
刘媛
《中国生物化学与分子生物学报》
北大核心
2025
1
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职称材料
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引证文献
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