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高产小麦新品种百农207及其姊妹系的基因组构成分析
被引量:
5
1
作者
马超
吴皓
+5 位作者
欧行奇
李新华
乔红
秦广雍
刘文轩
亓增军
《郑州大学学报(理学版)》
CAS
北大核心
2020年第2期118-126,共9页
结合染色体荧光原位杂交和小麦15 K育种芯片杂交技术,对黄淮南片麦区的主导新品种百农207及其双亲百农64和周麦16,以及10个姊妹系的染色体和基因组构成进行了分析。结果显示:百农64对百农207基因组的贡献率为55.3%,周麦16的贡献率为40....
结合染色体荧光原位杂交和小麦15 K育种芯片杂交技术,对黄淮南片麦区的主导新品种百农207及其双亲百农64和周麦16,以及10个姊妹系的染色体和基因组构成进行了分析。结果显示:百农64对百农207基因组的贡献率为55.3%,周麦16的贡献率为40.7%,并且百农207具有64个新位点或重组位点。此外,在参试材料中检测到9种染色体变异类型,其中5种来自百农64,4种来自周麦16或由双亲染色体重组而产生。结合荧光原位杂交和双亲差异SNP位点重组分析,将6B染色体臂间倒位区段初步定位在短臂50.1 Mb到长臂475.5 Mb之间,5A染色体长臂上的重复序列区段定位在66.1 Mb。
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关键词
小麦新品种
百农207
基因组构成
荧光原位杂交
SNP位点
染色体结构变异
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职称材料
秋葵AeMYB1R1转录因子基因克隆及对胁迫的响应
被引量:
3
2
作者
朱志鹏
刘慧玲
+3 位作者
吴可鑫
虞健翔
王博文
孙淼
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期909-919,共11页
MYB转录因子家族广泛参与了植物对干旱、盐渍、冷害等非生物胁迫的应答。为了深入研究秋葵[Abelmoschus esculentus(L.) Moench]中的MYB类转录因子,该研究以‘北海道1号’秋葵为研究对象,采用PCR方法克隆AeMYB1R1基因,并借助生物信息学...
MYB转录因子家族广泛参与了植物对干旱、盐渍、冷害等非生物胁迫的应答。为了深入研究秋葵[Abelmoschus esculentus(L.) Moench]中的MYB类转录因子,该研究以‘北海道1号’秋葵为研究对象,采用PCR方法克隆AeMYB1R1基因,并借助生物信息学进行特征分析;采用qRT-PCR荧光定量方法分析其表达模式及其在非生物胁迫下的表达特性。结果表明:(1)成功克隆获得1个秋葵AeMYB1R1基因;该基因包含1个1 056 bp的开放阅读框,编码352个氨基酸;序列对比和系统进化树结果显示,AeMYB1R1在植物进化过程中具有较高的保守性;AeMYB1R1蛋白分子量为37 891.57 Da,等电点为8.75,含有较多的谷氨酸和较少的色氨酸,以及较多潜在的磷酸化位点和糖基化位点。(2)结构分析显示,AeMYB1R1蛋白主要由α螺旋和无规则卷曲构成,无信号肽和跨膜结构,为疏水性蛋白;同时,氨基酸序列在第104至第156位含有一个保守结构域,表明其属于SHAQKYF类MYB家族转录因子。(3)qRT-PCR结果显示,AeMYB1R1基因在秋葵叶中的表达量最高,其次是根和茎,具有组织表达特性;与高温和低温胁迫相比,在盐胁迫和干旱胁迫中AeMYB1R1表达量更高,说明AeMYB1R1可能是秋葵抗盐和抗旱的关键转录因子。研究结果为AeMYB1R1基因在秋葵生长发育和抗逆机制中的功能研究奠定了理论依据。
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关键词
秋葵
AeMYB1R1
非生物胁迫
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职称材料
题名
高产小麦新品种百农207及其姊妹系的基因组构成分析
被引量:
5
1
作者
马超
吴皓
欧行奇
李新华
乔红
秦广雍
刘文轩
亓增军
机构
河南
农业
大学
生命科学学院
南京农业大学作物遗传与种质改良国家重点实验室
河南科技学院生命科技学院
郑州
大学
农学院
出处
《郑州大学学报(理学版)》
CAS
北大核心
2020年第2期118-126,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31571658)
南京农业大学作物遗传与种质改良国家重点实验室课题(ZW2011002)
河南省科技攻关重大项目(151100110700)。
文摘
结合染色体荧光原位杂交和小麦15 K育种芯片杂交技术,对黄淮南片麦区的主导新品种百农207及其双亲百农64和周麦16,以及10个姊妹系的染色体和基因组构成进行了分析。结果显示:百农64对百农207基因组的贡献率为55.3%,周麦16的贡献率为40.7%,并且百农207具有64个新位点或重组位点。此外,在参试材料中检测到9种染色体变异类型,其中5种来自百农64,4种来自周麦16或由双亲染色体重组而产生。结合荧光原位杂交和双亲差异SNP位点重组分析,将6B染色体臂间倒位区段初步定位在短臂50.1 Mb到长臂475.5 Mb之间,5A染色体长臂上的重复序列区段定位在66.1 Mb。
关键词
小麦新品种
百农207
基因组构成
荧光原位杂交
SNP位点
染色体结构变异
Keywords
wheat variety
BN207
genomic composition
FISH
SNP locus
chromosomal variation
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
秋葵AeMYB1R1转录因子基因克隆及对胁迫的响应
被引量:
3
2
作者
朱志鹏
刘慧玲
吴可鑫
虞健翔
王博文
孙淼
机构
江苏省盐土生物资源研究
重点
实验室
南京农业大学
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期909-919,共11页
基金
江苏省盐土生物资源研究重点实验室开放项目(JKLBS2016002)
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(21KJB210007)。
文摘
MYB转录因子家族广泛参与了植物对干旱、盐渍、冷害等非生物胁迫的应答。为了深入研究秋葵[Abelmoschus esculentus(L.) Moench]中的MYB类转录因子,该研究以‘北海道1号’秋葵为研究对象,采用PCR方法克隆AeMYB1R1基因,并借助生物信息学进行特征分析;采用qRT-PCR荧光定量方法分析其表达模式及其在非生物胁迫下的表达特性。结果表明:(1)成功克隆获得1个秋葵AeMYB1R1基因;该基因包含1个1 056 bp的开放阅读框,编码352个氨基酸;序列对比和系统进化树结果显示,AeMYB1R1在植物进化过程中具有较高的保守性;AeMYB1R1蛋白分子量为37 891.57 Da,等电点为8.75,含有较多的谷氨酸和较少的色氨酸,以及较多潜在的磷酸化位点和糖基化位点。(2)结构分析显示,AeMYB1R1蛋白主要由α螺旋和无规则卷曲构成,无信号肽和跨膜结构,为疏水性蛋白;同时,氨基酸序列在第104至第156位含有一个保守结构域,表明其属于SHAQKYF类MYB家族转录因子。(3)qRT-PCR结果显示,AeMYB1R1基因在秋葵叶中的表达量最高,其次是根和茎,具有组织表达特性;与高温和低温胁迫相比,在盐胁迫和干旱胁迫中AeMYB1R1表达量更高,说明AeMYB1R1可能是秋葵抗盐和抗旱的关键转录因子。研究结果为AeMYB1R1基因在秋葵生长发育和抗逆机制中的功能研究奠定了理论依据。
关键词
秋葵
AeMYB1R1
非生物胁迫
Keywords
Abelmoschus esculentus(L.)Moench
AeMYB1R1
abiotic stress
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高产小麦新品种百农207及其姊妹系的基因组构成分析
马超
吴皓
欧行奇
李新华
乔红
秦广雍
刘文轩
亓增军
《郑州大学学报(理学版)》
CAS
北大核心
2020
5
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下载PDF
职称材料
2
秋葵AeMYB1R1转录因子基因克隆及对胁迫的响应
朱志鹏
刘慧玲
吴可鑫
虞健翔
王博文
孙淼
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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职称材料
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