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幽门螺杆菌致病相关基因集群多态性的研究
被引量：
5
1
作者
刘炯
王忠灿
+7 位作者
金鑫鑫
汪芳裕
陈春燕
王震凯
朱乐明
万海军
陆恒
施慧
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2012年第11期1136-1140,共5页
目的基因多态性已逐渐成为幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)新的研究热点。文中旨在研究临床Hp菌株中cagA、cagM、cagZ、cagⅠ-Ⅱ接点、IS605等cag致病岛(cag pathogenicity island,cagPAI)相关的遗传学位点的多样性分布及其与胃十...
目的基因多态性已逐渐成为幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)新的研究热点。文中旨在研究临床Hp菌株中cagA、cagM、cagZ、cagⅠ-Ⅱ接点、IS605等cag致病岛(cag pathogenicity island,cagPAI)相关的遗传学位点的多样性分布及其与胃十二指肠疾病的关系。方法参照标准菌株NCTC11638序列设计引物,特异性PCR方法检测253株Hp菌株中,cagA、cagM、cagZ基因、cagⅠ-Ⅱ接点以及IS605等不同遗传学位点的分布情况。结果 253株临床分离的Hp菌株中,cagA基因的检出率为92.5%(234/253);cagM的检出率为86.2%(218/253);cagZ的检出率为66%(167/253);在慢性非萎缩性胃炎、消化性溃疡、胃癌中的检出率差异均无统计学意义(P>0.05)。仅5.1%(13/253)的Hp菌株中可检测到具有西方菌株特征的cagⅠ-Ⅱ接点的存在,提示中国大部分菌株中的cagⅠ-Ⅱ接点存在明显不同于西方菌株的结构形式;含西方菌株连续状态特征的cagPAI在消化性溃疡中13.3%(10/75)的检出率明显高于慢性非萎缩性胃炎中1.4%(2/146)的检出率(P<0.01)。IS605在慢性非萎缩性胃炎中51.4%(75/146)的检出率明显高于消化性溃疡中28%(21/75)的检出率(P<0.01)。结论cagPAI集群的序列结构具有丰富的基因多样性;cagA、cagM、cagZ等遗传学位点单独无一可作为临床Hp菌株的毒力标志;IS605的存在可能影响菌株的毒力发挥;cagⅠ-Ⅱ接点区域可能存在中国或东亚菌株的特征性结构。
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关键词
幽门螺杆菌
基因多态性
CAG致病岛
IS605
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职称材料
应用噬菌体肽文库筛选肾综合征出血热病毒优势B细胞结合表位肽
2
作者
王倩
俞守义
王长军
《医学研究生学报》
CAS
2008年第5期475-479,共5页
目的：应用噬菌体展示肽文库筛选鉴定肾综合征出血热病毒优势B细胞结合表位肽。方法：以Prote in-A纯化的肾综合征出血热患者恢复期血清为筛选配基,对经正常人血清预吸附的噬菌体展示随机12肽文库（或次级肽文库）进行生物亲和淘选;夹心...
目的：应用噬菌体展示肽文库筛选鉴定肾综合征出血热病毒优势B细胞结合表位肽。方法：以Prote in-A纯化的肾综合征出血热患者恢复期血清为筛选配基,对经正常人血清预吸附的噬菌体展示随机12肽文库（或次级肽文库）进行生物亲和淘选;夹心ELISA、竞争ELISA鉴定所获得克隆的结合特性,并进一步对阳性克隆进行序列测定和分析。结果：ELISA测定显示,通过5轮淘选得到的噬菌体克隆半数以上可与筛选血清发生特异性结合;对45个阳性克隆进行序列测定分析,根据其推导的氨基酸序列可大致分为8组,同源性分析显示,Ⅰ-Ⅶ组序列基序可能为LVXKR、LTXR、IXKP、LXPA、VGA、KX IR、EKXP,其中4组基序在病毒结构蛋白氨基酸序列中发现同源区。结论：获得了一组肾综合征出血热病毒（HFRSV）优势B细胞表位肽,HFRSV核蛋白可能是诱导高水平抗体的主要免疫原,研究结果为基于表位的基因工程诊断试剂的研制和多肽疫苗的设计提供依据。
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关键词
肾综合征出血热病毒
噬菌体展示肽文库
抗体
表位
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职称材料
题名
幽门螺杆菌致病相关基因集群多态性的研究
被引量：
5
1
作者
刘炯
王忠灿
金鑫鑫
汪芳裕
陈春燕
王震凯
朱乐明
万海军
陆恒
施慧
机构
南京军区
南京
总医院消化内科
南京军区疾病控制中心
出处
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2012年第11期1136-1140,共5页
基金
江苏省自然科学基金(BK2008069)
文摘
目的基因多态性已逐渐成为幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)新的研究热点。文中旨在研究临床Hp菌株中cagA、cagM、cagZ、cagⅠ-Ⅱ接点、IS605等cag致病岛(cag pathogenicity island,cagPAI)相关的遗传学位点的多样性分布及其与胃十二指肠疾病的关系。方法参照标准菌株NCTC11638序列设计引物,特异性PCR方法检测253株Hp菌株中,cagA、cagM、cagZ基因、cagⅠ-Ⅱ接点以及IS605等不同遗传学位点的分布情况。结果 253株临床分离的Hp菌株中,cagA基因的检出率为92.5%(234/253);cagM的检出率为86.2%(218/253);cagZ的检出率为66%(167/253);在慢性非萎缩性胃炎、消化性溃疡、胃癌中的检出率差异均无统计学意义(P>0.05)。仅5.1%(13/253)的Hp菌株中可检测到具有西方菌株特征的cagⅠ-Ⅱ接点的存在,提示中国大部分菌株中的cagⅠ-Ⅱ接点存在明显不同于西方菌株的结构形式;含西方菌株连续状态特征的cagPAI在消化性溃疡中13.3%(10/75)的检出率明显高于慢性非萎缩性胃炎中1.4%(2/146)的检出率(P<0.01)。IS605在慢性非萎缩性胃炎中51.4%(75/146)的检出率明显高于消化性溃疡中28%(21/75)的检出率(P<0.01)。结论cagPAI集群的序列结构具有丰富的基因多样性;cagA、cagM、cagZ等遗传学位点单独无一可作为临床Hp菌株的毒力标志;IS605的存在可能影响菌株的毒力发挥;cagⅠ-Ⅱ接点区域可能存在中国或东亚菌株的特征性结构。
关键词
幽门螺杆菌
基因多态性
CAG致病岛
IS605
Keywords
Helicobacter pylori
Gene polymorphism
Cag pathogenicity island
IS605
分类号
Q939.405 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
应用噬菌体肽文库筛选肾综合征出血热病毒优势B细胞结合表位肽
2
作者
王倩
俞守义
王长军
机构
南方医科大学
南京
临床医学院、
南京军区
南京
总医院医务部
南方医科大学流行病学教研室
南京军区疾病控制中心
出处
《医学研究生学报》
CAS
2008年第5期475-479,共5页
文摘
目的：应用噬菌体展示肽文库筛选鉴定肾综合征出血热病毒优势B细胞结合表位肽。方法：以Prote in-A纯化的肾综合征出血热患者恢复期血清为筛选配基,对经正常人血清预吸附的噬菌体展示随机12肽文库（或次级肽文库）进行生物亲和淘选;夹心ELISA、竞争ELISA鉴定所获得克隆的结合特性,并进一步对阳性克隆进行序列测定和分析。结果：ELISA测定显示,通过5轮淘选得到的噬菌体克隆半数以上可与筛选血清发生特异性结合;对45个阳性克隆进行序列测定分析,根据其推导的氨基酸序列可大致分为8组,同源性分析显示,Ⅰ-Ⅶ组序列基序可能为LVXKR、LTXR、IXKP、LXPA、VGA、KX IR、EKXP,其中4组基序在病毒结构蛋白氨基酸序列中发现同源区。结论：获得了一组肾综合征出血热病毒（HFRSV）优势B细胞表位肽,HFRSV核蛋白可能是诱导高水平抗体的主要免疫原,研究结果为基于表位的基因工程诊断试剂的研制和多肽疫苗的设计提供依据。
关键词
肾综合征出血热病毒
噬菌体展示肽文库
抗体
表位
Keywords
Hemorrhagic fever with renal syndrome virus
Phage display peptide library
Poly-clonal antibody
Epitope
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
幽门螺杆菌致病相关基因集群多态性的研究
刘炯
王忠灿
金鑫鑫
汪芳裕
陈春燕
王震凯
朱乐明
万海军
陆恒
施慧
《医学研究生学报》
CAS
北大核心
2012
5
在线阅读
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职称材料
2
应用噬菌体肽文库筛选肾综合征出血热病毒优势B细胞结合表位肽
王倩
俞守义
王长军
《医学研究生学报》
CAS
2008
0
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已选择
0
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