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网络药理学联合circRNA研究凉血通瘀方干预脑出血急性期药效机制
1
作者
李薇懿
王燕
李国春
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第9期2254-2264,共11页
目的通过研究凉血通瘀方对于自发性高血压大鼠(Spontaneously hypertensive rats,SHR)脑出血急性期环状RNA(circRNA)的作用靶点及可能相关信号通路,探讨凉血通瘀方治疗脑出血急性期的药效机制。方法将SHR分成模型组、实验组及空白组,模...
目的通过研究凉血通瘀方对于自发性高血压大鼠(Spontaneously hypertensive rats,SHR)脑出血急性期环状RNA(circRNA)的作用靶点及可能相关信号通路,探讨凉血通瘀方治疗脑出血急性期的药效机制。方法将SHR分成模型组、实验组及空白组,模型组、实验组构建脑出血SHR模型,并对SHR神经功能损伤进行评分。术后实验组给予凉血通瘀方,模型组、空白组给予等剂量生理盐水,各5天。借助高通量测序技术检测3组SHR脑组织样本中circRNA,对显著差异表达的circRNA进行聚类分析、GO和KEGG富集分析。使用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR,RT-PCR)验证差异倍数排名前5的显著差异circRNA的表达情况。将显著差异表达的circRNA转化为人类同源基因,结合课题组前期筛选的脑出血急性期治疗靶点,得到交集靶点输入Cytoscape软件构建中药-成分-靶点-通路网络。结果测序结果为显著差异表达的circRNA共有150个,其中60个为上调、90个为下调circRNA。RT-PCR验证结果显示前5名circRNA的表达趋势与高通量测序结果一致。网络药理学结果显示,凉血通瘀方中赤芍、大黄、地黄、牡丹皮、石菖蒲和三七6味中药里多种活性成分对应脑出血急性期治疗靶点PRKCA,即CIRI_circ_10530的亲本基因。849条GO富集条目中有CIRI_circ_10530亲本基因分布的共209条;149条KEGG信号通路中CIRI_circ_10530亲本基因分布在62条信号通路中。其中大黄是凉血通瘀方中治疗脑出血急性期的重要中药,山柰酚、大黄素和槲皮素为药效机制的重要活性成分。结论凉血通瘀方干预脑出血急性期的作用机制可能与山柰酚、槲皮素和大黄素等关键活性成分激活PRKCA,并调控PKC影响其关键信号通路有关。
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关键词
凉血通瘀方
脑出血急性期
circRNA
网络药理学
转录组学
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职称材料
凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响
被引量：
7
2
作者
李薇懿
李国春
+6 位作者
魏乐心
钱勤
郭晴晴
杨诗锦
杨晓娟
王鹏程
陈杨
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022年第5期1933-1943,共11页
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,...
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。
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关键词
凉血通瘀方
miRNA
高通量测序
大鼠脑组织
差异表达
急性脑出血
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职称材料
题名
网络药理学联合circRNA研究凉血通瘀方干预脑出血急性期药效机制
1
作者
李薇懿
王燕
李国春
机构
河南
中医药大学
第一附属医院
南京中医药大学公共卫生系
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024年第9期2254-2264,共11页
基金
国家自然科学基金委员会面上项目(81373512):急性脑出血瘀热病机单元的动态测量及其生物标志物的研究,负责人:李国春。
文摘
目的通过研究凉血通瘀方对于自发性高血压大鼠(Spontaneously hypertensive rats,SHR)脑出血急性期环状RNA(circRNA)的作用靶点及可能相关信号通路,探讨凉血通瘀方治疗脑出血急性期的药效机制。方法将SHR分成模型组、实验组及空白组,模型组、实验组构建脑出血SHR模型,并对SHR神经功能损伤进行评分。术后实验组给予凉血通瘀方,模型组、空白组给予等剂量生理盐水,各5天。借助高通量测序技术检测3组SHR脑组织样本中circRNA,对显著差异表达的circRNA进行聚类分析、GO和KEGG富集分析。使用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR,RT-PCR)验证差异倍数排名前5的显著差异circRNA的表达情况。将显著差异表达的circRNA转化为人类同源基因,结合课题组前期筛选的脑出血急性期治疗靶点,得到交集靶点输入Cytoscape软件构建中药-成分-靶点-通路网络。结果测序结果为显著差异表达的circRNA共有150个,其中60个为上调、90个为下调circRNA。RT-PCR验证结果显示前5名circRNA的表达趋势与高通量测序结果一致。网络药理学结果显示,凉血通瘀方中赤芍、大黄、地黄、牡丹皮、石菖蒲和三七6味中药里多种活性成分对应脑出血急性期治疗靶点PRKCA,即CIRI_circ_10530的亲本基因。849条GO富集条目中有CIRI_circ_10530亲本基因分布的共209条;149条KEGG信号通路中CIRI_circ_10530亲本基因分布在62条信号通路中。其中大黄是凉血通瘀方中治疗脑出血急性期的重要中药,山柰酚、大黄素和槲皮素为药效机制的重要活性成分。结论凉血通瘀方干预脑出血急性期的作用机制可能与山柰酚、槲皮素和大黄素等关键活性成分激活PRKCA,并调控PKC影响其关键信号通路有关。
关键词
凉血通瘀方
脑出血急性期
circRNA
网络药理学
转录组学
Keywords
Liangxue Tongyu Prescription
Acute phase of Intracerebral hemorrhage
circRNA
Network pharmacology
Transcriptomics
分类号
R-058 [医药卫生]
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职称材料
题名
凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响
被引量：
7
2
作者
李薇懿
李国春
魏乐心
钱勤
郭晴晴
杨诗锦
杨晓娟
王鹏程
陈杨
机构
南京中医药大学公共卫生系
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022年第5期1933-1943,共11页
基金
国家自然科学基金委员会面上项目(81373512):急性脑出血瘀热病机单元的动态测量及其生物标志物的研究,负责人:李国春。
文摘
目的 研究凉血通瘀方对高血压大鼠急性脑出血模型脑组织miRNA表达的影响,对差异表达的miRNA靶基因进行分析,探索凉血通瘀方可能的药效机制。方法 将自发性高血压大鼠随机分成对照组(B)和实验组(C)。适应性饲养一周后,C组灌胃凉血通瘀方,B组灌胃等体积生理盐水,连续5天,每天1次。构建脑出血模型后收集脑组织,借助全转录组测序技术获得miRNA表达量,与miRBase数据库比对获取已知miRNA,使用miRDeep2预测新miRNA。差异分析软件为DESeq2,筛选阈值为|log2FC|>=1并且P <0.05。对显著差异表达的miRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集和PPI网络分析。结果实验组和对照组对比,共发现21个显著差异表达的miRNA,上调有9个,下调有12个,共预测得到1243个有统计学意义的靶基因。GO富集分析发现,生物过程中突触囊泡分泌的调节、神经递质分泌的调节和神经递质运输的调节占前三位,神经元投射终点、全膜、质膜区域和细胞投射则是主要的细胞成分。分子功能分别为小GTPase绑定、底物特异性跨膜转运蛋白活性和离子跨膜转运体活性。通路分析结果显示,靶基因在癌证通路、pI3K-Akt信号通路、人类乳头瘤病毒感染、神经活性配体-受体相互作用和MAPK通路等分布广泛。采用STRING网站和Cytoscape软件,根据MCC算法筛选出ADRA2C、CASR、CCL28、CCR1、DRD2、GNAT3、GRM2、DYNC1LI1、GABBR1、GNAI1等核心靶基因。结论 凉血通瘀方对脑出血急性期鼠脑组织内miRNA的表达有重要影响;显著差异表达miRNAs可能通过靶向核心基因调控凉血通瘀方干预急性脑出血的病理过程及预后。
关键词
凉血通瘀方
miRNA
高通量测序
大鼠脑组织
差异表达
急性脑出血
Keywords
Liangxue Tongyu Prescription
miRNA
High-throughput sequencing technology
Rat brain tissue
Differential expression
Acute stage of cerebral hemorrhage
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
网络药理学联合circRNA研究凉血通瘀方干预脑出血急性期药效机制
李薇懿
王燕
李国春
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2024
0
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职称材料
2
凉血通瘀方干预高血压大鼠急性脑出血模型对脑组织中差异miRNA表达的影响
李薇懿
李国春
魏乐心
钱勤
郭晴晴
杨诗锦
杨晓娟
王鹏程
陈杨
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022
7
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