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强直性肌营养不良症DMPK基因CTG重复序列与Alu±1kb单倍型研究 被引量:1
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作者 肖翠英 武辉 +1 位作者 潘阿根 张思仲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期81-84,共4页
强直性肌营养不良(myotonicdystrophy,DM)是由于DMPK基因3′非翻译区CTG重复序列异常扩展所致的、主要累及神经肌肉系统的常染色体显性遗传病。在该基因的第8内含子中还存在一个Alu重复序列的1kb插入/缺失多态性,即Alu±1kb多态性... 强直性肌营养不良(myotonicdystrophy,DM)是由于DMPK基因3′非翻译区CTG重复序列异常扩展所致的、主要累及神经肌肉系统的常染色体显性遗传病。在该基因的第8内含子中还存在一个Alu重复序列的1kb插入/缺失多态性,即Alu±1kb多态性。为了帮助阐明汉族人群中DM突变的起源,并为解释DM在不同群体中发病率的差异提供更多依据 ,本文从300例已知CTG拷贝数的正常汉族群体中随机挑选60例,首先通过PCR扩增确定其Alu±1kb多态性 ,然后对Alu±1kb和CTG双杂合的标本,采用长PCR方法先行扩增含Alu±1kb和CTG重复序列的DNA片段,再分别对含Alu( +)和Alu( -)的DNA片段中的CTG拷贝数进行常规PCR分析,以确定二位点的单倍型。结果表明60例正常人中二位点间呈连锁不平衡。其单倍型为:(CTG) 5 均与Alu( +)连锁 ;多数(CTG)11~14与Alu( -)连锁 ;在两个(CTG)≥19的等位基因中一个与Alu( +)连锁 ,另一个与Alu( -)连锁。各民族相关资料的比较提示 ,汉族人群中(CTG)11~14与非洲黑人的起源可能不同;(CTG)19~30/Alu-1kb在汉族人群中的频率远比欧洲人群的高 ;(CTG)19~30/Alu-1kb与(CTG)19~30/Alu +1kb在汉族人群中是以一定比例共存的 ;(CTG)19~30在不同民族间的起源不尽相同 ;如果从(CTG)5 到(CTG)19~30的假设成立的话 ,则很可能? 展开更多
关键词 DM DMPK基因 CTG重复序列 Alu±1kb单倍型
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中国羌族人群强直性肌营养不良症基因CTG重复序列多态性研究
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作者 敬慧娥 张思仲 +1 位作者 肖翠英 武辉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第4期7-11,共5页
强直性肌营养不良症是由于MT-PK基因3′非编码区CTG三核苷酸重复序列的过度扩展所致。正常人群中CTG的拷贝数为5~30,而患者在50以上,且具民族差异。目前尚无我国羌族人群的有关资料。为了解中国羌族人群该基因3′... 强直性肌营养不良症是由于MT-PK基因3′非编码区CTG三核苷酸重复序列的过度扩展所致。正常人群中CTG的拷贝数为5~30,而患者在50以上,且具民族差异。目前尚无我国羌族人群的有关资料。为了解中国羌族人群该基因3′UTRCTG三核苷重复序列的分布情况,作者采用PCR、聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染和测序等技术,对60例正常羌族人的CTG重复序列进行了分析。共发现8种等位基因,其中CTG拷贝数为5的等位基因最为常见,占3083%,其余依次为13拷贝(225%)、12(1917%)、11(1583%)、14(583%)和15(417%);拷贝数大于15的等位基因极少,仅检测到一例,为27拷贝;CTG拷贝数在6~10之间的等位基因也很少,仅发现一例为9拷贝,而该等位基因在其它人群尚无报道。60名个体中共发现纯合子18例,其中9例为5/5,2例为11/11,2例为12/12,4例13/13和1例为15/15,杂合率为70%。本系统的多态信息量(PIC)为077。羌族和汉族人群该位点的多态性无显著差异。 展开更多
关键词 羌族 强直性 肌营养不良 CTG重复序列 DNA多态性
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基于生物信息学的SNP候选位点搜寻方法 被引量:21
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作者 陈炜 张戈 张思仲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期153-156,共4页
单核苷酸多态性 (Single Nucleotide Polymorphism, SNP)是人类基因组中最常见的遗传多态,在遗传学研究的很多方面具有重要的作用。它的搜寻正受到广泛关注。近年来,国际上出现了一种基于生物信息学的发掘SNP新方法。本文对该方法的... 单核苷酸多态性 (Single Nucleotide Polymorphism, SNP)是人类基因组中最常见的遗传多态,在遗传学研究的很多方面具有重要的作用。它的搜寻正受到广泛关注。近年来,国际上出现了一种基于生物信息学的发掘SNP新方法。本文对该方法的两种策略及其各自所存在的问题作一介绍。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 SNP 生物信息学 人类基因组计划
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用长PCR方法检测含有较大缺失或插入的DNA大片段 被引量:2
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作者 武辉 张思仲 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期8-10,共3页
选择位于19q133上的人类肌张力蛋白激酶基因(myotoninproteinkinasegene,MT-PK)为靶基因(基因全长为14kb),以G+C含量较高且含有1kb缺失或插入,由基因第8内含子中的Alu±... 选择位于19q133上的人类肌张力蛋白激酶基因(myotoninproteinkinasegene,MT-PK)为靶基因(基因全长为14kb),以G+C含量较高且含有1kb缺失或插入,由基因第8内含子中的Alu±1kb的5'端至第15外显子3'非编码区中的CTG重复序列3'端,即两者间的距离为53kb的DNA片段为待扩增靶序列,通过优化DNA聚合酶的组合和反应缓冲体系,重点考查了含有Alu-1kb和Alu+1kb缺失或插入的MT-PK等位基因片段共扩增的长PCR方法。本方法可有效地同步扩增65kb和55kb两个等位基因片段,对65kb和55kb纯合等位片段则达到了更有效的扩增。 展开更多
关键词 长PCR 等位基因 扩增 缺失 插入
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