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基于TBtools观赏桃花青素调控PpTTG1s基因家族分析
1
作者
张文斗
胡坤
+2 位作者
徐曼
顾振华
王燕
《中国果树》
2024年第12期36-42,共7页
以中油桃14种质作为参考基因组,采用生物信息学工具对中国特有植物观赏桃中的PpTTG1s基因家族进行了系统分析,旨在深入理解该基因家族在花色形成中的调控机制。结果显示,14个PpTTG1s家族成员均含有WD40保守结构域,表明它们可能在植物生...
以中油桃14种质作为参考基因组,采用生物信息学工具对中国特有植物观赏桃中的PpTTG1s基因家族进行了系统分析,旨在深入理解该基因家族在花色形成中的调控机制。结果显示,14个PpTTG1s家族成员均含有WD40保守结构域,表明它们可能在植物生长发育和花青素合成途径中具有共同的功能。通过染色体定位和共线性分析,揭示了PpTTG1s基因在染色体上的分布和演化关系,且与拟南芥的TTG1基因存在共线性。启动子分析表明,PpTTG1s的启动子上存在丰富的MYB元件和G-Box(bHLH)元件和少部分低温响应元件LTR,进一步支持了PpTTG1s基因家族在调控花色形成中的重要作用。为观赏桃花色性状的改良提供了重要信息和潜在的候选基因,对理解观赏桃花色调控机制及品种的改良具有积极的意义。
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关键词
观赏桃
PpTTG1s基因家族
TBtools
花青素
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题名
基于TBtools观赏桃花青素调控PpTTG1s基因家族分析
1
作者
张文斗
胡坤
徐曼
顾振华
王燕
机构
常德职业技术学院
华润
饮料
(
控股
)
有限公司
出处
《中国果树》
2024年第12期36-42,共7页
基金
常德职业技术学院青年项目“桃花花青素调控基因家族分析”(ZY2202)
2024年湖南省青年人才项目(2024TJ-X46)。
文摘
以中油桃14种质作为参考基因组,采用生物信息学工具对中国特有植物观赏桃中的PpTTG1s基因家族进行了系统分析,旨在深入理解该基因家族在花色形成中的调控机制。结果显示,14个PpTTG1s家族成员均含有WD40保守结构域,表明它们可能在植物生长发育和花青素合成途径中具有共同的功能。通过染色体定位和共线性分析,揭示了PpTTG1s基因在染色体上的分布和演化关系,且与拟南芥的TTG1基因存在共线性。启动子分析表明,PpTTG1s的启动子上存在丰富的MYB元件和G-Box(bHLH)元件和少部分低温响应元件LTR,进一步支持了PpTTG1s基因家族在调控花色形成中的重要作用。为观赏桃花色性状的改良提供了重要信息和潜在的候选基因,对理解观赏桃花色调控机制及品种的改良具有积极的意义。
关键词
观赏桃
PpTTG1s基因家族
TBtools
花青素
Keywords
ornamental peach
PpTTG1s gene family
TBtools
anthocyanins
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
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题名
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出处
发文年
被引量
操作
1
基于TBtools观赏桃花青素调控PpTTG1s基因家族分析
张文斗
胡坤
徐曼
顾振华
王燕
《中国果树》
2024
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