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线粒体ND5·Cytb部分序列在虎物种鉴定中的应用
1
作者
王利利
彭建军
于冬梅
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第8期4445-4446,共2页
[目的]根据线粒体ND5、Cytb基因部分序列,对送检的4件疑似虎的样品进行物种鉴定。[方法]利用PCR法,扩增样品的线粒体ND5、Cytb基因部分序列,对目的片段测序,通过blast比对,确定物种。[结果]4个样品的物种来源均为虎,但无法确认其亚种。...
[目的]根据线粒体ND5、Cytb基因部分序列,对送检的4件疑似虎的样品进行物种鉴定。[方法]利用PCR法,扩增样品的线粒体ND5、Cytb基因部分序列,对目的片段测序,通过blast比对,确定物种。[结果]4个样品的物种来源均为虎,但无法确认其亚种。[结论]虎亚种间的线粒体差异很小,并且存在不同亚种杂交的情况,只根据线粒体基因难以进行亚种鉴定。
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关键词
ND5
CYTB
D-LOOP
线粒体
物种鉴定
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职称材料
Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响
被引量：
2
2
作者
王利利
彭建军
+4 位作者
于冬梅
胡诗佳
高赛飞
傅美兰
刘曦庆
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第9期5101-5103,5106,共4页
[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个...
[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。[结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cyt b和12S rRNA基因进化速率不同产生的。[结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。
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关键词
系统进化
蛇
CYTB
12S
RRNA
进化速度
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职称材料
圆鼻巨蜥遗传多样性的RAPD分析
被引量：
1
3
作者
傅美兰
于冬梅
+1 位作者
王莹
彭建军
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第13期7842-7845,共4页
[目的]采用RAPD技术对圆鼻巨蜥（Varanus salvator）进行遗传多样性分析。[方法]用20个随机引物对圆鼻巨蜥36个个体的基因组DNA进行PCR扩增。[结果]有10对引物能扩出清晰稳定的条带,共扩增出2952条DNA片段,平均每个个体扩增出82个条带,...
[目的]采用RAPD技术对圆鼻巨蜥（Varanus salvator）进行遗传多样性分析。[方法]用20个随机引物对圆鼻巨蜥36个个体的基因组DNA进行PCR扩增。[结果]有10对引物能扩出清晰稳定的条带,共扩增出2952条DNA片段,平均每个个体扩增出82个条带,其中47条具多态性,多态性位点比为57.32%,36个个体间遗传距离为0.035 9~0.335 9,平均遗传距离为0.135 92。Nei s基因多样性指数H=0.181 9,Shannon s多样性指数I=0.263 0,表明圆鼻巨蜥具有较高的遗传多样性。[结论]采用UPGMA法构建了36个个体相互关系的分子聚类图,发现没有形成明显的种群分化。
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关键词
圆鼻巨蜥
遗传多样性
RAPD
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职称材料
题名
线粒体ND5·Cytb部分序列在虎物种鉴定中的应用
1
作者
王利利
彭建军
于冬梅
机构
华南濒危动物研究所物种鉴定中心
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第8期4445-4446,共2页
基金
广东省自然科学基金项目(9151026001000003)
广东省科学院优秀青年科技人才基金(200804)
广东省野生动物保护和利用公共实验室基金(200901)
文摘
[目的]根据线粒体ND5、Cytb基因部分序列,对送检的4件疑似虎的样品进行物种鉴定。[方法]利用PCR法,扩增样品的线粒体ND5、Cytb基因部分序列,对目的片段测序,通过blast比对,确定物种。[结果]4个样品的物种来源均为虎,但无法确认其亚种。[结论]虎亚种间的线粒体差异很小,并且存在不同亚种杂交的情况,只根据线粒体基因难以进行亚种鉴定。
关键词
ND5
CYTB
D-LOOP
线粒体
物种鉴定
Keywords
ND5
Cytb
Mitochondrion
Species identification
分类号
S184 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响
被引量：
2
2
作者
王利利
彭建军
于冬梅
胡诗佳
高赛飞
傅美兰
刘曦庆
机构
华南濒危动物研究所物种鉴定中心
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第9期5101-5103,5106,共4页
基金
广东省自然科学基金项目(9151026001000003)
广东省科学院优秀青年科技人才基金项目(200804)
广东省野生动物保护和利用公共实验室基金项目(200901)
文摘
[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。[结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cyt b和12S rRNA基因进化速率不同产生的。[结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。
关键词
系统进化
蛇
CYTB
12S
RRNA
进化速度
Keywords
Molecular phylogeny
Snake
Cyt b
12S rRNA
Evolution rate
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
圆鼻巨蜥遗传多样性的RAPD分析
被引量：
1
3
作者
傅美兰
于冬梅
王莹
彭建军
机构
暨南大学生命科学技术学院
华南濒危动物研究所物种鉴定中心
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第13期7842-7845,共4页
基金
广东省自然科学基金项目(9151026001000003)
广东省科学院优秀青年科技人才基金项目(200704)
广东省野生动物保护和利用公共实验室基金项目(200901)
文摘
[目的]采用RAPD技术对圆鼻巨蜥（Varanus salvator）进行遗传多样性分析。[方法]用20个随机引物对圆鼻巨蜥36个个体的基因组DNA进行PCR扩增。[结果]有10对引物能扩出清晰稳定的条带,共扩增出2952条DNA片段,平均每个个体扩增出82个条带,其中47条具多态性,多态性位点比为57.32%,36个个体间遗传距离为0.035 9~0.335 9,平均遗传距离为0.135 92。Nei s基因多样性指数H=0.181 9,Shannon s多样性指数I=0.263 0,表明圆鼻巨蜥具有较高的遗传多样性。[结论]采用UPGMA法构建了36个个体相互关系的分子聚类图,发现没有形成明显的种群分化。
关键词
圆鼻巨蜥
遗传多样性
RAPD
Keywords
Varanus salvator
Genetic diversity
RAPD
UPGMA analysis
分类号
Q95 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
线粒体ND5·Cytb部分序列在虎物种鉴定中的应用
王利利
彭建军
于冬梅
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响
王利利
彭建军
于冬梅
胡诗佳
高赛飞
傅美兰
刘曦庆
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
2
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
圆鼻巨蜥遗传多样性的RAPD分析
傅美兰
于冬梅
王莹
彭建军
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
1
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职称材料
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