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家蚕翅原基表皮蛋白基因BmWCPs的生物信息学分析与激素诱导表达特征
被引量:
1
1
作者
朱子丹
章佳玲
+1 位作者
冯启理
邓惠敏
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期805-813,共9页
翅原基表皮蛋白(WCPs)在昆虫翅的发育中起着非常重要的作用。为了研究家蚕翅原基表皮蛋白基因BmW CPs的表达是否与蜕皮激素(20E)的调节有关,用生物信息学方法分析BmW CPs基因的序列结构与系统进化特点,并通过半定量RT-PCR检测蜕皮...
翅原基表皮蛋白(WCPs)在昆虫翅的发育中起着非常重要的作用。为了研究家蚕翅原基表皮蛋白基因BmW CPs的表达是否与蜕皮激素(20E)的调节有关,用生物信息学方法分析BmW CPs基因的序列结构与系统进化特点,并通过半定量RT-PCR检测蜕皮激素对部分BmW CPs基因表达的诱导作用。11个BmW CPs基因成簇分布在家蚕基因组中,除BmW CP6和BmW CP10分别分布在第7号、第21号染色体外,其余的BmW CPs均分布在第22号染色体上;11个BmW CPs的核苷酸序列长度为588~2 670 bp,编码115~312个氨基酸,蛋白质分子质量12~35 kD,等电点4.30~7.45;11个BmW CPs基因的ORF内均有内含子插入,81.82%的基因含有2~3个内含子,内含子长度50~5 958 bp,在50~300 bp之间分布频率最高,占46%。将解剖获取的上蔟1 d蚕体的翅原基进行体外培养,并用浓度为2μmol/L的20E直接处理12 h后再常规培养18 h,提取翅原基总RNA并反转录合成cD NA,经半定量RT-PCR检测样品中BmW CPs的表达水平显著上调。依据上述研究结果初步认为,用蜕皮激素直接处理12 h后再常规培养18 h的脉冲作用,可诱导基因组中成簇分布的BmW CPs在翅原基组织中大量表达,以利于家蚕完成翅原基的变态发育。
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关键词
家蚕
翅原基表皮蛋白基因
序列特征
诱导表达
蜕皮激素
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题名
家蚕翅原基表皮蛋白基因BmWCPs的生物信息学分析与激素诱导表达特征
被引量:
1
1
作者
朱子丹
章佳玲
冯启理
邓惠敏
机构
华南师范大学生命科学学院、广州市昆虫发育调控与应用研究重点实验室
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期805-813,共9页
基金
国家自然科学基金重点项目(No.31330071),国家自然科学基金青年基金项目(No.31301918)
国家重点基础研究发展计划“973”项目(No.2012CB114602)
文摘
翅原基表皮蛋白(WCPs)在昆虫翅的发育中起着非常重要的作用。为了研究家蚕翅原基表皮蛋白基因BmW CPs的表达是否与蜕皮激素(20E)的调节有关,用生物信息学方法分析BmW CPs基因的序列结构与系统进化特点,并通过半定量RT-PCR检测蜕皮激素对部分BmW CPs基因表达的诱导作用。11个BmW CPs基因成簇分布在家蚕基因组中,除BmW CP6和BmW CP10分别分布在第7号、第21号染色体外,其余的BmW CPs均分布在第22号染色体上;11个BmW CPs的核苷酸序列长度为588~2 670 bp,编码115~312个氨基酸,蛋白质分子质量12~35 kD,等电点4.30~7.45;11个BmW CPs基因的ORF内均有内含子插入,81.82%的基因含有2~3个内含子,内含子长度50~5 958 bp,在50~300 bp之间分布频率最高,占46%。将解剖获取的上蔟1 d蚕体的翅原基进行体外培养,并用浓度为2μmol/L的20E直接处理12 h后再常规培养18 h,提取翅原基总RNA并反转录合成cD NA,经半定量RT-PCR检测样品中BmW CPs的表达水平显著上调。依据上述研究结果初步认为,用蜕皮激素直接处理12 h后再常规培养18 h的脉冲作用,可诱导基因组中成簇分布的BmW CPs在翅原基组织中大量表达,以利于家蚕完成翅原基的变态发育。
关键词
家蚕
翅原基表皮蛋白基因
序列特征
诱导表达
蜕皮激素
Keywords
Bombyx mori
Wing cuticle protein gene
Sequence feature
Induced expression
Ecdysone
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
家蚕翅原基表皮蛋白基因BmWCPs的生物信息学分析与激素诱导表达特征
朱子丹
章佳玲
冯启理
邓惠敏
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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