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GenBank中CDS..join特征域研究初步
被引量:
2
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作者
金鹰
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2008年第2期95-99,共5页
由NCBI建立和维护的大型公用数据库GenBank是进行生物学研究最为重要的工具之一.其DNA序列数据库的每条记录描述了相关基因的详细特征,其中的CDS(Coding Sequence)特征域被认为是DNA生成蛋白质的翻译指令,它对GenBank中每条基因的组装...
由NCBI建立和维护的大型公用数据库GenBank是进行生物学研究最为重要的工具之一.其DNA序列数据库的每条记录描述了相关基因的详细特征,其中的CDS(Coding Sequence)特征域被认为是DNA生成蛋白质的翻译指令,它对GenBank中每条基因的组装进行了详细的说明.通过CDS可以很容易在互联网上进行多序列搜索,并获得相关的基因序列、编码蛋白序列及种属特异性信息.利用CDS特征域构建外显子-内含子数据库(Exon-Intron Database,EID)是研究内含子起源、进化和功能的重要手段,本文试图以CDS为线索,解决建库初期从GenBank海量数据中提取相关序列的问题.
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关键词
GENBANK
编码序列
外显子
内含子
EID
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职称材料
光学相干成像结合反射光谱技术对小鼠烫伤模型的评估
被引量:
2
2
作者
张浩
孟耀勇
+2 位作者
张小燕
肖军
刘颂豪
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期960-965,共6页
光学相干层析成像(OCT)和反射光谱技术用于精确地评估小鼠烫伤模型。在相同作用时间不同温度下,皮肤厚度呈线性增加;皮下肌肉组织拟合吸收系数和斜率呈V字型变化,在80℃时,处在最低处;在65~85℃时,光谱一次微商的波峰与波谷明显分离,8...
光学相干层析成像(OCT)和反射光谱技术用于精确地评估小鼠烫伤模型。在相同作用时间不同温度下,皮肤厚度呈线性增加;皮下肌肉组织拟合吸收系数和斜率呈V字型变化,在80℃时,处在最低处;在65~85℃时,光谱一次微商的波峰与波谷明显分离,85℃之后这种能力逐渐减弱;色坐标值中,红色数值在60~70℃和90~95℃两个温度之间急剧减小,代表绿色数值一直缓慢减小,而蓝色数值增加。相同温度不同热作用时间下,皮肤的厚度略微减小;拟合吸收系数在热作用少于20 s时间内数值较大,在30 s后数值较小;构造的斜率变化很小;色坐标值在作用时间超过20 s时,变得相对稳定。以上参数主要发生在作用时间为10 s,超过这个时间,变化相对很小。这些变化能够反映出皮肤和皮下组织在热作用下,充血带、水肿瘀滞带和凝固带的形成和转化。这两种技术结合能够为临床提供一种实时的、低消费的、非侵入的在体的烫伤检测的新的光学活检手段。
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关键词
光学相干层析成像
可见近红外反射光谱技术
皮肤烫伤
小鼠模型
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职称材料
题名
GenBank中CDS..join特征域研究初步
被引量:
2
1
作者
金鹰
机构
华南师范大学光子中医实验室
出处
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2008年第2期95-99,共5页
文摘
由NCBI建立和维护的大型公用数据库GenBank是进行生物学研究最为重要的工具之一.其DNA序列数据库的每条记录描述了相关基因的详细特征,其中的CDS(Coding Sequence)特征域被认为是DNA生成蛋白质的翻译指令,它对GenBank中每条基因的组装进行了详细的说明.通过CDS可以很容易在互联网上进行多序列搜索,并获得相关的基因序列、编码蛋白序列及种属特异性信息.利用CDS特征域构建外显子-内含子数据库(Exon-Intron Database,EID)是研究内含子起源、进化和功能的重要手段,本文试图以CDS为线索,解决建库初期从GenBank海量数据中提取相关序列的问题.
关键词
GENBANK
编码序列
外显子
内含子
EID
Keywords
GenBank
coding sequence
Exon
Intron
Exon-Intron-Database
分类号
Q34 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
光学相干成像结合反射光谱技术对小鼠烫伤模型的评估
被引量:
2
2
作者
张浩
孟耀勇
张小燕
肖军
刘颂豪
机构
华南师范大学光子中医实验室
中山
大学
物理科学与技术学院
出处
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第4期960-965,共6页
基金
国家自然科学基金项目(60411130595)
广东中医药局科研项目(2008233)资助
文摘
光学相干层析成像(OCT)和反射光谱技术用于精确地评估小鼠烫伤模型。在相同作用时间不同温度下,皮肤厚度呈线性增加;皮下肌肉组织拟合吸收系数和斜率呈V字型变化,在80℃时,处在最低处;在65~85℃时,光谱一次微商的波峰与波谷明显分离,85℃之后这种能力逐渐减弱;色坐标值中,红色数值在60~70℃和90~95℃两个温度之间急剧减小,代表绿色数值一直缓慢减小,而蓝色数值增加。相同温度不同热作用时间下,皮肤的厚度略微减小;拟合吸收系数在热作用少于20 s时间内数值较大,在30 s后数值较小;构造的斜率变化很小;色坐标值在作用时间超过20 s时,变得相对稳定。以上参数主要发生在作用时间为10 s,超过这个时间,变化相对很小。这些变化能够反映出皮肤和皮下组织在热作用下,充血带、水肿瘀滞带和凝固带的形成和转化。这两种技术结合能够为临床提供一种实时的、低消费的、非侵入的在体的烫伤检测的新的光学活检手段。
关键词
光学相干层析成像
可见近红外反射光谱技术
皮肤烫伤
小鼠模型
Keywords
OCT
Reflection spectrum
Skin scald
Mice model
分类号
O433.4 [机械工程—光学工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
GenBank中CDS..join特征域研究初步
金鹰
《华南师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2008
2
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职称材料
2
光学相干成像结合反射光谱技术对小鼠烫伤模型的评估
张浩
孟耀勇
张小燕
肖军
刘颂豪
《光谱学与光谱分析》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
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