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基于SRAP分子标记的苦楝种质资源遗传多样性分析
被引量：
21
1
作者
廖柏勇
王芳
+6 位作者
陈丽君
刘明骞
欧阳昆唏
阙青敏
惠文凯
李培
陈晓阳
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期48-58,共11页
【目的】利用相关序列扩增多态性（SRAP）分子标记对来自17个省（区）的31个苦楝种源进行遗传多样性分析,为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过SRAP分子标记获得1/0数据矩阵,计算SRAP分子标记各项遗传参数,同时...
【目的】利用相关序列扩增多态性（SRAP）分子标记对来自17个省（区）的31个苦楝种源进行遗传多样性分析,为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过SRAP分子标记获得1/0数据矩阵,计算SRAP分子标记各项遗传参数,同时进行分子方差分析（AMOVA）。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析（PCo A）、邻接法聚类分析（Neighbour-Joining）以及遗传距离和地理距离Mantel相关性分析。【结果】从783对SRAP引物中筛选出的20对引物可扩增出257条清晰的条带,其中145条具有多态性。引物多态性信息指数（PIC）为0.262~0.478,均值为0.385。PIC值较高的10对引物,可扩增出56条特异多态带,可以作为快速鉴别苦楝种源的工具。AMOVA结果显示,38.96%的遗传变异来源于种源间,61.04%的遗传变异来源于种源内。山区的贵州册亨和黎平,云南勐腊和麻栗坡,湖南东安、炎陵和浏阳,四川达州,河北保定,安徽滁州种源的遗传多样性高于其他种源。邻接聚类法根据Nei’s遗传距离将31个种源分为东西2类,西部云南、四川、贵州和甘肃的8个种源构成类群Ⅰ,其他地区的23个种源构成东部类群Ⅱ。类群Ⅱ中北方的济南、保定、泰安、渭南和许昌5个种源聚为一小类,华南地区的屯昌、五指山、钦州和仁化种源聚为一小类,其他相邻和相近的种源大多聚在一起。PCo A分析的种源间双标图结果与邻接法聚类结果基本一致。种源内双标图显示相同种源内的单株大都聚在一起,且种源间和种源内双标图总体分布大体一致。Mantel检验结果表明,种源间遗传距离和地理距离相关性显著（r=0.256,P=0.003）。【结论】SRAP分子标记可以准确、有效地用于苦楝遗传多样性分析。苦楝遗传变异主要来源于种源内,而种源间基因交流有限。种源遗传多样性整体偏低,而部分山区种源遗传多样性较高。在选择高遗传多样性种源的基础上,苦楝选育应侧重种源内家系和单株选择。苦楝种源特征明显,地理环境差异对其遗传多样性具有一定的影响。31个种源大致可分为东西2类,东部种源从北到南有多个聚类中心,其种质资源应采用多点就地保存方式。我国苦楝遗传多样性起源中心或许存在于2类不同种源的生态过渡区。
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关键词
苦楝
SRAP
遗传多样性
亲缘关系
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职称材料
苦楝优良家系的初选
被引量：
2
2
作者
张娇娇
何霞
+4 位作者
王成
王鑫
廖嘉明
闫东方
陈晓阳
《广西林业科学》
2019年第1期84-90,共7页
为了在华南地区选择优良的种源和家系,了解苦楝(Melia azedarach)的地理变异及其趋势,研究对6个省(区) 24个种源的225个苦楝家系进行统计分析。结果表明:部分苦楝家系在雷州试验点生长表现良好,各性状在家系间及各效应项均存在极显著或...
为了在华南地区选择优良的种源和家系,了解苦楝(Melia azedarach)的地理变异及其趋势,研究对6个省(区) 24个种源的225个苦楝家系进行统计分析。结果表明:部分苦楝家系在雷州试验点生长表现良好,各性状在家系间及各效应项均存在极显著或显著差异。与冠幅和树高相比,胸径、干形和枝下高受较强的遗传控制。根据多性状综合指数结果,初步筛选出23个优良家系,适宜在广东地区推广种植,在此基础上,以平均树高、平均胸径、遗传增益均大于前10%家系均值作为选择标准,进一步选出5个整体生长表现优于其他入选的优良家系。此外,214、227号等10个家系的整体生长水平较好,个别性状表现优良,可作为有潜力的候选种源。
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关键词
苦楝
家系
性状
差异
初选
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职称材料
题名
基于SRAP分子标记的苦楝种质资源遗传多样性分析
被引量：
21
1
作者
廖柏勇
王芳
陈丽君
刘明骞
欧阳昆唏
阙青敏
惠文凯
李培
陈晓阳
机构
华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
北京林
业大
学
生物
科学与技术
学院
出处
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016年第4期48-58,共11页
基金
广东省林业科技创新项目(2011KJCX002)
文摘
【目的】利用相关序列扩增多态性（SRAP）分子标记对来自17个省（区）的31个苦楝种源进行遗传多样性分析,为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过SRAP分子标记获得1/0数据矩阵,计算SRAP分子标记各项遗传参数,同时进行分子方差分析（AMOVA）。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析（PCo A）、邻接法聚类分析（Neighbour-Joining）以及遗传距离和地理距离Mantel相关性分析。【结果】从783对SRAP引物中筛选出的20对引物可扩增出257条清晰的条带,其中145条具有多态性。引物多态性信息指数（PIC）为0.262~0.478,均值为0.385。PIC值较高的10对引物,可扩增出56条特异多态带,可以作为快速鉴别苦楝种源的工具。AMOVA结果显示,38.96%的遗传变异来源于种源间,61.04%的遗传变异来源于种源内。山区的贵州册亨和黎平,云南勐腊和麻栗坡,湖南东安、炎陵和浏阳,四川达州,河北保定,安徽滁州种源的遗传多样性高于其他种源。邻接聚类法根据Nei’s遗传距离将31个种源分为东西2类,西部云南、四川、贵州和甘肃的8个种源构成类群Ⅰ,其他地区的23个种源构成东部类群Ⅱ。类群Ⅱ中北方的济南、保定、泰安、渭南和许昌5个种源聚为一小类,华南地区的屯昌、五指山、钦州和仁化种源聚为一小类,其他相邻和相近的种源大多聚在一起。PCo A分析的种源间双标图结果与邻接法聚类结果基本一致。种源内双标图显示相同种源内的单株大都聚在一起,且种源间和种源内双标图总体分布大体一致。Mantel检验结果表明,种源间遗传距离和地理距离相关性显著（r=0.256,P=0.003）。【结论】SRAP分子标记可以准确、有效地用于苦楝遗传多样性分析。苦楝遗传变异主要来源于种源内,而种源间基因交流有限。种源遗传多样性整体偏低,而部分山区种源遗传多样性较高。在选择高遗传多样性种源的基础上,苦楝选育应侧重种源内家系和单株选择。苦楝种源特征明显,地理环境差异对其遗传多样性具有一定的影响。31个种源大致可分为东西2类,东部种源从北到南有多个聚类中心,其种质资源应采用多点就地保存方式。我国苦楝遗传多样性起源中心或许存在于2类不同种源的生态过渡区。
关键词
苦楝
SRAP
遗传多样性
亲缘关系
Keywords
Melia azedarach
SRAP
genetic diversity
genetic relationship
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
S718.54 [农业科学—林学]
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职称材料
题名
苦楝优良家系的初选
被引量：
2
2
作者
张娇娇
何霞
王成
王鑫
廖嘉明
闫东方
陈晓阳
机构
华南农业大学林学与风景园林学院广东省森林植物种质创新与利用重点实验室亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
出处
《广西林业科学》
2019年第1期84-90,共7页
基金
广东省林业科技创新项目(2011KJCX002)
文摘
为了在华南地区选择优良的种源和家系,了解苦楝(Melia azedarach)的地理变异及其趋势,研究对6个省(区) 24个种源的225个苦楝家系进行统计分析。结果表明:部分苦楝家系在雷州试验点生长表现良好,各性状在家系间及各效应项均存在极显著或显著差异。与冠幅和树高相比,胸径、干形和枝下高受较强的遗传控制。根据多性状综合指数结果,初步筛选出23个优良家系,适宜在广东地区推广种植,在此基础上,以平均树高、平均胸径、遗传增益均大于前10%家系均值作为选择标准,进一步选出5个整体生长表现优于其他入选的优良家系。此外,214、227号等10个家系的整体生长水平较好,个别性状表现优良,可作为有潜力的候选种源。
关键词
苦楝
家系
性状
差异
初选
Keywords
Melia azedarach
family
traits
variation
preliminary selection
分类号
S792.3 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SRAP分子标记的苦楝种质资源遗传多样性分析
廖柏勇
王芳
陈丽君
刘明骞
欧阳昆唏
阙青敏
惠文凯
李培
陈晓阳
《林业科学》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2016
21
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
苦楝优良家系的初选
张娇娇
何霞
王成
王鑫
廖嘉明
闫东方
陈晓阳
《广西林业科学》
2019
2
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职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
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