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题名一株广东鸽新城疫病毒的生物学特性分析
被引量：5
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作者
何琴
焦培荣
刘大伟
韦娜娜
龚军
廖明
任涛
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机构
华南农业大学兽医学院农业部动物疫病防控重点开放实验室及广东省动物源性人畜共患病预防与控制重点实验室
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出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2011年第9期23-26,共4页
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基金
公益性行业专项项目(200803020-08)
国家自然科学基金项目(31072319)
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文摘
为了解广东地区鸽新城疫病毒的生物学特性,对广东分离株SD54进行了鸡胚平均死亡时间(MDT)、6周龄鸡静脉接种的致病指数(IVPI)、1日龄雏鸡脑内接种的致病指数(ICPI)的测定,并对该毒株F基因的重要功能区片段进行RT-PCR扩增、测序,利用MEGA 4软件绘制系统进化树。经测定,分离株SD54的MDT为60 hI、VPI为2.49I、CPI为1.6;其F基因裂解位点的氨基酸序列为112RRQKRF117,符合NDV强毒株F基因裂解位点氨基酸序列的特征;系统进化树表明该毒株属于基因Ⅶ,与广西鸽源株Gxp40处于同一细分支,同源性最近,表明该分离株SD54为基因Ⅶ强毒株。
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关键词
鸽
新城疫病毒
基因Ⅶ型
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Keywords
pigeon
Newcastle disease virus
genotype Ⅶ
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分类号
S852.659.5
[农业科学—基础兽医学]
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题名H6亚型禽流感病毒血凝素蛋白线性表位的预测与鉴定
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作者
王建华
汪招雄
郭露铰
龚军
何艳兵
任涛
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机构
华南农业大学兽医学院农业部动物疫病防控重点开放实验室及广东省动物源性人畜共患病预防与控制重点实验室
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出处
《动物医学进展》
CSCD
北大核心
2012年第7期12-18,共7页
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基金
公益性行业(农业)科研专项(200803020-08)
国家自然科学基金项目(31072319)
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文摘
应用生物信息学方法预测H6亚型禽流感病毒血凝素蛋白(HA)线性抗原表位,并对所获表位的免疫原性进行初步鉴定,为流感病毒表位疫苗研制和H6亚型特异性ELISA检测方法奠定基础。依据近年流感病毒流行趋势,从GenBank下载具有代表性的H6、H5、H7和H9亚型禽流感病毒血凝素蛋白的氨基酸序列。利用DNA Star软件进行H6同亚型间氨基酸序列保守性分析,再将H6与H5、H7、H9不同亚型之间氨基酸同源性进行比较,然后借助在线服务器ExPASy和IEDB对序列进行抗原性、亲水性、柔韧性、二级结构和表面可及性预测。最后去除H6与H5、H7、H9亚型氨基酸同源区域,选择H6亚型氨基酸相对保守区域并且抗原表位综合预测结果较优的几个片段,所选择表位长度为15个氨基酸。合成所获得的优势线性表位,并用间接ELISA方法对所获表位的免疫原性进行鉴定。预测后获得4个线性抗原表位,经鉴定免疫原性最好的为表位A,最差的为表位B。
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关键词
禽流感病毒
H6亚型
血凝素蛋白
线性抗原表位
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Keywords
Avian influenza virus
subtype H6
hemagglutinin proteim linear epitope
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分类号
S852.659.5
[农业科学—基础兽医学]
Q789
[生物学—分子生物学]
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