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题名猪A群轮状病毒荧光定量PCR检测方法的建立及应用
被引量：6
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作者
陈小飞
严楠
张斌
廖明
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机构
华南农业大学兽医学院/人兽共患病防控制剂国家地方联合工程实验室/广东省动物原性人兽共患病防控重点实验室/农业农村部人兽共患病重点实验室
西南民族大学生命科学与技术学院
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出处
《动物医学进展》
北大核心
2021年第2期41-45,共5页
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文摘
根据近5年来GenBank发布的猪A群轮状病毒(RVA)VP6基因序列,针对保守区域设计1对特异性引物,优化反应体系及条件,建立了TB Green实时荧光定量PCR方法。该方法在模板浓度为1.06×10^8 copies/μL~1.06×10^2 copies/μL范围内线性关系良好,相关系数R^2=0.9975,最低检出浓度为106 copies/μL;批内及批间变异系数小于2%。利用该方法对猪RVA亚型G3、G4、G5、G9和G26检测均为阳性,而对猪常见病原(猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪流行性腹泻病毒、猪呼肠孤病毒MRV、猪捷申病毒、巴氏杆菌、链球菌以及猪等孢球虫)检测均为阴性。对91份临床腹泻样品进行检测,研究建立的猪RVA TB Green实时荧光定量PCR检出率(43.96%,40/91)高于已报道的猪RVA SYBR Green荧光定量PCR(42.86%,39/91)和国家标准RVA的普通RT-PCR(12.09%,11/91),且符合率为100%。建立的RVA荧光定量PCR检测方法为流行病学调查和早期诊断提供了技术支撑。
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关键词
猪轮状病毒
荧光定量PCR
VP6基因
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Keywords
Rotavirus
fluorescence quantitative PCR
VP6 gene
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分类号
S852.659.4
[农业科学—基础兽医学]
S858.28
[农业科学—临床兽医学]
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