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CSPG4P12基因在小细胞肺癌组织中的表达及其对细胞生物学行为的影响
1
作者
白聪聪
周先雷
+2 位作者
张志
高爽
张雪梅
《吉林大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第2期392-402,共11页
目的:探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4假基因12(CSPG4P12)在小细胞肺癌(SCLC)组织中的表达、与免疫浸润的关系及其对细胞生物学功能的影响,阐明其在SCLC发生发展中的作用。方法:通过ArrayExpress数据库检索获得的SCLC的E-GEOD-60052队列数据,利...
目的:探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4假基因12(CSPG4P12)在小细胞肺癌(SCLC)组织中的表达、与免疫浸润的关系及其对细胞生物学功能的影响,阐明其在SCLC发生发展中的作用。方法:通过ArrayExpress数据库检索获得的SCLC的E-GEOD-60052队列数据,利用R语言Bioconductor包完成数据过滤标准化,并获得63例SCLC肿瘤组织和7例正常组织样本,使用Mann-Whitney U检验分析2组样本中CSPG4P12表达水平差异情况,使用Pearson相关性分析评估CSPG4P12表达水平与47种免疫检查点基因之间的关联。使用ESTIMATE算法和CIBERSORT算法评估CSPG4P12表达与肿瘤免疫细胞浸润之间的关联。采用病例对照研究分析临床资料,选取230例SCLC患者为病例组,230名健康体检者为对照组。采用TaqMan-MGB荧光探针标记法进行CSPG4P12 rs2880765、rs6496932和rs8040855位点基因分型实验,通过非条件Logistic回归模型计算比值比(OR)和95%置信区间(CI),分析CSPG4P12基因多态遗传变异与SCLC发病风险的关联。SCLC DMS114细胞分别转染pUC-57质粒(对照组)和CSPG4P12过表达质粒(OV-CPG4P12组),采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法验证2组细胞中CSPG4P12过表达效率。采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法检测2组细胞增殖活性,Transwell小室实验检测2组迁移细胞数和侵袭细胞数,Hoechst 33342荧光染色法观察2组细胞凋亡情况。结果:ArrayExpress数据库E-GEOD-60052队列分析,与正常组织比较,SCLC肿瘤组织中CSPG4P12 mRNA表达水平明显降低(P<0.001)。CSPG4P12表达与免疫检查点基因白细胞相关免疫球蛋白样受体1(LAIR1)(r=0.47,P<0.001)、肿瘤坏死因子(TNF)受体超家族成员9(TNFRSF9)(r=0.38,P<0.01)和TNF超家族成员9(TNFSF9)(r=0.44,P<0.001)均呈正相关关系。ESTIMATE算法,CSPG4P12低表达组患者基质评分、免疫评分和ESTIMATE综合评分均低于CSPG4P12高表达组(P<0.01)。CIBERSORT算法,与CSPG4P12高表达组比较,CSPG4P12低表达组中M0型巨噬细胞浸润增加(P<0.05),静息肥大细胞浸润降低(P<0.05)。CSPG4P12表达水平与静息肥大细胞浸润(r=0.35,P=0.030)和单核细胞浸润(r=0.34,P=0.034)呈正相关关系。病例对照研究,与AA基因型比较,CSPG4P12 rs2880765位点AT和TT基因型携带者患SCLC风险增加(OR=1.68,95%CI=1.15~2.45,P<0.01)。分层分析,在男性、低年龄(≤60岁)及吸烟亚组人群中,rs2880765 A>T遗传变异可增加SCLC发病风险(男性:OR=1.86,95%CI=1.18~2.93,P<0.01;≤60岁:OR=1.73,95%CI=1.11~2.68,P<0.01;吸烟:OR=2.76,95%CI=1.49~5.13,P=0.001)。细胞生物学实验,与对照组比较,在48和72 h时,OV-CSPG4P12组细胞增殖活性明显降低(P<0.01);24 h时迁移细胞数明显减少(P<0.01),凋亡细胞数明显增加(P<0.05),48 h时侵袭细胞数明显减少(P<0.01)。结论:CSPG4P12在SCLC肿瘤组织中低表达,与免疫浸润有关联。CSPG4P12 rs2880765 A>T遗传变异可以增加SCLC发病风险,其过表达能抑制细胞增殖、迁移和侵袭,促进细胞凋亡。
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关键词
硫酸软骨素蛋白多糖4假基因12
免疫浸润
遗传变异
细胞生物学功能
小细胞肺癌
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职称材料
题名
CSPG4P12基因在小细胞肺癌组织中的表达及其对细胞生物学行为的影响
1
作者
白聪聪
周先雷
张志
高爽
张雪梅
机构
华北
理
工
大学
生命
科
学学院细胞与分子
科
华北
理
工
大学
公共卫生学院流行病预防
科
华北理工大学附属唐山工人医院肿瘤内二科
出处
《吉林大学学报(医学版)》
北大核心
2025年第2期392-402,共11页
基金
河北省科技厅自然科学基金重点项目(H2017209233)
河北省教育厅高等学校科学技术研究项目(基础研究)(QN2021119)。
文摘
目的:探讨硫酸软骨素蛋白聚糖4假基因12(CSPG4P12)在小细胞肺癌(SCLC)组织中的表达、与免疫浸润的关系及其对细胞生物学功能的影响,阐明其在SCLC发生发展中的作用。方法:通过ArrayExpress数据库检索获得的SCLC的E-GEOD-60052队列数据,利用R语言Bioconductor包完成数据过滤标准化,并获得63例SCLC肿瘤组织和7例正常组织样本,使用Mann-Whitney U检验分析2组样本中CSPG4P12表达水平差异情况,使用Pearson相关性分析评估CSPG4P12表达水平与47种免疫检查点基因之间的关联。使用ESTIMATE算法和CIBERSORT算法评估CSPG4P12表达与肿瘤免疫细胞浸润之间的关联。采用病例对照研究分析临床资料,选取230例SCLC患者为病例组,230名健康体检者为对照组。采用TaqMan-MGB荧光探针标记法进行CSPG4P12 rs2880765、rs6496932和rs8040855位点基因分型实验,通过非条件Logistic回归模型计算比值比(OR)和95%置信区间(CI),分析CSPG4P12基因多态遗传变异与SCLC发病风险的关联。SCLC DMS114细胞分别转染pUC-57质粒(对照组)和CSPG4P12过表达质粒(OV-CPG4P12组),采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法验证2组细胞中CSPG4P12过表达效率。采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法检测2组细胞增殖活性,Transwell小室实验检测2组迁移细胞数和侵袭细胞数,Hoechst 33342荧光染色法观察2组细胞凋亡情况。结果:ArrayExpress数据库E-GEOD-60052队列分析,与正常组织比较,SCLC肿瘤组织中CSPG4P12 mRNA表达水平明显降低(P<0.001)。CSPG4P12表达与免疫检查点基因白细胞相关免疫球蛋白样受体1(LAIR1)(r=0.47,P<0.001)、肿瘤坏死因子(TNF)受体超家族成员9(TNFRSF9)(r=0.38,P<0.01)和TNF超家族成员9(TNFSF9)(r=0.44,P<0.001)均呈正相关关系。ESTIMATE算法,CSPG4P12低表达组患者基质评分、免疫评分和ESTIMATE综合评分均低于CSPG4P12高表达组(P<0.01)。CIBERSORT算法,与CSPG4P12高表达组比较,CSPG4P12低表达组中M0型巨噬细胞浸润增加(P<0.05),静息肥大细胞浸润降低(P<0.05)。CSPG4P12表达水平与静息肥大细胞浸润(r=0.35,P=0.030)和单核细胞浸润(r=0.34,P=0.034)呈正相关关系。病例对照研究,与AA基因型比较,CSPG4P12 rs2880765位点AT和TT基因型携带者患SCLC风险增加(OR=1.68,95%CI=1.15~2.45,P<0.01)。分层分析,在男性、低年龄(≤60岁)及吸烟亚组人群中,rs2880765 A>T遗传变异可增加SCLC发病风险(男性:OR=1.86,95%CI=1.18~2.93,P<0.01;≤60岁:OR=1.73,95%CI=1.11~2.68,P<0.01;吸烟:OR=2.76,95%CI=1.49~5.13,P=0.001)。细胞生物学实验,与对照组比较,在48和72 h时,OV-CSPG4P12组细胞增殖活性明显降低(P<0.01);24 h时迁移细胞数明显减少(P<0.01),凋亡细胞数明显增加(P<0.05),48 h时侵袭细胞数明显减少(P<0.01)。结论:CSPG4P12在SCLC肿瘤组织中低表达,与免疫浸润有关联。CSPG4P12 rs2880765 A>T遗传变异可以增加SCLC发病风险,其过表达能抑制细胞增殖、迁移和侵袭,促进细胞凋亡。
关键词
硫酸软骨素蛋白多糖4假基因12
免疫浸润
遗传变异
细胞生物学功能
小细胞肺癌
Keywords
Chondroitin sulfate proteoglycan 4 pseudogene 12
Immune infiltration
Genetic variation
Cell biological function
Small cell lung cancer
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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作者
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被引量
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1
CSPG4P12基因在小细胞肺癌组织中的表达及其对细胞生物学行为的影响
白聪聪
周先雷
张志
高爽
张雪梅
《吉林大学学报(医学版)》
北大核心
2025
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