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题名基于图的匹配方法预测蛋白质结构中的二硫键
被引量：3
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作者
史晓红
王燕
张凯
罗亮
许进
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机构
华中科技大学自动控制科学与系统工程系
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2007年第13期30-32,75,共4页
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基金
国家自然科学基金(the National Natural Science Foundation of China under Grant No.60274026
No.60403002
+1 种基金
No.60373089
No.30370356)。
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文摘
在蛋白质结构预测的研究中,一个重要的问题就是正确预测二硫键的连接,二硫键的准确预测可以减少蛋白质构像的搜索空间,有利于蛋白质的3D结构的预测。论文将一个蛋白质结构中二硫键的预测问题,等价为一个寻找图的最大权的匹配问题。图的顶点表示序列中的半胱氨酸残基,边连接每一顶点,表示一种可能的连接方式,边的权根据一个权值函数赋值,用EJ算法寻找具有最大权的匹配,则这个匹配对应二硫键的正确连接。应用这个方法对蛋白质结构的二硫键进行了预测并取得了良好的结果。
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关键词
蛋白质结构预测
二硫键
图
匹配
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Keywords
prediction of protein structure
disulfide bonding
graph
matching
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分类号
TQ93
[化学工程]
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