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“虚拟中国人男性一号”高精度骨骼系统的三维建模
被引量:
39
1
作者
李安安
刘谦
+3 位作者
龚辉
唐雷
钟世镇
骆清铭
《中国临床解剖学杂志》
CSCD
北大核心
2006年第3期292-294,307,共4页
目的:建立人体整体骨骼系统的高精度三维模型,为解剖教学、生理模拟等应用提供三维数据集。方法:采用虚拟中国人男性一号(VirtualChineseHumanMaleNo.1)的2000万像素的高分辨率切片数据,使用半自动交互方法对全身骨组织进行分割和标识,...
目的:建立人体整体骨骼系统的高精度三维模型,为解剖教学、生理模拟等应用提供三维数据集。方法:采用虚拟中国人男性一号(VirtualChineseHumanMaleNo.1)的2000万像素的高分辨率切片数据,使用半自动交互方法对全身骨组织进行分割和标识,使用并行三维重建算法对海量的全身骨骼数据进行快速的三维建模。结果:建立了高质量的全身骨骼三维模型;通过初步的细分,实现了单块骨骼的单独与任意组合显示。结论:在高分辨率的切片数据基础上,通过精细分割,建立了高精度的骨骼系统三维模型。
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关键词
虚拟中国人
骨骼
三维建模
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职称材料
构建高分辨率中国数字人男性数据集
被引量:
15
2
作者
唐雷
李泽宇
+7 位作者
刘畅
吴坤成
夏寅
刘谦
谢叻
王兴海
洪辉文
钟世镇
《医用生物力学》
EI
CAS
CSCD
2006年第3期179-182,共4页
目的构建高分辨率中国男性数字人0.2mm断层间距图像数据集。方法取捐献健康男性遗体,经颈动脉红色灌注、低温冷冻定型、专用包埋模具垂直包埋、一次装夹连续等间距铣削、PhaseOneH25数码相机采集连续断层数据以构建数据集。结果共获得9...
目的构建高分辨率中国男性数字人0.2mm断层间距图像数据集。方法取捐献健康男性遗体,经颈动脉红色灌注、低温冷冻定型、专用包埋模具垂直包埋、一次装夹连续等间距铣削、PhaseOneH25数码相机采集连续断层数据以构建数据集。结果共获得9320个RAW格式断层图像数据,分辨率为4080×5440象素,RAW格式单层数据量为27.5M,RAW格式总数据量为260G。结论高分辨率中国数字人男性数据集由于采用了2200万象素的高分辩率数码相机,断层上如血管、脂肪、软骨和骨骼等组织的边界清晰。并可用随机软件对图像的色彩、曝光量以及断层感兴趣区域进行重新处理。
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关键词
中国数字人
高分辨
男性
断层切削
数据集
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职称材料
基于Web的代谢网络仿真环境
3
作者
张升蓉
罗若愚
+2 位作者
刘谦
李亦学
骆清铭
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2006年第36期97-99,共3页
针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量,构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境,主要采用Applet技术、系统生物学描述语言(SBML)、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这...
针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量,构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境,主要采用Applet技术、系统生物学描述语言(SBML)、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这个仿真环境,结合已有的代谢网络仿真技术,提供了一个远程在线的代谢网络的仿真服务。该仿真环境不仅便于升级和维护,而且具有平台无关性、强大的计算性能和对重负荷的支持能力。
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关键词
多层体系结构
APPLET
SERVLET
SBML
线程池
负载平衡机制
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职称材料
基于集群的代谢网络计算平台研究
4
作者
贾璐
罗若愚
+2 位作者
刘谦
李亦学
骆清铭
《计算机应用与软件》
CSCD
北大核心
2008年第2期45-46,51,共3页
在生物代谢网络研究中,为提供面向多用户的高性能计算服务,开发了基于Linux计算机集群的代谢网络模拟W eb计算平台。该平台以集群为密集计算后台,以重建心肌细胞能量代谢网络为算例,采用集中式任务调度模型、加权结合轮询法的负载平衡...
在生物代谢网络研究中,为提供面向多用户的高性能计算服务,开发了基于Linux计算机集群的代谢网络模拟W eb计算平台。该平台以集群为密集计算后台,以重建心肌细胞能量代谢网络为算例,采用集中式任务调度模型、加权结合轮询法的负载平衡技术以及消息传递接口并行编程模型,实现了对多用户并发任务的处理。通过实例应用和调度监控,验证了该平台在代谢网络模拟中的可用性,以及集群服务器并行处理多任务的有效性。
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关键词
LINUX集群
并行计算
负载平衡
消息传递接口
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职称材料
题名
“虚拟中国人男性一号”高精度骨骼系统的三维建模
被引量:
39
1
作者
李安安
刘谦
龚辉
唐雷
钟世镇
骆清铭
机构
华中科技大学生物医学光子学教育部重点实验室湖北省生物信息与分子成像重点实验室
南方医科
大学
解剖
学
教研室
出处
《中国临床解剖学杂志》
CSCD
北大核心
2006年第3期292-294,307,共4页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划2004AA231030)
文摘
目的:建立人体整体骨骼系统的高精度三维模型,为解剖教学、生理模拟等应用提供三维数据集。方法:采用虚拟中国人男性一号(VirtualChineseHumanMaleNo.1)的2000万像素的高分辨率切片数据,使用半自动交互方法对全身骨组织进行分割和标识,使用并行三维重建算法对海量的全身骨骼数据进行快速的三维建模。结果:建立了高质量的全身骨骼三维模型;通过初步的细分,实现了单块骨骼的单独与任意组合显示。结论:在高分辨率的切片数据基础上,通过精细分割,建立了高精度的骨骼系统三维模型。
关键词
虚拟中国人
骨骼
三维建模
Keywords
Virtual Chinese Human(VCH)
skeleton
three-dimensional visualization
分类号
R322 [医药卫生—人体解剖和组织胚胎学]
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职称材料
题名
构建高分辨率中国数字人男性数据集
被引量:
15
2
作者
唐雷
李泽宇
刘畅
吴坤成
夏寅
刘谦
谢叻
王兴海
洪辉文
钟世镇
机构
南方医科
大学
临床解剖
学
研究所
同仁医院耳鼻喉研究所
华中科技大学
生物医学
光子
学
教育部
重点
实验室
上海交通
大学
国家数字化制造中心
出处
《医用生物力学》
EI
CAS
CSCD
2006年第3期179-182,共4页
基金
国家高技术研究发展(863)计划(2001AA231031
2002AA231021)
+1 种基金
广东省科技重点基金(2002B30611)
北京市自然科学基金重点项目(7031001)
文摘
目的构建高分辨率中国男性数字人0.2mm断层间距图像数据集。方法取捐献健康男性遗体,经颈动脉红色灌注、低温冷冻定型、专用包埋模具垂直包埋、一次装夹连续等间距铣削、PhaseOneH25数码相机采集连续断层数据以构建数据集。结果共获得9320个RAW格式断层图像数据,分辨率为4080×5440象素,RAW格式单层数据量为27.5M,RAW格式总数据量为260G。结论高分辨率中国数字人男性数据集由于采用了2200万象素的高分辩率数码相机,断层上如血管、脂肪、软骨和骨骼等组织的边界清晰。并可用随机软件对图像的色彩、曝光量以及断层感兴趣区域进行重新处理。
关键词
中国数字人
高分辨
男性
断层切削
数据集
Keywords
Chinese digital human
High resolution
Male
Serial section
Dataset
分类号
R318.01 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
基于Web的代谢网络仿真环境
3
作者
张升蓉
罗若愚
刘谦
李亦学
骆清铭
机构
华中科技大学
生物医学
光子
学
教育部
重点
实验室
-
湖北省
生物
信息与
分子
成像
重点
实验室
上海
生物
信息
技术研究中心
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2006年第36期97-99,共3页
基金
国家高技术研究发展计划资助项目(2003AA231011)
教育部科技基础条件平台项目(505010)
文摘
针对实时服务的需求和大规模代谢网络的大计算量,构建了一个基于集群系统的多层体系结构的代谢网络仿真环境,主要采用Applet技术、系统生物学描述语言(SBML)、Servlet与Applet之间的通信技术、线程池技术和负载平衡机制来实现。基于这个仿真环境,结合已有的代谢网络仿真技术,提供了一个远程在线的代谢网络的仿真服务。该仿真环境不仅便于升级和维护,而且具有平台无关性、强大的计算性能和对重负荷的支持能力。
关键词
多层体系结构
APPLET
SERVLET
SBML
线程池
负载平衡机制
Keywords
muti-layers framework
Applet
Servlet
SBML
thread pool
load balancing
分类号
TP393 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
基于集群的代谢网络计算平台研究
4
作者
贾璐
罗若愚
刘谦
李亦学
骆清铭
机构
华中科技大学
生物医学
光子
学
教育部
重点
实验室
湖北省
生物
信息与
分子
成像
重点
实验室
上海
生物
信息
技术研究中心
出处
《计算机应用与软件》
CSCD
北大核心
2008年第2期45-46,51,共3页
基金
国家科技攻关计划(2005BA711A04)
教育部科技基础条件平台项目(505010)。
文摘
在生物代谢网络研究中,为提供面向多用户的高性能计算服务,开发了基于Linux计算机集群的代谢网络模拟W eb计算平台。该平台以集群为密集计算后台,以重建心肌细胞能量代谢网络为算例,采用集中式任务调度模型、加权结合轮询法的负载平衡技术以及消息传递接口并行编程模型,实现了对多用户并发任务的处理。通过实例应用和调度监控,验证了该平台在代谢网络模拟中的可用性,以及集群服务器并行处理多任务的有效性。
关键词
LINUX集群
并行计算
负载平衡
消息传递接口
Keywords
Linux cluster
Parallel computing
Load balancing MPI
分类号
TP312JA [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
TP338.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
“虚拟中国人男性一号”高精度骨骼系统的三维建模
李安安
刘谦
龚辉
唐雷
钟世镇
骆清铭
《中国临床解剖学杂志》
CSCD
北大核心
2006
39
在线阅读
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职称材料
2
构建高分辨率中国数字人男性数据集
唐雷
李泽宇
刘畅
吴坤成
夏寅
刘谦
谢叻
王兴海
洪辉文
钟世镇
《医用生物力学》
EI
CAS
CSCD
2006
15
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
基于Web的代谢网络仿真环境
张升蓉
罗若愚
刘谦
李亦学
骆清铭
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2006
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
4
基于集群的代谢网络计算平台研究
贾璐
罗若愚
刘谦
李亦学
骆清铭
《计算机应用与软件》
CSCD
北大核心
2008
0
在线阅读
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职称材料
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