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ALOX5、ALOX5AP基因多态性与髓系白血病易感性的关系
被引量：
1
1
作者
梅芬
王艳飞
+4 位作者
杨丹
左荣霞
沈涛
杨同华
撒亚莲
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期40-50,共11页
目的:探讨花生四烯5-脂氧合酶基因(arachidonate 5-lipoxygenase gene,ALOX5)rs2029253,rs2228064和rs2228065位点以及5-脂氧合酶激活蛋白基因(5-lipoxygenase activating protein gene,ALOX5AP)rs10507391和rs4769874位点的单核苷酸多...
目的:探讨花生四烯5-脂氧合酶基因(arachidonate 5-lipoxygenase gene,ALOX5)rs2029253,rs2228064和rs2228065位点以及5-脂氧合酶激活蛋白基因(5-lipoxygenase activating protein gene,ALOX5AP)rs10507391和rs4769874位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与髓系白血病发病风险的相关性。方法:经医院伦理委员会批准、患者知情同意,选取150例髓系白血病患者为髓系白血病(ML)组,134例健康人群为对照组。提取基因组DNA,采用聚合酶链反应及限制性片段长度多态技术(PCR-RFLP)联合PCR产物直接测序法检测ALOX5、ALOX5AP基因5个位点的基因型。结果:ALOX5基因rs2029253位点在ML组和对照组中的A等位基因频率分别为43.0%和34.3%,而等位基因G的频率分别为57.0%、65.7%;基因型AA、AG和GG在ML组中的分布频率分别为32.2%,21.5%和46.3%,而在对照组中的分布频率分别为15.7%,37.3%和47.0%。基因型AA和等位基因A可能增加髓系白血病的发病风险(OR=2.26,95%CI:1.43-4.56,P<0.05;OR=1.44,95%CI:1.02-2.03,P<0.05);基因型AG与等位基因G可能降低对髓系白血病的易感性(OR=0.46,95%CI:0.27-0.78,P<0.01;OR=0.69,95%CI:0.50-0.98,P<0.05)。而ALOX5基因rs2228064、rs2228065位点多态性在ML组与对照组间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。ALOX5AP基因rs10507391位点等位基因A在髓系白血病组和对照组中频率分布分别为30.7%和36.2%;基因型AA、AT和TT在ML组中分布频率分别为1.3%,58.7%和40.0%,在对照组中的分布频率分别为9.7%,53.0%和37.3%;基因型AA可能降低髓系白血病的发病风险(OR=0.13,95%CI:0.03-0.57,P<0.05);而ALOX5AP rs4769874位点基因型与等位基因分布频率在ML组与对照组间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论:ALOX5 rs2029253位点基因型AA、AG和等位基因A、G以及ALOX5AP rs4769874位点AA基因型与髓系白血病发病的遗传易感性相关。
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关键词
ALOX5
ALOX5AP
单核苷酸多态性(SNP)
髓系白血病
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职称材料
构建基于CRISPR/Cas9技术敲除ALOX5的质粒
2
作者
梅芬
李瑞玮
+4 位作者
张娟娟
左荣霞
邹云莲
沈涛
撒亚莲
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期110-114,共5页
旨在利用CRISPR/Cas9技术构建敲除花生四烯5-脂氧合酶基因(Arachidonate 5-lipoxygenase gene,ALOX5)的重组质粒。设计合成3对靶向敲除ALOX5第六外显子的sgRNA,将其分别插入到CRISPR/Cas9质粒骨架pX458载体中,转化感受态大肠杆菌DH5α...
旨在利用CRISPR/Cas9技术构建敲除花生四烯5-脂氧合酶基因(Arachidonate 5-lipoxygenase gene,ALOX5)的重组质粒。设计合成3对靶向敲除ALOX5第六外显子的sgRNA,将其分别插入到CRISPR/Cas9质粒骨架pX458载体中,转化感受态大肠杆菌DH5α后挑取克隆,通过测序评估重组质粒是否构建成功。将构建好的重组质粒转染293T细胞,在荧光显微镜下观察转染效果,挑取转染成功的细胞,用试剂盒提取转染细胞基因组DNA,PCR扩增含敲除位点的DNA片段,用测序技术获得核苷酸序列,用DNAStar软件分析转染细胞中ALOX5基因敲除情况。测序结果表明2对双链sgRNA寡核苷酸已插入质粒,且序列正确,靶向ALOX5基因的重组质粒pX458-sgRNAs-ALOX5构建成功。其在293T细胞中的转染效率约为50%,用一代测序法未检测到sgRNAs的切割效果。初步表明利用CRISPR/Cas9技术成功构建靶向ALOX5基因的重组质粒pX458-sgRNAs-ALOX5。
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关键词
ALOX5
CRISPR/Cas9
基因敲除
构建
质粒
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职称材料
题名
ALOX5、ALOX5AP基因多态性与髓系白血病易感性的关系
被引量：
1
1
作者
梅芬
王艳飞
杨丹
左荣霞
沈涛
杨同华
撒亚莲
机构
昆明理工
大学
附属
医院
(云南省第一人民
医院
临床基础
医学
研究所
华中科技大学同济医学院
生殖
医学
中心
(
武汉
同济
生殖
医学
专科医院
)
云南省第一人民
医院
国家临床重点
专科
血液科
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期40-50,共11页
基金
国家自然科学基金资助项目(31460298)
云南省卫生厅内设机构资助项目(2017NS228
+1 种基金
2018NS261)
云南省科技厅—昆明医科大学联合专项应用基础研究项目(2018FE001(-112)).
文摘
目的:探讨花生四烯5-脂氧合酶基因(arachidonate 5-lipoxygenase gene,ALOX5)rs2029253,rs2228064和rs2228065位点以及5-脂氧合酶激活蛋白基因(5-lipoxygenase activating protein gene,ALOX5AP)rs10507391和rs4769874位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与髓系白血病发病风险的相关性。方法:经医院伦理委员会批准、患者知情同意,选取150例髓系白血病患者为髓系白血病(ML)组,134例健康人群为对照组。提取基因组DNA,采用聚合酶链反应及限制性片段长度多态技术(PCR-RFLP)联合PCR产物直接测序法检测ALOX5、ALOX5AP基因5个位点的基因型。结果:ALOX5基因rs2029253位点在ML组和对照组中的A等位基因频率分别为43.0%和34.3%,而等位基因G的频率分别为57.0%、65.7%;基因型AA、AG和GG在ML组中的分布频率分别为32.2%,21.5%和46.3%,而在对照组中的分布频率分别为15.7%,37.3%和47.0%。基因型AA和等位基因A可能增加髓系白血病的发病风险(OR=2.26,95%CI:1.43-4.56,P<0.05;OR=1.44,95%CI:1.02-2.03,P<0.05);基因型AG与等位基因G可能降低对髓系白血病的易感性(OR=0.46,95%CI:0.27-0.78,P<0.01;OR=0.69,95%CI:0.50-0.98,P<0.05)。而ALOX5基因rs2228064、rs2228065位点多态性在ML组与对照组间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。ALOX5AP基因rs10507391位点等位基因A在髓系白血病组和对照组中频率分布分别为30.7%和36.2%;基因型AA、AT和TT在ML组中分布频率分别为1.3%,58.7%和40.0%,在对照组中的分布频率分别为9.7%,53.0%和37.3%;基因型AA可能降低髓系白血病的发病风险(OR=0.13,95%CI:0.03-0.57,P<0.05);而ALOX5AP rs4769874位点基因型与等位基因分布频率在ML组与对照组间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论:ALOX5 rs2029253位点基因型AA、AG和等位基因A、G以及ALOX5AP rs4769874位点AA基因型与髓系白血病发病的遗传易感性相关。
关键词
ALOX5
ALOX5AP
单核苷酸多态性(SNP)
髓系白血病
Keywords
ALOX5
ALOX5AP
single nucleotide polymorphisms(SNP)
myeloid leukemia
分类号
R733.71 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
构建基于CRISPR/Cas9技术敲除ALOX5的质粒
2
作者
梅芬
李瑞玮
张娟娟
左荣霞
邹云莲
沈涛
撒亚莲
机构
昆明理工
大学
附属
医院
云南省第一人民
医院
临床基础
医学
研究所云南省出生缺陷与遗传病研究重点实验室云南省临床病毒学重点实验室
华中科技大学同济医学院
生殖
医学
中心
(
武汉
同济
生殖
医学
专科医院
)
云南省第三人民
医院
生殖
遗传科
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第3期110-114,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31460298)
云南省卫生厅内设机构资助项目(2016NS225)
云南省科技厅-昆医联合专项(2015FB102)
文摘
旨在利用CRISPR/Cas9技术构建敲除花生四烯5-脂氧合酶基因(Arachidonate 5-lipoxygenase gene,ALOX5)的重组质粒。设计合成3对靶向敲除ALOX5第六外显子的sgRNA,将其分别插入到CRISPR/Cas9质粒骨架pX458载体中,转化感受态大肠杆菌DH5α后挑取克隆,通过测序评估重组质粒是否构建成功。将构建好的重组质粒转染293T细胞,在荧光显微镜下观察转染效果,挑取转染成功的细胞,用试剂盒提取转染细胞基因组DNA,PCR扩增含敲除位点的DNA片段,用测序技术获得核苷酸序列,用DNAStar软件分析转染细胞中ALOX5基因敲除情况。测序结果表明2对双链sgRNA寡核苷酸已插入质粒,且序列正确,靶向ALOX5基因的重组质粒pX458-sgRNAs-ALOX5构建成功。其在293T细胞中的转染效率约为50%,用一代测序法未检测到sgRNAs的切割效果。初步表明利用CRISPR/Cas9技术成功构建靶向ALOX5基因的重组质粒pX458-sgRNAs-ALOX5。
关键词
ALOX5
CRISPR/Cas9
基因敲除
构建
质粒
Keywords
ALOX5
CRISPR/Cas9
gene knock out
construction
plasmids
分类号
R733.7 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ALOX5、ALOX5AP基因多态性与髓系白血病易感性的关系
梅芬
王艳飞
杨丹
左荣霞
沈涛
杨同华
撒亚莲
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
构建基于CRISPR/Cas9技术敲除ALOX5的质粒
梅芬
李瑞玮
张娟娟
左荣霞
邹云莲
沈涛
撒亚莲
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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