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膀胱癌免疫基因组学分型及其临床意义
被引量：
6
1
作者
王尧
巴宏军
+2 位作者
柳子川
周旻
周启明
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2020年第11期1452-1456,共5页
目的通过基因组学分析建立膀胱癌免疫分型,并进一步探索其临床应用价值。方法从癌症基因组图谱研究网络(TCGA)数据库下载409例膀胱癌患者的基因表达谱及生存信息,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)对患者进行分组;采用ESTIMATE及CIBERS...
目的通过基因组学分析建立膀胱癌免疫分型,并进一步探索其临床应用价值。方法从癌症基因组图谱研究网络(TCGA)数据库下载409例膀胱癌患者的基因表达谱及生存信息,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)对患者进行分组;采用ESTIMATE及CIBERSORT分别评估各样本中免疫微环境的组成及免疫细胞的分布;通过R软件进行富集分析;采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并对组间差异进行log-rank检验。结果将患者分为高、中、低免疫组,三组间预后具有统计学差异;高免疫组所包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,大部分人类白细胞抗原(HLA)基因及PD-L1的表达最高;且该组中CD8^+T细胞含量最高,M0巨噬细胞和未活化的记忆性CD4^+T细胞最低,基因主要富集在免疫相关功能及通路上。结论膀胱癌免疫分型能够判断患者的预后,高免疫组患者的预后最好,并且具有较高的免疫原性及抗肿瘤免疫活性。
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关键词
膀胱癌
基因组学
免疫分型
预后
免疫检查点抑制剂
ESTIMATE
CIBERSORT
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题名
膀胱癌免疫基因组学分型及其临床意义
被引量：
6
1
作者
王尧
巴宏军
柳子川
周旻
周启明
机构
广州医科
大学
附属
肿瘤
医院
内二科
中山
大学
附属第一
医院
心血管儿科
华中科技大学协和深圳医院南山肿瘤中心
出处
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2020年第11期1452-1456,共5页
基金
国家自然科学基金项目(编号:81802723)。
文摘
目的通过基因组学分析建立膀胱癌免疫分型,并进一步探索其临床应用价值。方法从癌症基因组图谱研究网络(TCGA)数据库下载409例膀胱癌患者的基因表达谱及生存信息,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)对患者进行分组;采用ESTIMATE及CIBERSORT分别评估各样本中免疫微环境的组成及免疫细胞的分布;通过R软件进行富集分析;采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线并对组间差异进行log-rank检验。结果将患者分为高、中、低免疫组,三组间预后具有统计学差异;高免疫组所包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,大部分人类白细胞抗原(HLA)基因及PD-L1的表达最高;且该组中CD8^+T细胞含量最高,M0巨噬细胞和未活化的记忆性CD4^+T细胞最低,基因主要富集在免疫相关功能及通路上。结论膀胱癌免疫分型能够判断患者的预后,高免疫组患者的预后最好,并且具有较高的免疫原性及抗肿瘤免疫活性。
关键词
膀胱癌
基因组学
免疫分型
预后
免疫检查点抑制剂
ESTIMATE
CIBERSORT
Keywords
bladder cancer
genomics
immune type
prognosis
immune checkpoint inhibitors
ESTIMATE
CIBERSORT
分类号
R737.14 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
膀胱癌免疫基因组学分型及其临床意义
王尧
巴宏军
柳子川
周旻
周启明
《实用医学杂志》
CAS
北大核心
2020
6
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