猪专门化分子生物学数据库的建立及其初步应用 被引量：1

1

作者 黄廷华 曹建华 +5 位作者 余梅 刘榜 朱猛进 赵书红 李奎 樊斌 《猪业科学》 2006年第2期19-20,共2页

以公共数据库为基础,利用自编过滤程序初步建立了以核酸序列为主的猪专门化分子生物学数据库。在此基础上初步实现了数据库应用,包括核酸电子自动延伸系统、BLAST同源序列检索程序、参照数据库、siRNA序列设计等。本数据库为猪生物信息... 以公共数据库为基础,利用自编过滤程序初步建立了以核酸序列为主的猪专门化分子生物学数据库。在此基础上初步实现了数据库应用,包括核酸电子自动延伸系统、BLAST同源序列检索程序、参照数据库、siRNA序列设计等。本数据库为猪生物信息学研究平台的建立打下了基础。 展开更多

关键词 分子生物学数据库 生物信息学 数据库应用 猪

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DNA分子标记在动物个体识别与亲权鉴定方面的应用 被引量：14

2

作者 李孟华 王海生 +3 位作者 赵书红 刘榜 陈世林 李奎 《生物技术通报》 CAS CSCD 2001年第5期4-7,共4页

自从DNA分子标记技术建立以来 ,各种DNA分子标记相继被广泛地应用于遗传图谱的构建、评估遗传多样性以及个体识别、亲权鉴定等方面。综述了利用DNA分子标记技术 ,进行动物个体识别与亲权鉴定的原理、研究进展、现状及其应用前景与存在... 自从DNA分子标记技术建立以来 ,各种DNA分子标记相继被广泛地应用于遗传图谱的构建、评估遗传多样性以及个体识别、亲权鉴定等方面。综述了利用DNA分子标记技术 ,进行动物个体识别与亲权鉴定的原理、研究进展、现状及其应用前景与存在的问题。 展开更多

关键词 DAN分子标记 动物 个体识别 亲权鉴定 应用

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哺乳动物的miRNA研究 被引量：1

3

作者 程会军 张定校 樊斌 《生物学杂志》 CAS CSCD 2007年第3期1-5,共5页

微小RNA(microRNA,miRNA)是新近发现的一类重要非编码调控RNA,以转录或转录后水平调节方式参与哺乳动物发育(细胞生长、分化、凋亡)、免疫调节及疾病发生等过程。就miRNA的形成及作用机制,哺乳动物中miRNA发现策略、靶位点的识别,miRNA... 微小RNA(microRNA,miRNA)是新近发现的一类重要非编码调控RNA,以转录或转录后水平调节方式参与哺乳动物发育(细胞生长、分化、凋亡)、免疫调节及疾病发生等过程。就miRNA的形成及作用机制,哺乳动物中miRNA发现策略、靶位点的识别,miRNA功能研究进行综述,为类似研究提供参考。 展开更多

关键词 MIRNA 作用机制 功能 哺乳动物

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微卫星及其功能研究 被引量：8

4

作者 杨述林 王志刚 +2 位作者 樊斌 刘榜 李奎 《湖北农业科学》 北大核心 2003年第6期91-93,共3页

概述了微卫星的发现及其在进化过程中产生和消亡的机理 ;

关键词 微卫星 进化 产生 消亡 序列 基因组 功能 DNA重复序列 染色质 折叠 性别 端粒 着丝粒 表达 蛋白 剂量效应 重组 复制 密码

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利用5个多态蛋白(酶)位点分析6个地方猪品种的遗传结构 被引量：4

5

作者 林丽 王志刚 +6 位作者 刘榜 李拥军 赵小丽 杨述林 樊斌 李奎 肖炜 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期511-515,共5页

利用 5个多态蛋白 (酶 )位点碱性磷酸酶 (Akp)、蛋白酶抑制物 1(PI 1)、后白蛋白 1(Po 1)、后白蛋白2 (Po 2 )和铜蓝蛋白 (Cp)分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪 6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。 6个品种... 利用 5个多态蛋白 (酶 )位点碱性磷酸酶 (Akp)、蛋白酶抑制物 1(PI 1)、后白蛋白 1(Po 1)、后白蛋白2 (Po 2 )和铜蓝蛋白 (Cp)分析了清平猪、阳新猪、南阳黑猪、南城黑猪、东乡花猪、杭猪 6个地方猪品种的遗传结构和遗传变异。 6个品种的平均杂合度大小依次为 :南阳黑猪 (0 .4 14 2 )、南城黑猪 (0 .30 5 7)、阳新猪 (0 .30 32 )、东乡花猪 (0 .2 6 0 6 )、杭猪 (0 .2 4 78)、清平猪 (0 .2 4 16 ) ,通过计算Nei(1978)标准遗传距离 ,用UPGMA进行聚类分析 ,6个品种聚成 2大类 :清平猪、南城黑猪、阳新猪、南阳黑猪聚成一大类 ;东乡花猪与杭猪聚成另一类。 展开更多

关键词 猪 蛋白多态性 遗传结构 地方品种 遗传标记 蛋白酶

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饱和苯酚-氯仿抽提法与Chelex-100树脂法提取DNA在研究犬STR基因座多态性中的应用比较 被引量：4

6

作者 王海生 张文平 +5 位作者 王祥 李孟华 康远方 刘榜 李奎 陈家琳 《湖北农业科学》 北大核心 2002年第6期107-110,共4页

在研究犬STR基因座多态性中,比较使用了饱和苯酚-氯仿抽提法和Chelex-100树脂法,两种方法提取的DNA在扩增后的检测结果均能准确地反映实验结果。尽管从平均峰面积和平均峰高值等指标上,利用Chelex-100树脂法提取的DNA质量和扩增后的检... 在研究犬STR基因座多态性中,比较使用了饱和苯酚-氯仿抽提法和Chelex-100树脂法,两种方法提取的DNA在扩增后的检测结果均能准确地反映实验结果。尽管从平均峰面积和平均峰高值等指标上,利用Chelex-100树脂法提取的DNA质量和扩增后的检测效果较饱和苯酚-氯仿抽提法差,但Chelex-100树脂提取法更为简单快捷,适合在建立警犬STR基因座等位基因数据库中和犬亲缘关系鉴定中广泛使用。 展开更多

关键词 饱和苯酚-氯仿抽提法 Chelex-100树脂法 提取 DNA 犬 STR基因座多态性 应用 比较

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利用体细胞杂种克隆板进行染色体区域定位的数据分析 被引量：1

7

作者 余梅 刘榜 +2 位作者 赵书红 熊统安 李奎 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期48-52,共5页

利用猪×啮齿类体细胞杂种克隆板对本室新克隆和分离的猪胶质细胞原纤维酸性蛋白 (glialfibril laryacidicprotein ,GFAP)基因进行染色体区域定位 ,对应用体细胞杂种克隆板进行染色体区域定位的试验数据统计的基本过程和方法进行了... 利用猪×啮齿类体细胞杂种克隆板对本室新克隆和分离的猪胶质细胞原纤维酸性蛋白 (glialfibril laryacidicprotein ,GFAP)基因进行染色体区域定位 ,对应用体细胞杂种克隆板进行染色体区域定位的试验数据统计的基本过程和方法进行了分析 ,研究结果表明 :猪GFAP基因定位于染色体 12p11- (2 /3p13)区域 (P <0 .1% ) 。 展开更多

关键词 体细胞杂种克隆板 染色体区域定位 数据分析 猪 GFAP基因

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应用参考家系信息构建猪12号染色体部分微位星位点遗传图的研究 被引量：1

8

作者 赵书红 张建生 +4 位作者 孙仕铨 顾建平 余梅 李奎 彭中镇 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第5期469-473,共5页

为了提高猪１２号染色体遗传图的精度，选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系，采取了两胎共１５４头个体的血样，全血裂解法提取ＤＮＡ后，对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染... 为了提高猪１２号染色体遗传图的精度，选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系，采取了两胎共１５４头个体的血样，全血裂解法提取ＤＮＡ后，对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染色体上３个微卫星位点（ＳＷ１５５３，ＳＷ８７４，ＳＷ１３５０）的基因型，应用ＣＲＩＭＡＰ程序进行了统计分析，得到的３位点间的最佳排序为：ＳＷ１５５３－ＳＷ１３５０－ＳＷ８７４。其中在两个美国肉畜研究中心图中重组率为０的位点（ＳＷ１５５３，ＳＷ１３５０）上发现了重组，并与其他位点做了排序，提高了这一区域的定位精度。 展开更多

关键词 猪 12号染色体 遗传图 微位星位点

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用正交设计优化M13mp18RFDNA转染大肠杆菌TG_1的条件 被引量：1

9

作者 龚炎长 李奎 +2 位作者 彭中镇 师守坤 赵书红 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第5期386-388,共3页

采用正交设计（Ｌ９（３４））对影响Ｍ１３ｍｐ１８转染其宿主大肠杆菌ＴＧ１的３个因素：热激温度、时间和ＤＮＡ量各设３个水平进行优化。直观分析表明：热激温度是主要的，其次是ＤＮＡ量，最后是热激时间。直观分析确定的较优转染... 采用正交设计（Ｌ９（３４））对影响Ｍ１３ｍｐ１８转染其宿主大肠杆菌ＴＧ１的３个因素：热激温度、时间和ＤＮＡ量各设３个水平进行优化。直观分析表明：热激温度是主要的，其次是ＤＮＡ量，最后是热激时间。直观分析确定的较优转染条件为：热激温度４４℃、时间１２０ｓ、ＤＮＡ量６００ｐｇ。验证转染试验表明：在该条件下Ｍ１３ｍｐ１８对ＴＧ１的转染效率较高。 展开更多

关键词 畜牧 M13mp18噬菌体 转染 正交设计

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鸡卵细胞卵黄生成受体及其研究进展 被引量：3

10

作者 龚炎长 彭中镇 师守坤 《湖北农业科学》 1998年第1期56-58,共3页

对鸡卵细胞卵黄生成受体（ＯＶＲ）的结构、生理功能及其受控基因多态性的研究现状进行了综述，并讨论了对此基因作进一步研究的必要性。

关键词 卵细胞 卵黄生成受体 结构 功能 基因多态性 鸡

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猪数量性状基因及其标记研究进展 被引量：22

11

作者 彭中镇 赵书红 +2 位作者 李奎 龚炎长 杨兴柱 《国外畜牧科技》 1999年第1期28-32,共5页

对猪中有关生长、胴体、肉质和繁殖性状的数量性状位点及其标记的研究现状与前景作了综述。

关键词 猪 数量性状位点 遗传标记 候选基因

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中国地方猪保种与利用工作的思考 被引量：6

12

作者 彭中镇 刘榜 樊斌 《湖北畜牧兽医》 2004年第3期8-12,共5页

简述了我国地方猪保种与利用工作的成效,提出了我国地方猪品种资源危机带有全局性,亟待采取应急措施;当前紧迫的任务是保持其遗传多样性,维持公猪现有的血统数;活体保种应立足于保种场,兼顾保种区;资源评估工作有待加强;有计划地开展有... 简述了我国地方猪保种与利用工作的成效,提出了我国地方猪品种资源危机带有全局性,亟待采取应急措施;当前紧迫的任务是保持其遗传多样性,维持公猪现有的血统数;活体保种应立足于保种场,兼顾保种区;资源评估工作有待加强;有计划地开展有利于保种的优质商品猪生产。 展开更多

关键词 中国 猪 品种 种质资源 遗传多样性

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精子体外获能影响因素探析 被引量：7

13

作者 陈世林 李颖康 +1 位作者 达文政 朱猛进 《宁夏农林科技》 2002年第1期43-44,共2页

阐述了精子体外获能的提出。

关键词 精子获能 体外成熟 体外受精 精子体外获能 生理作用 作用机制 影响因素

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随机扩增微卫星DNA多态标记(RAMPs)及其应用 被引量：3

14

作者 樊斌 刘榜 李奎 《黄牛杂志》 2002年第2期27-29,共3页

随机扩增微卫星 DNA多态标记是在微卫星 DNA基础上衍生出的一种新型分子标记。它综合了微卫星 DNA和随机扩增多态 DNA( RAPD)两种标记的优点 ,可用来快速检测动植物群体的遗传变异及分离新的微卫星 DNA。本文介绍了随机扩增微卫星 DNA... 随机扩增微卫星 DNA多态标记是在微卫星 DNA基础上衍生出的一种新型分子标记。它综合了微卫星 DNA和随机扩增多态 DNA( RAPD)两种标记的优点 ,可用来快速检测动植物群体的遗传变异及分离新的微卫星 DNA。本文介绍了随机扩增微卫星 DNA多态标记的种类及其应用。 展开更多

关键词 应用 随机扩增微卫星DNA多态标记 RAMPS 种类 分子标记

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鸡胸肌中特异表达的基因-Tx-TnT

15

作者 余梅 赵书红 +1 位作者 李奎 刘榜 《中国家禽》 北大核心 2000年第1期34-35,共2页

鸡的快骨骼肌Tx -TnT基因特异性地在胸肌中表达Tx -TnT异构体 ,本文对Tx -TnT的结构组成、特异性的表达及生理功能的研究现状进行了综述 ,并且讨论了对Tx

关键词 鸡 胸肌 Tx-TnT 基因 特异表达 生理

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西藏绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊随机扩增多态DNA研究 被引量：2

16

作者 陈世林 赵书红 +2 位作者 余梅 李孟华 李奎 《中国草食动物》 2002年第S1期76-78,共4页

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对西藏绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析比较 ,用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用这 5个随机引物 (组合 ... 利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对西藏绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析比较 ,用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用这 5个随机引物 (组合 )对 3个品种 ,每个品种 2 8个个体进行扩增。据它们的RAPD指纹图计算了遗传距离 ,得到 :西藏绒山羊同内蒙古绒山羊的遗传距离为 0 0 876 ,西藏绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为0 16 0 1,内蒙古绒山羊同辽宁绒山羊的遗传距离为 0 0 80 3。这同它们之间地理位置的远近相吻合。据RAPD指纹图计算了西藏绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊的遗传变异分别为 0 32 6 6 ,0 2 6 2 2 ,0 2 4 75。这同它们系统选育的历史长短相一致。 展开更多

关键词 随机扩增多态DNA 绒山羊 遗传变异 遗传距离

全文增补中

鸡OVR基因的一个片段PCR扩增克隆与鉴定 被引量：4

17

作者 刘学芹 龚炎长 +1 位作者 喻传洲 沈世学 《中国家禽》 北大核心 2000年第7期6-7,共2页

根据已知序列合成引物 ,并利用正交设计原理扩增出一个423bp 的鸡DNA片段 ,经酶切鉴定证明是鸡OVR基因中含限制排卵突变的片段。这一结果为进一步研究OVR基因的多态性打下了基础。

关键词 PCR OVR基因片段 鸡

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藏山羊微卫星DNA复合扩增的条件探索

18

作者 李孟华 王海生 +5 位作者 张文平 康远方 赵书红 边次 刘榜 李奎 《湖北农业科学》 北大核心 2003年第1期89-91,共3页

对微卫星DNA的复合扩增与同步扩增进行比较研究 ,结果表明通过优化微卫星位点引物组合 ,以及复合扩增反应体系中模板DNA浓度、引物浓度、Mg2 +浓度、退火温度和检测时的电泳环境等一系列条件 ,其扩增产物量以及产物特异性虽然均有所下... 对微卫星DNA的复合扩增与同步扩增进行比较研究 ,结果表明通过优化微卫星位点引物组合 ,以及复合扩增反应体系中模板DNA浓度、引物浓度、Mg2 +浓度、退火温度和检测时的电泳环境等一系列条件 ,其扩增产物量以及产物特异性虽然均有所下降 ,然而其扩增产物能准确反映结果 ,且具有方便、快捷。 展开更多

关键词 藏山羊 微卫星DNA 复合扩增 条件

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