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草鱼钠磷协同转运载体SlC34a2基因的克隆及组织表达分析
1
作者
陈沛
黄艳青
+1 位作者
谢从新
王春芳
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期879-885,共7页
为了揭示草鱼对磷的吸收机制,运用RT-PCR和快速扩增c DNA末端方法,从草鱼(Ctenopharyngodon idella)肠中克隆获得钠磷协同转运载体基因Slc34a2,该基因全长为2446 bp,包含了1938 bp的开放阅读框,47 bp的5′非编码区(Untranslated region,...
为了揭示草鱼对磷的吸收机制,运用RT-PCR和快速扩增c DNA末端方法,从草鱼(Ctenopharyngodon idella)肠中克隆获得钠磷协同转运载体基因Slc34a2,该基因全长为2446 bp,包含了1938 bp的开放阅读框,47 bp的5′非编码区(Untranslated region,UTR)和461 bp的3′UTR,编码645个氨基酸。草鱼SLC34A2蛋白的分子式为C3215H5125N801O902S30,分子量大小为70.39 k D,等电点为5.68,总平均疏水指数为0.458。对草鱼SLC34A2蛋白结构和功能预测分析,发现SLC34A2蛋白有11个跨膜域,1个半胱氨酸富集区,且N-端在胞外而C-端在胞内,也在第二个细胞外环中发现4个N-糖基化位点。用邻接法构建系统进化树,发现草鱼Slc34a2基因与硬骨鱼类聚类为一支,且草鱼SLC34A2蛋白与鲤(Cyprinus carpio)和斑马鱼(Danio rerio)SLC34A2的相似性最高,分别为90.3%和87.0%。实验采用了实时荧光定量PCR对草鱼Slc34a2 m RNA进行组织表达分析,结果表明Slc34a2 m RNA在组织中广谱表达,且在肠中表达最高,其次是肝脏、鳃、肾脏、脾脏、皮肤、肌肉、脑和头肾。实验为以后研究提高鱼对磷的利用和减少磷的排放奠定分子基础。
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关键词
草鱼
Slc34a2
分子克隆
基因表达
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题名
草鱼钠磷协同转运载体SlC34a2基因的克隆及组织表达分析
1
作者
陈沛
黄艳青
谢从新
王春芳
机构
华中农业大学水产学院、淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心
中国
水产
科学研究院东海
水产
研究所、
农业
部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期879-885,共7页
基金
国家自然科学基金(31172421)
现代农业产业技术体系建设专项基金(CARS-46)资助~~
文摘
为了揭示草鱼对磷的吸收机制,运用RT-PCR和快速扩增c DNA末端方法,从草鱼(Ctenopharyngodon idella)肠中克隆获得钠磷协同转运载体基因Slc34a2,该基因全长为2446 bp,包含了1938 bp的开放阅读框,47 bp的5′非编码区(Untranslated region,UTR)和461 bp的3′UTR,编码645个氨基酸。草鱼SLC34A2蛋白的分子式为C3215H5125N801O902S30,分子量大小为70.39 k D,等电点为5.68,总平均疏水指数为0.458。对草鱼SLC34A2蛋白结构和功能预测分析,发现SLC34A2蛋白有11个跨膜域,1个半胱氨酸富集区,且N-端在胞外而C-端在胞内,也在第二个细胞外环中发现4个N-糖基化位点。用邻接法构建系统进化树,发现草鱼Slc34a2基因与硬骨鱼类聚类为一支,且草鱼SLC34A2蛋白与鲤(Cyprinus carpio)和斑马鱼(Danio rerio)SLC34A2的相似性最高,分别为90.3%和87.0%。实验采用了实时荧光定量PCR对草鱼Slc34a2 m RNA进行组织表达分析,结果表明Slc34a2 m RNA在组织中广谱表达,且在肠中表达最高,其次是肝脏、鳃、肾脏、脾脏、皮肤、肌肉、脑和头肾。实验为以后研究提高鱼对磷的利用和减少磷的排放奠定分子基础。
关键词
草鱼
Slc34a2
分子克隆
基因表达
Keywords
Grass carp
Slc34a2
Molecular characterization
Gene expression
分类号
S965.1 [农业科学—水产养殖]
Q344.1 [生物学—遗传学]
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作者
出处
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1
草鱼钠磷协同转运载体SlC34a2基因的克隆及组织表达分析
陈沛
黄艳青
谢从新
王春芳
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
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