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长江中下游二倍体泥鳅4个种群的遗传多样性
被引量：
9
1
作者
单磊
魏开建
+2 位作者
张桂蓉
邹桂伟
王卫民
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期453-458,共6页
利用12对微卫星引物对长江中下游4个二倍体泥鳅野生种群的遗传多样性进行了分析。结果表明：12个微卫星位点在武汉、洞庭湖、鄱阳湖和太湖4个种群中总共检测到64个等位基因，每个位点的等位基因数为2～11，平均等位基因数为5．3。每个...
利用12对微卫星引物对长江中下游4个二倍体泥鳅野生种群的遗传多样性进行了分析。结果表明：12个微卫星位点在武汉、洞庭湖、鄱阳湖和太湖4个种群中总共检测到64个等位基因，每个位点的等位基因数为2～11，平均等位基因数为5．3。每个种群的平均等位基因丰度（An）为3．502～4．615，平均观测杂合度（Ho）为0．395-0．517，平均期望杂合度（HE）为0．360-0．515，平均多态信息含量（PIC）为0．332-0．465，说明4个种群表现出中度的遗传多样性。在12个位点中有4个偏离Hardy-Weinberg平衡（HWE），每个种群均不同程度偏离HWE，表现为杂合子不足。种群问遗传分化系数（Gsr）为0．118，15．74％遗传变异源于种群间差异，表明种群间存在中度遗传分化。种群间遗传距离（D）为0．067-0．206，太湖与鄱阳湖种群间遗传距离最大。聚类分析表明，洞庭湖与鄱阳湖种群聚为一支、亲缘关系较近，武汉种群与太湖种群聚为另一支。
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关键词
泥鳅
二倍体
遗传多样性
微卫星DNA
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职称材料
二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析
被引量：
1
2
作者
郑鹏飞
张桂蓉
+4 位作者
魏开建
邹桂伟
王卫民
周玲玲
冉伟
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第1期51-56,共6页
采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切...
采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(HaeⅢ、DraⅠ、RsaⅠ、TaqⅠ、HinfⅠ、MspⅠ),对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679～0.9385和0.01041～0.03212;其中,洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588～0.04144,平均值为(0.031737±0.000005)。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462～0.01617,平均值为(0.010659±0.000003);其中,武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。MonteCarlo模拟x2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(P<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支,亲缘关系较近;武汉二倍体为单独一支。
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关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
RFLP
MTDNA
ND-5/6
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职称材料
题名
长江中下游二倍体泥鳅4个种群的遗传多样性
被引量：
9
1
作者
单磊
魏开建
张桂蓉
邹桂伟
王卫民
机构
华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
中国
水产
科
学院
长江
水产
研究所
/农业部
淡水
生物
多样性
保护与
利用
重点
开放实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期453-458,共6页
基金
国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002)
华中农业大学科技创新基金项目(52204-04082)资助
文摘
利用12对微卫星引物对长江中下游4个二倍体泥鳅野生种群的遗传多样性进行了分析。结果表明：12个微卫星位点在武汉、洞庭湖、鄱阳湖和太湖4个种群中总共检测到64个等位基因，每个位点的等位基因数为2～11，平均等位基因数为5．3。每个种群的平均等位基因丰度（An）为3．502～4．615，平均观测杂合度（Ho）为0．395-0．517，平均期望杂合度（HE）为0．360-0．515，平均多态信息含量（PIC）为0．332-0．465，说明4个种群表现出中度的遗传多样性。在12个位点中有4个偏离Hardy-Weinberg平衡（HWE），每个种群均不同程度偏离HWE，表现为杂合子不足。种群问遗传分化系数（Gsr）为0．118，15．74％遗传变异源于种群间差异，表明种群间存在中度遗传分化。种群间遗传距离（D）为0．067-0．206，太湖与鄱阳湖种群间遗传距离最大。聚类分析表明，洞庭湖与鄱阳湖种群聚为一支、亲缘关系较近，武汉种群与太湖种群聚为另一支。
关键词
泥鳅
二倍体
遗传多样性
微卫星DNA
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
diploid
genetic diversity
microsatellite DNA
分类号
S931.5 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析
被引量：
1
2
作者
郑鹏飞
张桂蓉
魏开建
邹桂伟
王卫民
周玲玲
冉伟
机构
华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室/农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
中国
水产
科学研究院长江
水产
研究所
/农业部
淡水
生物
多样性
保护与
利用
重点
开放实验室
出处
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第1期51-56,共6页
基金
国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002)
农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室开放课题(LFB-CU0708)资助
文摘
采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(HaeⅢ、DraⅠ、RsaⅠ、TaqⅠ、HinfⅠ、MspⅠ),对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679～0.9385和0.01041～0.03212;其中,洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588～0.04144,平均值为(0.031737±0.000005)。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462～0.01617,平均值为(0.010659±0.000003);其中,武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。MonteCarlo模拟x2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(P<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支,亲缘关系较近;武汉二倍体为单独一支。
关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
RFLP
MTDNA
ND-5/6
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
diploid
Tetraploid
RFLP
mtDNA
ND-5/6
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长江中下游二倍体泥鳅4个种群的遗传多样性
单磊
魏开建
张桂蓉
邹桂伟
王卫民
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
9
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职称材料
2
二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析
郑鹏飞
张桂蓉
魏开建
邹桂伟
王卫民
周玲玲
冉伟
《水生态学杂志》
北大核心
2011
1
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