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长江中下游二倍体泥鳅4个种群的遗传多样性
被引量:
9
1
作者
单磊
魏开建
+2 位作者
张桂蓉
邹桂伟
王卫民
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期453-458,共6页
利用12对微卫星引物对长江中下游4个二倍体泥鳅野生种群的遗传多样性进行了分析。结果表明:12个微卫星位点在武汉、洞庭湖、鄱阳湖和太湖4个种群中总共检测到64个等位基因,每个位点的等位基因数为2~11,平均等位基因数为5.3。每个...
利用12对微卫星引物对长江中下游4个二倍体泥鳅野生种群的遗传多样性进行了分析。结果表明:12个微卫星位点在武汉、洞庭湖、鄱阳湖和太湖4个种群中总共检测到64个等位基因,每个位点的等位基因数为2~11,平均等位基因数为5.3。每个种群的平均等位基因丰度(An)为3.502~4.615,平均观测杂合度(Ho)为0.395-0.517,平均期望杂合度(HE)为0.360-0.515,平均多态信息含量(PIC)为0.332-0.465,说明4个种群表现出中度的遗传多样性。在12个位点中有4个偏离Hardy-Weinberg平衡(HWE),每个种群均不同程度偏离HWE,表现为杂合子不足。种群问遗传分化系数(Gsr)为0.118,15.74%遗传变异源于种群间差异,表明种群间存在中度遗传分化。种群间遗传距离(D)为0.067-0.206,太湖与鄱阳湖种群间遗传距离最大。聚类分析表明,洞庭湖与鄱阳湖种群聚为一支、亲缘关系较近,武汉种群与太湖种群聚为另一支。
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关键词
泥鳅
二倍体
遗传多样性
微卫星DNA
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职称材料
溶氧水平对黄颡鱼稚鱼摄食、生长及呼吸代谢的影响
被引量:
29
2
作者
杨凯
樊启学
+4 位作者
张磊
杨磊
周华
李波
方巍
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2010年第2期24-29,共6页
在(28±0.5)℃循环水环境中设置4种溶氧水平,分别为2.92 mg/L(G1组)、4.71 mg/L(G2组)、6.77 mg/L(G3组)、9.68 mg/L(G4组),研究初始体重为(1.62±0.02)g的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidracoR.)稚鱼的生长、摄食及...
在(28±0.5)℃循环水环境中设置4种溶氧水平,分别为2.92 mg/L(G1组)、4.71 mg/L(G2组)、6.77 mg/L(G3组)、9.68 mg/L(G4组),研究初始体重为(1.62±0.02)g的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidracoR.)稚鱼的生长、摄食及呼吸代谢规律。结果显示:G3组特定生长率(SGR)、饲料效率(FE)均显著高于其它各试验组(P〈0.05)。试验鱼的耗氧率、排氨率与溶氧水平无正相关性,G3组的耗氧率、排氨率始终显著高于其它三组。第6周测定发现:摄食后1-4 h内耗氧率和排氨率均呈现迅速上升,到达最大值后再缓慢下降,二者均在09∶00和21∶00出现高峰,G3组的耗氧率高峰值分别为0.345、0.331 mg/g.h,G3组的排氨率高峰值分别为24.194、17.770μg/g.h。结果表明:不同溶氧条件下,黄颡鱼稚鱼的耗氧率、排氨率变化过程具有类似的特征,二者在能量代谢机制上相互关联;在6.77 mg/L的溶氧水平下,黄颡鱼稚鱼生长最快、呼吸代谢最为旺盛。
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关键词
黄颡鱼(Pelteobagrus
FULVIDRACO
R.)
溶氧
生长
耗氧率
排氨率
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职称材料
同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构
被引量:
6
3
作者
周玲玲
张桂蓉
+4 位作者
魏开建
邹桂伟
王卫民
梁宏伟
冉玮
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期624-630,共7页
采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23~40个;...
采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23~40个;各群体的Nei's基因多样性(h)和Shannon's信息指数(I)平均值分别为0.205~0.218和0.324~0.341,4个群体间的h以及I差异不明显;基于Nei's无偏遗传距离构建的UPGMA树显示,洞庭湖二倍体和四倍体泥鳅群体亲缘关系最近,先聚为一支,再与武汉四倍体泥鳅聚为一支,而武汉二倍体泥鳅聚为单独一支。测定了4个泥鳅群体40个个体线粒体DNA控制区序列片段(932~935bp),发现47个变异位点,共计29种单倍型。洞庭湖四倍体和二倍体泥鳅群体的核苷酸多样性(π)分别为0.898%和0.872%,明显大于武汉四倍体(π=0.465%)和二倍体(π=0.675%)。在同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体中,洞庭湖四倍体遗传多样性略大于洞庭湖二倍体,武汉二倍体则明显大于武汉四倍体。AMOVA分析表明,泥鳅群体的遗传变异主要来自群体内(62.68%),群体间的变异达到37.32%;群体间成对固定指数FST及Kimura 2-parameter遗传距离均显示,洞庭湖四倍体与二倍体泥鳅群体无明显分化,其余群体间均存在显著分化。控制区序列单倍型Bayesian系统树与SRAP分析所揭示的4个泥鳅群体的亲缘关系相似。
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关键词
泥鳅
相关序列扩增多态性
线粒体DNA控制区
倍性
遗传变异
单倍型
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职称材料
二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析
被引量:
1
4
作者
郑鹏飞
张桂蓉
+4 位作者
魏开建
邹桂伟
王卫民
周玲玲
冉伟
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第1期51-56,共6页
采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切...
采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(HaeⅢ、DraⅠ、RsaⅠ、TaqⅠ、HinfⅠ、MspⅠ),对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679~0.9385和0.01041~0.03212;其中,洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588~0.04144,平均值为(0.031737±0.000005)。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462~0.01617,平均值为(0.010659±0.000003);其中,武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。MonteCarlo模拟x2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(P<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支,亲缘关系较近;武汉二倍体为单独一支。
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关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
RFLP
MTDNA
ND-5/6
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职称材料
题名
长江中下游二倍体泥鳅4个种群的遗传多样性
被引量:
9
1
作者
单磊
魏开建
张桂蓉
邹桂伟
王卫民
机构
华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室
/
农业
动物遗传育种与繁殖教育部
重点
实验室
中国
水产
科
学院
长江
水产
研究所
/农业部
淡水
生物
多样性
保护与
利用
重点
开放实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期453-458,共6页
基金
国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002)
华中农业大学科技创新基金项目(52204-04082)资助
文摘
利用12对微卫星引物对长江中下游4个二倍体泥鳅野生种群的遗传多样性进行了分析。结果表明:12个微卫星位点在武汉、洞庭湖、鄱阳湖和太湖4个种群中总共检测到64个等位基因,每个位点的等位基因数为2~11,平均等位基因数为5.3。每个种群的平均等位基因丰度(An)为3.502~4.615,平均观测杂合度(Ho)为0.395-0.517,平均期望杂合度(HE)为0.360-0.515,平均多态信息含量(PIC)为0.332-0.465,说明4个种群表现出中度的遗传多样性。在12个位点中有4个偏离Hardy-Weinberg平衡(HWE),每个种群均不同程度偏离HWE,表现为杂合子不足。种群问遗传分化系数(Gsr)为0.118,15.74%遗传变异源于种群间差异,表明种群间存在中度遗传分化。种群间遗传距离(D)为0.067-0.206,太湖与鄱阳湖种群间遗传距离最大。聚类分析表明,洞庭湖与鄱阳湖种群聚为一支、亲缘关系较近,武汉种群与太湖种群聚为另一支。
关键词
泥鳅
二倍体
遗传多样性
微卫星DNA
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
diploid
genetic diversity
microsatellite DNA
分类号
S931.5 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
溶氧水平对黄颡鱼稚鱼摄食、生长及呼吸代谢的影响
被引量:
29
2
作者
杨凯
樊启学
张磊
杨磊
周华
李波
方巍
机构
华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2010年第2期24-29,共6页
基金
国家科技支撑计划项目(No.2007BAD37B02)
湖北省"十一五"重大科技攻关项目(No.2006AA203A01)
文摘
在(28±0.5)℃循环水环境中设置4种溶氧水平,分别为2.92 mg/L(G1组)、4.71 mg/L(G2组)、6.77 mg/L(G3组)、9.68 mg/L(G4组),研究初始体重为(1.62±0.02)g的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidracoR.)稚鱼的生长、摄食及呼吸代谢规律。结果显示:G3组特定生长率(SGR)、饲料效率(FE)均显著高于其它各试验组(P〈0.05)。试验鱼的耗氧率、排氨率与溶氧水平无正相关性,G3组的耗氧率、排氨率始终显著高于其它三组。第6周测定发现:摄食后1-4 h内耗氧率和排氨率均呈现迅速上升,到达最大值后再缓慢下降,二者均在09∶00和21∶00出现高峰,G3组的耗氧率高峰值分别为0.345、0.331 mg/g.h,G3组的排氨率高峰值分别为24.194、17.770μg/g.h。结果表明:不同溶氧条件下,黄颡鱼稚鱼的耗氧率、排氨率变化过程具有类似的特征,二者在能量代谢机制上相互关联;在6.77 mg/L的溶氧水平下,黄颡鱼稚鱼生长最快、呼吸代谢最为旺盛。
关键词
黄颡鱼(Pelteobagrus
FULVIDRACO
R.)
溶氧
生长
耗氧率
排氨率
Keywords
Pelteobagrt
fulvidraco
dissolved oxygen
growth
oxygen consumption
ammonia excretion
分类号
S966.4 [农业科学—水产养殖]
Q178.1 [生物学—水生生物学]
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职称材料
题名
同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构
被引量:
6
3
作者
周玲玲
张桂蓉
魏开建
邹桂伟
王卫民
梁宏伟
冉玮
机构
华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室
中国
水产
科学研究院长江
水产
研究所
/农业部
淡水
生物
多样性
保护与
利用
重点
开放实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期624-630,共7页
基金
国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002)
农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室开放课题(LFBCU0708)
文摘
采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明,18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到534个位点,每对引物组合检测的位点数为23~40个;各群体的Nei's基因多样性(h)和Shannon's信息指数(I)平均值分别为0.205~0.218和0.324~0.341,4个群体间的h以及I差异不明显;基于Nei's无偏遗传距离构建的UPGMA树显示,洞庭湖二倍体和四倍体泥鳅群体亲缘关系最近,先聚为一支,再与武汉四倍体泥鳅聚为一支,而武汉二倍体泥鳅聚为单独一支。测定了4个泥鳅群体40个个体线粒体DNA控制区序列片段(932~935bp),发现47个变异位点,共计29种单倍型。洞庭湖四倍体和二倍体泥鳅群体的核苷酸多样性(π)分别为0.898%和0.872%,明显大于武汉四倍体(π=0.465%)和二倍体(π=0.675%)。在同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体中,洞庭湖四倍体遗传多样性略大于洞庭湖二倍体,武汉二倍体则明显大于武汉四倍体。AMOVA分析表明,泥鳅群体的遗传变异主要来自群体内(62.68%),群体间的变异达到37.32%;群体间成对固定指数FST及Kimura 2-parameter遗传距离均显示,洞庭湖四倍体与二倍体泥鳅群体无明显分化,其余群体间均存在显著分化。控制区序列单倍型Bayesian系统树与SRAP分析所揭示的4个泥鳅群体的亲缘关系相似。
关键词
泥鳅
相关序列扩增多态性
线粒体DNA控制区
倍性
遗传变异
单倍型
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
SRAP
mitochondrial DNA control region
ploidy
genetic variation
haplotype
分类号
S917 [农业科学—水产科学]
Q347 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析
被引量:
1
4
作者
郑鹏飞
张桂蓉
魏开建
邹桂伟
王卫民
周玲玲
冉伟
机构
华中农业大学水产学院/农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室
/
农业
动物遗传育种与繁殖教育部
重点
实验室
中国
水产
科学研究院长江
水产
研究所
/农业部
淡水
生物
多样性
保护与
利用
重点
开放实验室
出处
《水生态学杂志》
北大核心
2011年第1期51-56,共6页
基金
国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002)
农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室开放课题(LFB-CU0708)资助
文摘
采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(HaeⅢ、DraⅠ、RsaⅠ、TaqⅠ、HinfⅠ、MspⅠ),对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679~0.9385和0.01041~0.03212;其中,洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588~0.04144,平均值为(0.031737±0.000005)。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462~0.01617,平均值为(0.010659±0.000003);其中,武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。MonteCarlo模拟x2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(P<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支,亲缘关系较近;武汉二倍体为单独一支。
关键词
泥鳅
二倍体
四倍体
RFLP
MTDNA
ND-5/6
Keywords
Misgurnus anguillicaudatus
diploid
Tetraploid
RFLP
mtDNA
ND-5/6
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长江中下游二倍体泥鳅4个种群的遗传多样性
单磊
魏开建
张桂蓉
邹桂伟
王卫民
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
9
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职称材料
2
溶氧水平对黄颡鱼稚鱼摄食、生长及呼吸代谢的影响
杨凯
樊启学
张磊
杨磊
周华
李波
方巍
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2010
29
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职称材料
3
同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构
周玲玲
张桂蓉
魏开建
邹桂伟
王卫民
梁宏伟
冉玮
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
6
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职称材料
4
二倍体和四倍体泥鳅线粒体ND-5/6基因多态性的PCR-RFLP分析
郑鹏飞
张桂蓉
魏开建
邹桂伟
王卫民
周玲玲
冉伟
《水生态学杂志》
北大核心
2011
1
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