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功能型分子标记(ISAP)的开发及评价
被引量:
48
1
作者
陆才瑞
喻树迅
+4 位作者
于霁雯
范术丽
宋美珍
王武
马淑娟
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第9期1207-1216,共10页
分子标记在图谱构建,QTL分析,基因定位以及标记辅助育种中起着越来越重要的作用。研究者都期望一个分子标记位点代表一个特定的基因,甚至与某种性状联系起来,这样,通过对某个分子标记的筛选即能对性状进行筛选,此即功能型分子标记。而...
分子标记在图谱构建,QTL分析,基因定位以及标记辅助育种中起着越来越重要的作用。研究者都期望一个分子标记位点代表一个特定的基因,甚至与某种性状联系起来,这样,通过对某个分子标记的筛选即能对性状进行筛选,此即功能型分子标记。而目前广泛使用的基于PCR基础的分子标记如RAPD、SSR、AFLP等或是扩增非编码区域,或是随机在基因组中扩增,得到的位点一般与目标性状基因距离较远,这使得分子标记在应用上与其目标有一定的偏差。研究建立了一种基于基因中内含子序列的功能型分子标记,试图使标记位点与基因序列联系起来以达到其功能型的目的。它利用内含子剪接位置的保守一致序列作为其引物的核心序列,其上下游引物均为18bp,上下游引物间通过组合配对的方式作为扩增的引物对,对真核生物的基因序列进行扩增。为了验证ISAP的功能性,研究设计了17条引物(9条上游引物,8条下游引物,共计72个引物组合)对棉花F2群体进行扩增并构建遗传连锁图谱,其中67个显示了多态性,共得到212个位点。我们用此212个位点连同164个SRAP位点构建了一张包含276个位点的遗传连锁图谱,ISAP标记在整个连锁群中分布比较均匀,部分区域呈现标记高饱和现象,可能为编码序列富集区。另外对20个片段进行测序的结果表明,85%的序列显示了与已公布EST序列的同源性,说明扩增是跨越了外显子进行的,得到的序列与表达序列紧密连锁。结果显示,ISAP标记是简单,可靠,具有较高多态性,并且扩增基因区域的一种功能型分子标记。同时,还使用ISAP标记对其他植物进行了扩增,取得了良好的效果。
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关键词
ISAP
功能型分子标记
开发
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职称材料
亲缘关系相近的桃品种的RAPD分析
被引量:
18
2
作者
程中平
陈志伟
+2 位作者
胡春根
邓秀新
罗正荣
《湖北农业科学》
北大核心
2001年第3期41-43,共3页
对三组亲缘关系较近的品种 :砂子早生、砂激 2号 ;沪 0 2 1、沪 0 2 2、春蕾 ;1 2 1、银花露、白花、芒夏、朝霞、1 2 6 ;采用经过筛选的 2 2个 10碱基随机引物对其DNA扩增 ,通过RAPD带型分析 ,可得到鉴别。经聚类分析可知 ,来源于砂...
对三组亲缘关系较近的品种 :砂子早生、砂激 2号 ;沪 0 2 1、沪 0 2 2、春蕾 ;1 2 1、银花露、白花、芒夏、朝霞、1 2 6 ;采用经过筛选的 2 2个 10碱基随机引物对其DNA扩增 ,通过RAPD带型分析 ,可得到鉴别。经聚类分析可知 ,来源于砂子早生无性系的砂激 2号具有与亲本较高的遗传相似系数 。
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关键词
桃
亲缘关系相近品种
RAPD分析
遗传相似系数
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职称材料
甘蓝型油菜新品系的抗裂角性筛选与相关性状分析
被引量:
1
3
作者
王转茸
万丽丽
+4 位作者
杨光圣
孙玉宏
辛强
洪登峰
高红霞
《湖北农业科学》
2019年第24期34-37,42,共5页
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)的裂角落粒严重影响油菜的产量和机械适收性。利用改进后的随机碰撞法对122份甘蓝型油菜的自交系和杂交组合进行抗裂角性评价,发现抗裂角指数(Shatter resistant index,SRI)大于0.60的品系占4.1%。分析抗...
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)的裂角落粒严重影响油菜的产量和机械适收性。利用改进后的随机碰撞法对122份甘蓝型油菜的自交系和杂交组合进行抗裂角性评价,发现抗裂角指数(Shatter resistant index,SRI)大于0.60的品系占4.1%。分析抗裂角指数(SRI)与角果长、宽、果喙的相关性,发现抗裂角指数与角果长和果皮厚呈极显著正相关,且相关系数较高。结合种子的品质性状分析,共筛选了3份品质性状优良且抗裂角性强的甘蓝型油菜新品系早熟圣光168、E-7039和E-7089。
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关键词
甘蓝型油菜(Brassica
napus
L.)
抗裂角
种子
品质性状
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职称材料
题名
功能型分子标记(ISAP)的开发及评价
被引量:
48
1
作者
陆才瑞
喻树迅
于霁雯
范术丽
宋美珍
王武
马淑娟
机构
中国
农业
科学院棉花研究所
农业
部棉花
遗传
改良
重点
实验室
华中农业大学国家作物遗传改良重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第9期1207-1216,共10页
基金
国家重点基础研究项目(编号:2004CB117306)资助~~
文摘
分子标记在图谱构建,QTL分析,基因定位以及标记辅助育种中起着越来越重要的作用。研究者都期望一个分子标记位点代表一个特定的基因,甚至与某种性状联系起来,这样,通过对某个分子标记的筛选即能对性状进行筛选,此即功能型分子标记。而目前广泛使用的基于PCR基础的分子标记如RAPD、SSR、AFLP等或是扩增非编码区域,或是随机在基因组中扩增,得到的位点一般与目标性状基因距离较远,这使得分子标记在应用上与其目标有一定的偏差。研究建立了一种基于基因中内含子序列的功能型分子标记,试图使标记位点与基因序列联系起来以达到其功能型的目的。它利用内含子剪接位置的保守一致序列作为其引物的核心序列,其上下游引物均为18bp,上下游引物间通过组合配对的方式作为扩增的引物对,对真核生物的基因序列进行扩增。为了验证ISAP的功能性,研究设计了17条引物(9条上游引物,8条下游引物,共计72个引物组合)对棉花F2群体进行扩增并构建遗传连锁图谱,其中67个显示了多态性,共得到212个位点。我们用此212个位点连同164个SRAP位点构建了一张包含276个位点的遗传连锁图谱,ISAP标记在整个连锁群中分布比较均匀,部分区域呈现标记高饱和现象,可能为编码序列富集区。另外对20个片段进行测序的结果表明,85%的序列显示了与已公布EST序列的同源性,说明扩增是跨越了外显子进行的,得到的序列与表达序列紧密连锁。结果显示,ISAP标记是简单,可靠,具有较高多态性,并且扩增基因区域的一种功能型分子标记。同时,还使用ISAP标记对其他植物进行了扩增,取得了良好的效果。
关键词
ISAP
功能型分子标记
开发
Keywords
ISAP
functional molecular marker
development
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
亲缘关系相近的桃品种的RAPD分析
被引量:
18
2
作者
程中平
陈志伟
胡春根
邓秀新
罗正荣
机构
武汉市林业果树研究所
华中农业大学国家作物遗传改良重点实验室
出处
《湖北农业科学》
北大核心
2001年第3期41-43,共3页
基金
武汉市晨光计划
华中农业大学国家作物遗传改良重点实验室资助项目内容之一
文摘
对三组亲缘关系较近的品种 :砂子早生、砂激 2号 ;沪 0 2 1、沪 0 2 2、春蕾 ;1 2 1、银花露、白花、芒夏、朝霞、1 2 6 ;采用经过筛选的 2 2个 10碱基随机引物对其DNA扩增 ,通过RAPD带型分析 ,可得到鉴别。经聚类分析可知 ,来源于砂子早生无性系的砂激 2号具有与亲本较高的遗传相似系数 。
关键词
桃
亲缘关系相近品种
RAPD分析
遗传相似系数
Keywords
peach,relative cultivars,RAPD analysis
分类号
S662.1 [农业科学—果树学]
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
甘蓝型油菜新品系的抗裂角性筛选与相关性状分析
被引量:
1
3
作者
王转茸
万丽丽
杨光圣
孙玉宏
辛强
洪登峰
高红霞
机构
武汉市
农业
科学院
华中农业大学国家作物遗传改良重点实验室
出处
《湖北农业科学》
2019年第24期34-37,42,共5页
基金
中国博士后科学基金面上资助项目(2019M652726)
武汉市农业科学院2019年开放课题项目(KFKT201914)
武汉市农业科学院2018年博士后项目(Bshxm201801)
文摘
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)的裂角落粒严重影响油菜的产量和机械适收性。利用改进后的随机碰撞法对122份甘蓝型油菜的自交系和杂交组合进行抗裂角性评价,发现抗裂角指数(Shatter resistant index,SRI)大于0.60的品系占4.1%。分析抗裂角指数(SRI)与角果长、宽、果喙的相关性,发现抗裂角指数与角果长和果皮厚呈极显著正相关,且相关系数较高。结合种子的品质性状分析,共筛选了3份品质性状优良且抗裂角性强的甘蓝型油菜新品系早熟圣光168、E-7039和E-7089。
关键词
甘蓝型油菜(Brassica
napus
L.)
抗裂角
种子
品质性状
Keywords
Brassica napus L.
pod shatter resistant
seed
quality trait
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
功能型分子标记(ISAP)的开发及评价
陆才瑞
喻树迅
于霁雯
范术丽
宋美珍
王武
马淑娟
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2008
48
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
亲缘关系相近的桃品种的RAPD分析
程中平
陈志伟
胡春根
邓秀新
罗正荣
《湖北农业科学》
北大核心
2001
18
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
甘蓝型油菜新品系的抗裂角性筛选与相关性状分析
王转茸
万丽丽
杨光圣
孙玉宏
辛强
洪登峰
高红霞
《湖北农业科学》
2019
1
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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