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题名基于水稻种粒高光谱的品质性状预测方法
被引量：4
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作者
赵爽
宋京燕
陈国兴
宋鹏
冯慧
杨万能
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机构
华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室
华中农业大学信息学院/农业生物信息湖北省重点实验室
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出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期211-219,共9页
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基金
国家自然科学基金联合基金项目(U21A20205)
中央高校基本科研业务费专项(2662021JC008)。
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文摘
为探究作物种子品质性状无损检测方法,以100份水稻核心种质资源为试验材料,基于近红外高光谱相机采集水稻种粒的透射、反射光谱数据并提取光谱参数,水稻种粒脱壳后使用近红外谷物分析仪测定米粒品质;以水稻种粒光谱参数为自变量、米粒品质指标为因变量,建立米粒品质预测模型。结果显示,使用单一光谱建模时,透射光谱建模效果优于反射光谱建模效果;结合透射-反射特征光谱集合建模可使粗蛋白预测模型R2从0.74提高至0.91,可使直链淀粉预测模型R2从0.40提高至0.69,可使水分预测模型R2从0.53提高至0.68。结果表明,使用水稻种粒光谱参数可无损预测稻米品质,同时利用透射、反射光谱可提升建模效果。
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关键词
水稻
稻米品质
无损检测
高光谱
预测模型
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Keywords
rice
rice quality
nondestructive examination
hyperspectral
prediction model
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分类号
TP391.41
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
TS210.7
[轻工技术与工程—粮食、油脂及植物蛋白工程]
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题名基于全基因组SNP构建甘蓝型油菜指纹图谱
被引量：8
- 2
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作者
王升博
黄一鸣
梁聪园
王静
杨庆勇
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机构
华中农业大学信息学院/农业生物信息湖北省重点实验室
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出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期966-972,共7页
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基金
国家自然科学基金(32070559)
国家重点研发计划(2017YFE0104800)。
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文摘
甘蓝型油菜是世界上重要的油料作物,可用作油料、饲料以及食品等,具有较高的经济价值。为了高效快速地鉴定并区分油菜品种,加强油菜品种管理,本试验利用505份油菜种质的重测序数据进行SNP鉴定,根据杂合率、位点缺失率以及多态性等指标对SNP集合进行筛选,得到了能够高效鉴定油菜种质的核心SNP位点组合,构建了DNA指纹图谱。该套核心位点组合包括897个位点,其MAF、PIC的平均值分别为0.41、0.474。使用该套SNP位点组合进行品种区分,每两个材料之间的差异位点数目90%为357~508。对核心SNP位点进行精简,最少用17个SNP标记可完全鉴定该套种质。本研究使用高质量的油菜重测序数据,筛选出了897个核心SNP位点,并利用该套核心SNP组合构建了油菜的特征指纹图谱,为油菜遗传多样性分析、品种鉴定以及种质管理提供数据参考。
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关键词
甘蓝型油菜
群体基因组重测序
SNP
DNA指纹图谱
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Keywords
Brassica napus
whole-genome resequencing
SNP
DNA fingerprint
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分类号
S565.4
[农业科学—作物学]
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